膜タンパク質の高効率立体構造解析をめざした発現系作成から結晶化までのシステム構築

从表达系统创建到结晶的系统构建,用于高效膜蛋白三维结构分析

基本信息

  • 批准号:
    17681026
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 19.55万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

平成18年度は、平成17年度に引き続き原核生物の膜タンパク質を大腸菌を宿主として発現させる系について検討する一方で、新たに真核生物の膜タンパク質を酵母を宿主として発現させる系について検討した。原核生物の膜タンパク質については、好熱細菌Thermus thermophilusと好熱古細菌Aeropyrum pernix岳の膜タンパク質、各53個、計106個について、pBAD(araBADプロモーター、Invitrogen)とpET-Mistic(T7プロモーター、枯草菌Bacillus subtilis由来の4回膜貫通型膜タンパク質Mistic(Roosild et al.,2005)との融合タンパク質発現ベクター、Novagen製品を改変)とに組み込むことを計画したが、一部の膜タンパク質遺伝子のベクターへの導入に難航し、結局pBADベクターに27個の膜タンパク質遺伝子を組み込み、その発現確認実験を行った。その結果、Flagタグ抗体を用いたWestern blotで、27個のうち15個の膜タンパク質について発現が確認された。特に、複数の輸送体膜タンパク質の発現量が非常に高いことが示され、結晶化用試料の調製が可能になった。真核生物の膜タンパク質については、ヒト、カイコガ、線虫、シロイヌナズナ、酵母の膜タンパク質、約50個を対象とした。膜タンパク質発現量の確認を効率のよく行うため、[α-mating factorのシグナル配列]-[膜タンパク質]-[GFP]を酵母S.cerevisiaeで発現させるベクターを構築した。現在、上記真核生物の膜タンパク質の発現確認を進めている。
2006年,继2005年之后,我们研究了以大肠杆菌为宿主表达原核膜蛋白的系统,并且还研究了以酵母为宿主表达真核膜蛋白的新系统。关于原核生物的膜蛋白,pBAD(araBAD 启动子,Invitrogen)和 pET-Mistic(T7 启动子,枯草芽孢杆菌 Mistic,来自枯草芽孢杆菌的四次跨膜膜蛋白(Roosild 等,2014)。我们计划将融合蛋白表达载体整合到融合蛋白表达载体(改良的Novagen产品)中,但是很难将一些膜蛋白基因引入到载体中,最终我们将27个膜蛋白基因插入到pBAD载体中插入基因并进行实验以确认其表达。结果,使用 Flag 标签抗体的蛋白质印迹证实了 27 种膜蛋白中 15 种的表达。特别是,多种转运膜蛋白的表达水平极高,使得制备用于结晶的样品成为可能。关于真核膜蛋白,我们针对来自人类、蚕蛾、线虫、拟南芥和酵母的大约 50 种膜蛋白。为了有效确认膜蛋白的表达水平,我们构建了在酿酒酵母中表达[α-交配因子信号序列]-[膜蛋白]-[GFP]的载体。我们目前正在确认上述真核膜蛋白的表达。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Crystal structure of monomeric sarcosine oxidase from Bacillus sp. NS-129 revcals multiple conformations at the active-site loop.
芽孢杆菌属单体肌氨酸氧化酶的晶体结构。
Crystal structure of the short-chain flavin reductase HpaC from Sulfolobus tokodaii strain 7.
Sulfolobus tokodaii 菌株 7 的短链黄素还原酶 HpaC 的晶体结构。
Crystallization and preliminary X-ray analysis of PHI566, a putative ribosomal RNA processing factor from the hyperthermophilic archacon Pyrococcus horikoshii OT3.
PHI566 的结晶和初步 X 射线分析,PHI566 是一种来自超嗜热古菌 Pyrococcus horikoshii OT3 的假定核糖体 RNA 加工因子。
Crystallization and preliminary X-ray analysis of CTP : phosphoethanolamine cytidylyltransferase (ECT) from Saccharomyces cerevlslae.
CTP 的结晶和初步 X 射线分析:来自酿酒酵母的磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶 (ECT)。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Ohtsuta J.;Nagata;K.;Lee;W.C.;Ono;Y.;Fukuda;R.;Ohta;A.;Tanokura;M.
  • 通讯作者:
    M.
Solution structure and binding specificity of FBPII/HYPA WW domain as Group-II/III.
FBPII/HYPA WW 结构域作为 II/III 组的溶液结构和结合特异性。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kato;Y.;Hino;Y.;Nagata;K.;Tanokura;M.
  • 通讯作者:
    M.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

永田 宏次其他文献

新規 phosphoserine phosphatase の性状解析と生物内分布
新型磷酸丝氨酸磷酸酶的表征和生物分布
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    千葉 洋子;堀田 彰一朗;大塚 淳;新井 博之;永田 宏次;石井 正治;田之倉 優;五十嵐 泰夫
  • 通讯作者:
    五十嵐 泰夫
腸球菌のクォーラムセンシングを制御する環状ペプチドフェロモン(GBAP)の構造および機能解析
控制肠球菌群体感应的环肽信息素 (GBAP) 的结构和功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西口 賢三;永田 宏次;佐藤 まみ;田之 倉優;園元 謙二;中山 二郎
  • 通讯作者:
    中山 二郎
ポリフェノール修飾タンパク質によるヒストン結合を介した細胞保護作用
多酚修饰蛋白通过组蛋白结合的细胞保护作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山口 公輔;板倉 正典;北澤 麗磨;林 世映;永田 宏次;柴田 貴広;赤川 貢;内田 浩二
  • 通讯作者:
    内田 浩二
腸球菌のquorum sensing自己誘導ペプチド(GBAP)の構造-機能相関研究
肠球菌群体感应自诱导肽(GBAP)的结构与功能关系研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    西口 賢三;中山 二郎;永田 宏次;田之 倉優;園元 謙二
  • 通讯作者:
    園元 謙二
ポリフェノール修飾タンパク質の構造解析並びにヒストンとの相互作用メカニズムの解明
多酚修饰蛋白质的结构分析以及与组蛋白相互作用机制的阐明
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山口 公輔;板倉 正典;北澤 麗磨;林 世映;永田 宏次;柴田 貴広;赤川 貢;内田 浩二
  • 通讯作者:
    内田 浩二

永田 宏次的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('永田 宏次', 18)}}的其他基金

複数のジスルフィド結合を含む組換タンパク質の高効率巻き戻し系の確立と立体構造解析
含多个二硫键重组蛋白高效解旋体系的建立及三维结构分析
  • 批准号:
    14780470
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
  • 批准号:
    11142205
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
  • 批准号:
    10161203
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
阐明长期记忆相关转录因子CREB磷酸化活性调节的分子机制
  • 批准号:
    09780556
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンの立体構造解析と機能相関
家蚕前胸激素的结构分析及功能关系
  • 批准号:
    09265219
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
長期記憶に関わる転写因子CREBのリン酸化による活性制御の分子機構の解明
阐明长期记忆相关转录因子CREB磷酸化活性调节的分子机制
  • 批准号:
    08780571
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
カイコ前胸腺刺激ホルモンのNMRによる立体構造解析と機能相関
蚕前胸激素的NMR结构分析及功能相关性
  • 批准号:
    08276218
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

相似国自然基金

流动乳品体系中嗜热混合菌生物被膜的形成过程及机制研究
  • 批准号:
    32302027
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
嗜热脱氮地芽孢杆菌NG80-2厌氧解烃途径关键酶催化与调控机制研究
  • 批准号:
    32300099
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
深海超嗜热古菌Thermococcus单质硫还原途径调控机制的研究
  • 批准号:
    42376123
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    51 万元
  • 项目类别:
    面上项目
基于多组学策略解析嗜热耐碱沙雷氏菌AXJ-M对造纸黑液木质素的降解机制
  • 批准号:
    32360030
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    33 万元
  • 项目类别:
    地区科学基金项目
嗜热四膜虫甲基转移酶复合体MTA1c介导DNA 6mA甲基化的机理研究
  • 批准号:
    32301007
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

転写因子・酵素ドメイン融合タンパク質による酢酸応答機構の解明
通过转录因子/酶结构域融合蛋白阐明乙酸反应机制
  • 批准号:
    23K04986
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
in vivo定方向進化によるタンパク質耐熱化レパートリーの拡張 [転写調節因子への適用]
通过体内定向进化扩展蛋白质热稳定性库[在转录调节剂中的应用]
  • 批准号:
    23K18002
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Mechanisms of CRISPR-mediated immunity and applications beyond editing
CRISPR介导的免疫机制和编辑以外的应用
  • 批准号:
    10515419
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
Mechanisms of CRISPR-mediated immunity and applications beyond editing
CRISPR介导的免疫机制和编辑以外的应用
  • 批准号:
    10668518
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
Project 1: Structure, function, and inhibition of SEDS-family peptidoglycan polymerases
项目1:SEDS家族肽聚糖聚合酶的结构、功能和抑制
  • 批准号:
    10699954
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 19.55万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了