散在性反復配列SINEの挿入を指標としたAfrotheria内部の系統解析

使用散布重复序列 SINE 的插入作为指标对非洲兽亚目进行系统发育分析

基本信息

批准号：
03J03484
负责人：
西原秀典
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J03484/
关键词：
Afrotheria SINE 系統学分子生物学

项目摘要

本研究の目的はSINE・LINEの挿入パターンを指標としたAfrotheria内部の系統解析である。Afrotheriaとはゾウ、海牛目(ジュゴン・マナティー)、ハイラックス、ツチブタ、テンレック、キンモグラ、ハネジネズミを含む哺乳類群であるが、それらの間の系統関係は未だに明確に示されていない。本研究ではSINEおよびLINEと呼ばれるゲノム中の散在性反復配列の挿入パターンを数多くの座位に関して比較することによってそれらの系統解析をおこなった。この解析法では従来の配列比較による系統解析と比べて信頼性が格段に高いため、分子系統学において有用な方法として注目されている。本研究において約30遺伝子座におけるSINEおよびLINEの挿入の有無を種間比較した結果、以下の4点が示された。(1)Afrotheriaの単系統性(2)Paenungulata(ゾウ、海牛類、ハイラックス)の単系統性(3)ツチブタ、テンレック、キンモグラ、ハネジネズミの単系統性(4)(3)の中でツチブタ、テンレック、キンモグラの単系統性さらに本研究において核遺伝子配列を詳細に解析した結果、Afrotheriaの中でもゾウ、海牛目、ハイラックスの三者が非常に短期間に種分化を起こしたことが示唆された。このような可能性はこれまでの古生物学的観点からはまったく提唱されておらず、哺乳類の進化系統学において非常に興味深い例を提唱したことになる。この成果は論文としてMolecular Biology and Evolution誌に現在投稿中である。

这项研究的目的是使用正弦和线的插入模式作为指标分析非疗法的内部系统。 Afrotheria是一个哺乳动物群，包括大象，海牛，Hilux，Tutillatum，Tutillatum，Tutillatum，Telek，Osmore和Spurt Rats，但它们之间的系统发育关系尚未清楚地显示。在这项研究中，我们通过将它们与许多基因座进行比较，对称为正弦和线的基因组中散射重复序列的插入模式进行了系统发育分析。这种分析方法比使用序列比较的常规系统发育分析要可靠得多，并且吸引了作为分子系统发育学中有用的方法。在这项研究中，比较了物种之间约30个基因座的正弦和线插入的存在或不存在，并显示了以下四个点。（1）Afrothotheria的单生（2）Paenungurata（大象，海牛，Hilux）（3）Tsutari，Tenrek，Osmole和角小鼠的单生（3）Tsutari，Tsutari，Tenrek，Tenrek和Osmole（3）的核序列（3）的Sequeence sequeence sequeed of Muit Gene，牛和希拉克斯在很短的时间内具有物种形成。从过去的古生物学角度来看，这种可能性尚未提出，它在哺乳动物的进化系统发育中提出了一个非常有趣的例子。目前，这一发现正在将分子生物学和进化作为论文提交。