マウス形態変異の修飾遺伝子のポジショナルクローニングによる遺伝子間相互作用の解析

通过小鼠形态变异修饰基因的位置克隆分析基因间相互作用

• 批准号: 13202063
• 负责人: 城石 俊彦
• 金额: $ 3.84万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202063/
• 关键词: 発生遺伝; 遺伝的多型; リボソーム; ポジショナルクローニング

マウス突然変異Tail short(Ts)は、異なった発生段階において体軸形成や神経管形成をはじめとする多面的な形態異常を示し、その原因遺伝子は形態形成に重要な役割を持つと考えられる。Tsの原因遺伝子はリボソーム構成タンパクの一つRpl38(ribosomal protein L38)をコードしているが、これがどのように形態形成に関与しているのかは明らかになっていない。これまでの遺伝解析により、Tsヘテロ個体の表現型を優性的に修飾する特定の遺伝子が存在することがわかっている。そこでTs修飾遺伝子の同定を目的とし、(A/JxC57BL/6J)F1の交配を基にした大規模な連鎖解析からTs修飾遺伝子をさらに詳細にマップした。この結果をBACコンティグと照らし合わせると、候補遺伝子はTs(Rpl38)遺伝子自身を含む領域120kbにあることがわかった。cDNA選択法と、BACのゲノム解析から、この領域内にはRpl38の他に幾つかの遺伝子が存在することが確認できている。これらの候補遺伝子についてコード領域の塩基配列の系統間での比較等を行ったが、遺伝子機能の違いにつながるような多型は発見されていない。今後、修飾遺伝子を特定するために、領域内のさらに詳細な多型解析を行うとともに、候補遺伝子について系統間での発現比較を行う。またトランスジェネシスによる修飾効果の変化を指標にして修飾遺伝子を決定したい。

小鼠短尾（Ts）突变体在不同发育阶段表现出多效性形态异常，包括体轴形成和神经管形成，并且致病基因被认为在形态发生中发挥重要作用。负责 Ts 的基因编码 Rpl38（核糖体蛋白 L38），核糖体组成蛋白之一，但尚不清楚它如何参与形态发生。迄今为止的遗传分析表明，存在显性改变 Ts 杂合个体表型的特定基因。因此，为了鉴定Ts修饰基因，我们通过基于(A/JxC57BL/6J)F1杂交的大规模连锁分析，更详细地定位了Ts修饰基因。将此结果与 BAC 重叠群进行比较，发现候选基因位于包含 Ts(Rpl38) 基因本身的 120 kb 区域。使用cDNA选择方法和BAC基因组分析，已证实该区域内存在Rpl38以外的几个基因。对菌株间这些候选基因编码区的核苷酸序列进行了比较，但没有发现导致基因功能差异的多态性。未来，为了鉴定修饰基因，我们将在该区域内进行更详细的多态性分析，并比较菌株间候选基因的表达情况。我们还希望以转基因引起的修饰效果的变化为指标来确定修饰基因。