マウスおよびヒトのインプリンティング領域の比較ゲノム解析

小鼠和人类印迹区域的比较基因组分析

基本信息

批准号：
00J09638
负责人：
岡村浩司
金额：
$ 1.92万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至 2002
项目状态：
已结题

项目摘要

哺乳類のインプリント遺伝子はしばしば染色体上でクラスターを構成し、ドメインとして独特な発現制御を受けると考えられているが、マウス第18番染色体には父性発現インプリント遺伝子Impactがマップされているのみで、クラスター構造を成しているかどうか明らかでない。全貌が見えつつあるマウスのゲノム情報を利用し、対応するヒトの領域と比較しながらImpact周辺遺伝子のアレル別発現解析を行った。インプリンティングを受けないヒトホモログIMPACTの下流には同じ向きに遺伝子HRH4、上流には逆向きにOSBPL1Aが存在する。これらの遺伝子は末梢血でも発現しており、SNPが見つかった前者1例、後者2例について調べたところ、両遺伝子とも両アレル性に発現していた。次にこれらのマウスホモログHrh4およびOsbpl1aを同定し、Impactの近傍遺伝子であることを確認してから発現解析を行ったところ、ヒト遺伝子と同じく両アレル性であることがわかった。ヒトOSBPL1Aに関しては、転写開始点が異なり、より長い転写産物であるOSBPL1Bが報告されており、このmRNAについてもマウスホモログOsbpl1bを単離し、アレル別発現解析を行った。その結果、マウスの遺伝子に関しては、多くの個体で父性アレルが母性アレルに対してやや優勢的に発現する傾向が認められた。プロモーター領域に存在するCpGアイランドは両アレルともに低メチル化状態であるため、基本的にOsbpl1bは両アレル性に発現する遺伝子であると思われるが、Impactプロモーター領域のアレルによるクロマチン構造の差違を反映して父性アレルの優勢発現傾向が観察されたと考えられる。孤立型インプリント遺伝子も距離によっては近傍遺伝子の発現に多少の影響を及ぼす可能性が示唆された。

据认为，哺乳动物的烙印基因通常由染色体上的簇组成，并以唯一的表达控制为域。使用可见的小鼠的基因组信息，在与相应人类进行比较时，进行了对撞击基因的细胞的分析。在没有受到影响的影响的下游中，有一些基因hrh4朝着相同的方向，上游的OSBPL1a朝相反的方向。这些基因也在外周血中表达，当发现SNP一个和两个病例时，两个基因在两个等位基因中均表达。接下来，确定了这些小鼠同源性HRH4和OSBPL1A，并确认它们是影响附近的，他们被分析了它们都是像人类基因一样的allelellelles。关于人OSBPL1A，转录起点是不同的，并且报道了较长的转录产物OSBPL1b，并且还分离了该mRNA的小鼠同源物OSBPL1B，Alellel分离的表达分析。结果，在许多个体中认识到小鼠基因表明父亲的基因将在某种程度上占主导地位。由于两个等位基因中的两个等位基因均为低甲基化，因此OSBPL1b似乎是在两个等位基因中表达的基因，但反映了由于影响启动子区域中等位基因而导致的染色质结构的差异。观察到了Allel。有人提出，根据距离，孤立的印迹基因可能会对附近基因的表达产生一定影响。