Elucidation of the process of aggregation by creating an in vitro enzymatic reaction scaffold

通过创建体外酶反应支架来阐明聚集过程

基本信息

  • 批准号:
    22KJ3015
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.41万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2023
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2023-03-08 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の第一目的としていた「クロロフィル生合成過程に関わる酵素の反応機構の解明」については、既に達成することができた。生体外の酵素反応だけではなく、計算科学の分野も組み合わせることで、標的酵素の反応機構(アミノ酸残基を含めた)を分子レベルで解明することができた。これらの研究成果を取りまとめ、国内の学会で2件の発表を行うことができた。さらに、その研究内容を取りまとめた論文が査読付き国際学術誌に掲載された。本研究の第二目的としていた「酵素の制御機構(生合成酵素の基質特異性から推測する反応機構や2種類以上の酵素同士の関係性)を含む生理学の解明」に努めた結果、クロロフィル色素の生合成経路に関わる酵素の反応機構を分子レベルで推定でき、国内外の学会で2件の発表を行えただけでなく、その内容の論文が査読付き国際学術誌に掲載された。また、本研究で培った技術や知識に基づいて、様々な方向性へ研究展開を行った。その結果、新規のクロロフィル(誘導体)の合成と同定を達成することができた。さらに、多数の(非)天然クロロフィル色素の微量分析を行い、分析による同定プロファイルを作成することもできた。加えて、クロロフィル代謝過程で働く重要な酵素についても新たな知見を得ることができた。以上のそれぞれの研究内容について、共著者として国内の学会発表4件に貢献できた。また、それらの研究内容を取りまとめた論文が2報、査読付き国際学術誌に掲載された。
这项研究的第一个目标“阐明叶绿素生物合成过程中酶的反应机制”已经实现。通过结合体外酶促反应和计算科学领域,我们能够在分子水平上阐明目标酶的反应机制(包括氨基酸残基)。我们整理了这些研究成果,并在国内学术会议上做了两次报告。此外,一篇总结该研究的论文发表在同行评审的国际学术期刊上。本研究的第二个目标是“阐明包括酶控制机制在内的生理学(从生物合成酶的底物特异性以及两种或多种酶之间的关系推断出的反应机制)”。发现叶绿素色素,我们能够在分子水平上估计生物合成途径中涉及的酶的反应机制,不仅能够在国内和国际会议上做两次报告,我们的研究论文还发表在同行评审的期刊上国际学术期刊。此外,我们以通过本研究培养的技术和知识为基础,进行了各个方向的研究。结果,我们能够合成并鉴定出一种新的叶绿素(衍生物)。此外,我们能够对大量(非)天然叶绿素色素进行痕量分析并创建分析识别图谱。此外,我们还获得了有关叶绿素代谢过程中重要酶的新知识。作为合著者,我能够在国内会议上就上述每个研究主题发表四次演讲。此外,两篇总结该研究的论文发表在同行评审的国际学术期刊上。

项目成果

期刊论文数量(20)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Predicted Structure of the BciC Enzyme Catalyzing the Removal of the C132-Methoxycarbonyl Group for Biosynthesis of Chlorosomal Chlorophylls: A Mechanism for Dual Catalytic Functions of Hydrolysis and Decarboxylation inside Its Active Site
催化去除 C132-甲氧基羰基以进行叶绿素生物合成的 BciC 酶的预测结构:其活性位点内水解和脱羧双重催化功能的机制
  • DOI:
    10.1021/acs.biochem.2c00715
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Hirose Mitsuaki;Harada Jiro;Kashiyama Yuichiro;Tamiaki Hitoshi
  • 通讯作者:
    Tamiaki Hitoshi
3位または8位置換クロロフィル誘導体を用いた生体外でのSGR酵素反応とその基質特異性
使用3-或8-取代叶绿素衍生物的体外SGR酶反应及其底物特异性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    佐藤颯真;廣瀨光了;田中亮一;伊藤寿;民秋均
  • 通讯作者:
    民秋均
緑色硫黄細菌の色素合成経路ではたらくC132位メトキシカルボニル基脱離酵素BciCのAlphaFold2解析による構造解析と生化学的解析からの反応機構の検証
使用AlphaFold2分析绿硫细菌色素合成途径中作用的C132甲氧羰基消除酶BciC的结构,并从生化分析验证反应机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    廣瀨光了;原田二朗;柏山祐一郎;民秋均
  • 通讯作者:
    民秋均
Physico- and biochemical properties of synthetic zinc 131-(un)substituted chlorophyll-a derivatives
合成锌 131-(未)取代叶绿素-a 衍生物的物理和生化特性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mitsuaki Hirose;Jiro Harada;Hiroaki Maeda;Hitoshi Tamiaki
  • 通讯作者:
    Hitoshi Tamiaki
バクテリオクロロフィルc,d,e 分子の生合成経路で働くBciC 酵素反応機構の解明
阐明细菌叶绿素c、d、e分子生物合成途径中BciC酶反应机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    廣瀨 光了;原田 二朗;民秋 均
  • 通讯作者:
    民秋 均
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廣瀬 光了 (2022-2023)其他文献

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