MGB技術を用いた造血器腫瘍における微小残存病変定量法の開発

开发利用 MGB 技术量化造血肿瘤微小残留病灶的方法

基本信息

  • 批准号:
    16790212
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 2006
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

(目的)我々は,造血器腫瘍において免疫受容体遺伝子の多様性を利用した,allele-specific oligonucleotide rea1-time quantitative PCR(ASO RQ-PCR)法によるMRDの定量的法を開発・実践してきた.本法では,多様な免疫受容体遺伝子の共通領域にconsensusprobeを設定することで,蛍光プローブの大幅なコストダウンに成功し,検査室レベルでの臨床応用を可能にした.しかし,(1)N-reionが数塩基と短い場合には偽性が生じる,(2)NHLではプローブの。に生じたmutationのためにconsensus probeを使えない場合がある,などの欠点があった.これらの理由で解析不可能な症例は,小児ALLで10%,悪性リンパ腫で30-40%であった.そこで当該研究課題では,これらの問題を解決するために,最近開発されたMBG(minor groove binder)技術を応用したプローブ・プライマーを用いることにした.(結果)1.ALL 114例の初診時骨髄単核球からDNAを抽出し,114中74例(64.9%)でIgH遺伝子を増幅し得た,B-NHL24例の初診断時リンパ節からDNAを抽出し,24例中14例(58.3%)でIgH遺伝子を増幅し得た.クローニングシークエンスを行い,塩基配列を決定した.2.データベースより10本のMGB-VHプローブを作製した.3.ALL 24例中5例はN-regionが数塩基と短かったことから従来のVHプローブ(21-27mer)が使用できなかったが,全例でMGB-VHプローブ(16-18mer)を使用し,RQ-PCR assayが可能となった(MGB-VHプローブ可能例100%vsVHプローブ可能例79%).4.B-NHL14例中4例ではプローブの領域に生じたmutationのために従来のVHプローブが使用できなかったが,9例でMGB-VHプローブを使用しRQ-PCR assayが可能となった(MGB-VHプローブ可能例64%vsVHプローブ可能例35%).5.MGB-VHプローブを作成したALL 24中18例およびB-NHL9例について治療後Day 15,Day 35,Day 100における骨髄から単核球からDNAを抽出し,従来法のASO RQ-PCR assayおよびMGB-ASO RQ-PCR assayを用いてMRDを比較した.6.ALL, B-NHLともにASO RQ-PCR assayおよびMGB-ASO RQ-PCR assayにおけるMRD値はほぼ同等であった.7.ALLにおいてはDay 15,Day 35,Day 100におけるMRDの陽性群,陰性群では無病生存率に有意な差がみられなかった.8.ALLにおいてはDay 15のMRD残存率(Day 15 MRDコピー数/Day 0 MRDコピー数×100)が1%以上群は1%未満群に比して有意に無病生存率が低いことが示された(74.7%vs100%).(考察)MBG技術を応用したMRD定量化システムは従来法のASORQ-PCR assayが不能であった症例もRQ-PCR1 assayが可能となり,効率的な臨床応用が可能であると考えられた.ALLにおいてはDay 15におけるMRD残存率を測定することで予後を予測可能であることが示された。
(目的)我们进行了等位基因特异性寡核苷酸实时定量PCR(ASO我们开发并实施了一种使用RQ-PCR方法的MRD定量方法。在该方法中,通过在各种免疫受体基因的共同区域设置共有探针,我们成功地显着降低了荧光探针的成本。然而,(1)如果N-reion短至几个碱基,就会出现错误;(2)在NHL中,很难使用探针。存在一些缺点,例如由于肿瘤中发生突变而无法使用共识探针。因此,儿童 ALL 中无法分析的病例为 10%,恶性淋巴瘤中为 30-40%。 ,在这个研究项目中,为了解决这些问题,我们决定使用应用最近开发的MBG(小沟结合剂)技术的探针和引物(结果)1.ALL。 114例初诊时骨髓单个核细胞提取DNA,114例中74例(64.9%)有IgH基因扩增。24例B初诊时淋巴结提取DNA。 -NHL病例中,24例能够扩增IgH基因初中1。我们能够扩增 4 例 (58.3%) 的 IgH 基因,并确定碱基序列 2. 我们从数据库中创建了 10 个 MGB-VH 探针。 24 例中的 5 例无法使用常规 VH 探针(21-27mer),因为 N 区较短,只有几个碱基;然而,所有情况都使用了 MGB-VH 探针(16-18mer),并且 RQ -PCR (可使用MGB-VH探针的病例为100%,可使用VH探针的病例为79%)然而,在9例中进行了使用MGB-VH探针的RQ-PCR。检测成为可能(MGB-VH 探针可行的病例为 64%,而 VH 探针可行的病例为 35%)。5.MGB-VH 探针为 24 例 ALL 病例中的 18 例和 9 例 B-病例制备。 NHL在治疗后第15天和第35天,从第100天的骨髓单核细胞中提取DNA,并进行常规ASO RQ-PCR测定和MGB-ASO RQ-PCR。 6. ALL 和 B-NHL 的 ASO RQ-PCR 测定和 MGB-ASO RQ-PCR 测定中的 MRD 值几乎相同。 7. ALL 第 15 天和第 35 天。第100.8天MRD阳性组和阴性组的无病生存率无显着差异。在ALL中,第15天的MRD生存率(第15天MRD拷贝数/天)与小于 1% 的组相比,0 MRD 拷贝数 x 100) 为 1% 或以上的组的无病生存率显着较低(74.7% vs 100%)。(讨论)MRD 定量使用MBG技术该系统在传统ASORQ-PCR检测无法进行的情况下启用了RQ-PCR1检测,并且认为高效的临床应用将是可能的。结果表明,可以通过测量15时的MRD残留率来预测预后。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Distinguishing between proliferating nodal lymphoid blasts in chronic myelogenous leukaemia and non-Hodgin lymphoma : A report of three cases and detection of a bcr/abl fusion signal by single cell analysis.
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yashima-Abo A;Satoh T;Abo T;Aoki Y;Kowata S;Ito S;Ishida Y;Funiiwara H;Maesawa C;Masuda T.
  • 通讯作者:
    Masuda T.
Aberrant maspin expression in gallbladder epithelium is associated with intestinal metaplasia in patients with cholelithiasis.
胆囊上皮中异常的 maspin 表达与胆石症患者的肠化生有关。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Maesawa C;Ogasawara S;Yashima-Abo A;Kimura T;Kotani K;Masuda S;Nagata Y;Iwaya T;Suzuki K;Oyake T;Akiyama Y;Kawamura H;Masuda T.
  • 通讯作者:
    Masuda T.
Consensus JH gene probes with conjugated 3'-minor groove binder for monitoring minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia.
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Uchiyama M;Maesawa C;Yashima-Abo A;Tarusawa M;Endo M;Sugawara W;Chida S;Onodera S;Tsukushi Y;Ishida Y;Tsuchiya S;Masuda T.
  • 通讯作者:
    Masuda T.
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  • 通讯作者:
    MORIOKA study研究グループ

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