Sauria SINEの挿入を指標としたヘビ類の起源解明

使用蜥蜴 SINE 的插入作为指标来阐明蛇的起源

基本信息

批准号：
06F06184
负责人：
岡田典弘
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究ではヘビとトカゲ類の系統関係を解析するにあたり、そのゲノムにおけるSINEに関して解析をおこなった。SINEとはゲノム中に散在する短い反復配列であり、その有無を様々な種の相同遺伝子座間で比較することにより、信頼性の非常に高い系統樹の再構築が可能であることが知られている。平成19年度はヘビ・トカゲ類のゲノム中に存在するレトロポゾンの一種であるSauria SINEの解析を中心に進めた。特にSINEが水平伝播を起こした可能性について研究し、Sauria SINEが爬虫類ゲノムからウイルスゲノムへ水平伝播を起こした証拠を発見した。このウイルスはヒトの天然痘ウイルスに類似したものであるが、これまで哺乳類以外に感染するといった報告例は知られていない。そのため本研究の水平伝播の証拠は、このウイルスが爬虫類にも感染し得るという可能性を示す結果となった。この成果は2007年に論文としてPNAS誌に掲載された。さらに現在では、爬虫類の中でも唯一ゲノムプロジェクトが進められているトカゲ(グリーンアノール)のゲノムデータを詳細に解析し、Sauria SINEのみならず様々なタイプ新規レトロポゾンを発見している。これらは将来おこなわれるであろう様々な爬虫類のゲノム解析において必要な情報となる。このグリーンアノールの成果は近い将来論文として発表する予定である。

在这项研究中，我们在分析蛇和蜥蜴的结构时分析了基因组中的正弦。正弦是一个散布在基因组中的短阵列，众所周知，可以通过比较相位诊所中各种物种的存在来重建非常高的可靠性。 2007年，我们专注于分析Sauria Sine，这是一种蛇和蜥蜴基因组中的复古Pozon。特别是，他研究了正弦引起水平传播的可能性，并发现了Sauria Sine引起从爬行动物基因组到病毒reNOM的水平传播的证据。该病毒类似于人类天花病毒，但尚未被哺乳动物除外。因此，这项研究中水平传播的证据表明该病毒可能被爬行动物感染的可能性。结果于2007年发表在PNAS杂志上。此外，蜥蜴（绿色ANOL）的基因组数据是唯一的爬行动物项目，已经进行了详细分析，不仅发现了Sauria Sine，而且还发现了各种新类型的新复古绒毛。这些是将来将在各种爬行动物基因组分析中进行的必要信息。绿色厌食的结果将在不久的将来发布。