遺伝的アルゴリズムを用いた配置決定とその応用に関する研究

遗传算法的布局确定及其应用研究

基本信息

  • 批准号:
    16700201
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 2005
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の目的は、遺伝的アルゴリズム(GA)を用いた最適配置決定手法についての検討である。GAを用いた最適配置決定手法は様々な手法が提案されているが、提案手法では、交叉や突然変異によって致死遺伝子を発生することがなく、効率よく最適解を探索できるようなGA空間の構成方法等について検討を行い、新しいGAを用いた最適配置決定手法を確立することである。本年度は、以下の最適配置決定問題について検討を行った。1.方形ピースジグソーパズル問題2.ネットワークノード配置問題3.SBH(Sequencing By Hybridization)によるDNA配列決定問題1.および2.は、N×Mの最適配置を決定する問題であり、このような最適配置決定問題において、交叉や突然変異によって致死遺伝子を発生することがなく、効率よく最適解を探索するようなGAの提案を行った。また、他手法と比較することにより、提案手法の有効性を示すことができた。3.は、DNAチップより得られた部分塩基配列から、できるだけ多くの塩基部分が一致するように、部分配列の並びを計算する問題であり、各部分配列の最適な配置を決定する問題と置くことができる。このような最適配置決定問題においても、交叉によって致死遺伝子が発生することなく、効率よく探索できるようなGAを用いた新しい手法を提案し、実際のDNA配列を用いてシミュレーションを行った結果、従来提案されている手法よりも、よい結果を得ることができた。これらの成果は、学会発表および論文誌にて公表した。
本研究的目的是研究使用遗传算法(GA)的最佳放置确定方法。已经提出了各种使用 GA 确定最佳放置的方法,但所提出的方法不会因交叉或突变而产生致死基因,并配置 GA 空间,以便可以有效地搜索最佳解决方案。使用新的遗传算法建立最佳放置确定方法。今年,我们研究了以下最佳布局确定问题。 1. 方块拼图问题 2. 网络节点放置问题 3. SBH(杂交测序)DNA 测序问题 问题 1. 和 2. 是确定最佳 N×M 放置的问题 我们提出了一种有效搜索 N×M 放置的 GA。决策问题的最佳解决方案,不会因交叉或突变而产生致命基因。此外,我们能够通过与其他方法进行比较来证明所提出的方法的有效性。 3.是计算部分序列的排列以使尽可能多的碱基部分与从DNA芯片获得的部分碱基序列匹配的问题,并且这被认为是确定每个部分序列I的最佳排列的问题。能。我们提出了一种使用 GA 的新方法,可以有效地搜索最佳位置,而不会因交叉而产生致死基因,并使用实际 DNA 序列进行模拟,我们能够获得比所提出的方法更好的结果。这些结果发表在学术会议和期刊上。

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Image mosaicing from a set of images without configuration information
遺伝的アルゴリズムを用いた双方向マンハッタンストリートネットワークのノード配置
使用遗传算法的双向曼哈顿街道网络的节点放置
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