λファージCro蛋白質の2量体間S-S結合架橋変異体の立体構造解析

λ噬菌体Cro蛋白二聚体S-S键交联突变体的三维结构分析

基本信息

  • 批准号:
    07780574
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.64万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    1995
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1995 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

大腸菌バクテリオファージλ初期オペロンの遺伝子転写制御蛋白質であるCro蛋白質のVal55をCysに換えた点突然変異体の核磁気共鳴法(NMR)による構造解析を行った。このCroV55C変異体は(1)Cro蛋白質2量体の2つのサブユニット間にCys間のS-S結合が形成され、2つのサブユニットが架橋されていること、(2)野生型と比べて大きく熱安定化していること、(3)特異的DNA配列への結合能が数分の一に減少していること、などの性質を持つ。このCroV55C変異体についてCBCA(CO)NH,CBCANH,HNCO,HN(CA)CO,C(CO)NH,HBHA(CBCACO)NHなどの3重共鳴3次元NMRスペクトルの測定を行い、主鎖、側鎖のほぼ全ての^1H,^<15>N,^<13>C核の帰属を行った。またその過程で、蛋白質の^<15>N,^<13>C,^2Hによる同位体ラベルも行い、重水素ラベルと重水素デカップリングを利用してHN(CA)NH実験に大きな改良を施すことに成功した。この手法は分子量の大きな蛋白質の主鎖のシグナルの帰属に大変有用であると期待される。λCro蛋白質野生型のNMRシグナルの帰属は既に完了しているので、化学シフト値の比較をすることによって立体構造の差異を見積もったところ、野生型、V55C変異体間に立体構造の差異は殆ど無いことが示された。従って、サブユニット間のS-S結合は立体構造を換えないことが判った。
我们使用核磁共振(NMR)对点突变体进行了结构分析,其中Cro蛋白(大肠杆菌噬菌体λ早期操纵子的基因转录控制蛋白)的Val55被Cys取代。该CroV55C突变体表现出(1)Cro蛋白二聚体的两个亚基之间形成了Cys之间的S-S键,并且两个亚基发生交联;(3)与特定DNA序列的结合能力降低到了一小部分。它是什么。对于该 CroV55C 突变体,测量了三重共振 3D NMR 谱,例如 CBCA(CO)NH,CBC​​ANH,HNCO,HN(CA)CO,C(CO)NH,HBHA(CBCACO)NH 几乎所有 ^1H,^<15。 >N,^ 13 C链的核被指定。在此过程中,我们还用^15N、^13C、^2H对蛋白质进行了同位素标记,并通过使用氘标记和氘去耦极大地改进了HN(CA)NH实验。该方法预计对于归因大分子量蛋白质主链的信号非常有用。由于野生型λCro蛋白的NMR信号分配已经完成,我们通过比较化学位移值来估计3D结构的差异,发现野生型和V55C突变体之间的3D结构几乎没有差异。结果表明因此,发现亚基之间的S-S键不会改变三维结构。

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
白川昌宏: "The use of heteronuclear cross polarization for backbone assignment of 2H,15N and 13C-labeled proteins:A pulse scheme for triple resonance 4D correlation of sequential amide proton and nitrogen-15" Journal of biomolecular NMR. 5. 323-326 (1995)
Masahiro Shirakawa:“使用异核交叉极化进行 2H、15N 和 13C 标记蛋白质的主链分配:连续酰胺质子和氮 15 的三重共振 4D 关联的脉冲方案”《生物分子 NMR 杂志》5. 323-326。 (1995)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
森田勇人: "Structure of the Oct-3 POU-homeodomain in Solution,as Determined by Triple Resonance Heteronuclear Multidimensional NMR Spectroscopy." Protein Science. 4. 729-739 (1995)
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  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
田栄浩: "Solution Structure of the Activator Contact Domain of the RNA Polymerase a Subunit." Science. 270. 1495-1497 (1995)
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  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
松尾浩: "Backbone Dynamics of the λ-Cro Repressor Protein Determined by 15N Relaxation Measurements-Application of an Efficient Method for Calcuation of Dynamics Parameters." Journal of Molecular Spectroscopy. (印刷中).
Hiroshi Matsuo:“通过 15N 弛豫测量确定 λ-Cro 阻遏蛋白的骨架动力学 - 计算动力学参数的有效方法的应用”。分子光谱学杂志(正在出版)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
上垣浩一: "Secondary structure and folding topology of the DNA binding domain of interferon regulatory factor 2 as reveraled by NMR spectroscopy." FEBS letters. 359. 184-188 (1995)
Koichi Uegaki:“NMR 光谱显示干扰素调节因子 2 的 DNA 结合结构域的二级结构和折叠拓扑。”359. 184-188 (1995)
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  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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  • 通讯作者:
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知道了