Engineering antibody stability using molecular simulations and machine learning
使用分子模拟和机器学习工程抗体稳定性
基本信息
- 批准号：17K18113
- 负责人：
- 金额：$ 2.66万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- 财政年份：2017
- 资助国家：日本
- 起止时间：2017-04-01 至 2020-03-31
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
暂无数据
项目成果
期刊论文数量（15）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
MD法による抗HIV抗体PG16のCDR-H3の変異における中和能への影響の解析
MD法分析抗HIV抗体PG16的CDR-H3突变对中和能力的影响
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：桐林遼;近藤寛子;黒田大祐;齋藤徹;香田次郎;釘宮章光;中野靖久;鷹野優
- 通讯作者：鷹野優
Analysis of the denaturation midpoint to design the VHH with high thermal stability
变性中点分析设计高热稳定性VHH
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Emina Ikeuchi,Daisuke Kuroda;Makoto Nakakido;Maiko Yoshida;Narutoshi Tsukahara;Akikazu Murakami;Kouhei Tsumoto
- 通讯作者：Kouhei Tsumoto
コンピュータ技術を用いたタンパク質のモデリング計算とその応用
计算机技术的蛋白质建模计算及其应用
- DOI：
- 发表时间：2018
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：KAWADE;Raiji; AKIBA;Hiroki; NAKAKIDO;Makoto; KURODA;Daisuke; MARUYAMA;Toshiaki; OKUMURA;Shigeru; ENTZMINGER;Kevin; CAAVEIRO;Jose; TSUMOTO;Kouhei;黒田大祐
- 通讯作者：黒田大祐
Intramolecular H-bonds govern the recognition of a flexible peptide by an antibody
- DOI：10.1093/jb/mvy032
- 发表时间：2018-07-01
- 期刊：
- 影响因子：2.7
- 作者：Miyanabe, Kazuhiro;Akiba, Hiroki;Tsumoto, Kouhei
- 通讯作者：Tsumoto, Kouhei
抗原配列の硫酸化が抗体との相互作用に与える影響の熱力学的解析
抗原序列硫酸化对与抗体相互作用影响的热力学分析
- DOI：
- 发表时间：2017
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：宮鍋 一紘;秋葉 宏樹;カアベイロ ホセ;黒田 大祐;中木戸 誠;高松 祐一郎;山下 雄史;津本 浩平
- 通讯作者：津本 浩平
共 12 条
- 1
- 2
- 3
Kuroda Daisuke其他文献
高速回転球殻内の熱対流により引き起こされる表面縞状構造への超粘性の影響
超粘性对快速旋转球壳中热对流引起的表面条纹的影响
- DOI：
- 发表时间：20222022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Hasegawa Sunao;Kasuga Toshihiro;Usui Fumihiko;Kuroda Daisuke;佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介Hasegawa Sunao;Kasuga Toshihiro;Usui Fumihiko;Kuroda Daisuke;佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介
- 通讯作者：佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介
Oligo(N‐methylalanine) as a Peptide‐Based Molecular Scaffold with a Minimal Structure and High Density of Functionalizable Sites
寡聚（N-甲基丙氨酸）作为基于肽的分子支架，具有最小的结构和高密度的功能位点
- DOI：10.1002/anie.20220011910.1002/anie.202200119
- 发表时间：20222022
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Yokomine Marin;Morimoto Jumpei;Fukuda Yasuhiro;Shiratori Yota;Kuroda Daisuke;Ueda Takumi;Takeuchi Koh;Tsumoto Kouhei;Sando ShinsukeYokomine Marin;Morimoto Jumpei;Fukuda Yasuhiro;Shiratori Yota;Kuroda Daisuke;Ueda Takumi;Takeuchi Koh;Tsumoto Kouhei;Sando Shinsuke
- 通讯作者：Sando ShinsukeSando Shinsuke
Cold Atoms and Molecules
冷原子和分子
- DOI：
- 发表时间：20202020
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Geem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi KajitaGeem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi Kajita
- 通讯作者：Masatoshi KajitaMasatoshi Kajita
How the protonation state of a phosphorylated amino acid governs molecular recognition: insights from classical molecular dynamics simulations
磷酸化氨基酸的质子化状态如何控制分子识别：经典分子动力学模拟的见解
- DOI：10.1002/1873-3468.1367410.1002/1873-3468.13674
- 发表时间：20192019
- 期刊：
- 影响因子：3.5
- 作者：Kawade Raiji;Kuroda Daisuke;Tsumoto KouheiKawade Raiji;Kuroda Daisuke;Tsumoto Kouhei
- 通讯作者：Tsumoto KouheiTsumoto Kouhei
Polarimetric properties of the near-Sun asteroid (155140) 2005 UD in comparison with other asteroids and meteoritic samples
近太阳小行星 (155140) 2005 UD 的偏振特性与其他小行星和陨石样本的比较
- DOI：10.1093/mnras/stab319810.1093/mnras/stab3198
- 发表时间：20212021
- 期刊：
- 影响因子：4.8
- 作者：Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P;Geem Jooyeon;Naito Hiroyuki;Kuroda Daisuke;Im Myungshin;Lee Myung Gyoon;Seo Jinguk;Jin Sunho;Kwon Yuna G;Oono Tatsuharu;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Kuramoto Kiyoshi;Ito Takashi;Hasegawa Sunao;Yoshida Fumi;他12名Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P;Geem Jooyeon;Naito Hiroyuki;Kuroda Daisuke;Im Myungshin;Lee Myung Gyoon;Seo Jinguk;Jin Sunho;Kwon Yuna G;Oono Tatsuharu;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Kuramoto Kiyoshi;Ito Takashi;Hasegawa Sunao;Yoshida Fumi;他12名
- 通讯作者：他12名他12名
共 21 条
- 1
- 2
- 3
- 4
- 5
Kuroda Daisuke的其他基金
Molecular design of real proteins in virtual space
虚拟空间中真实蛋白质的分子设计
- 批准号：19H0420219H04202
- 财政年份：2019
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of antibody modeling methods toward rational antibody design
开发抗体建模方法以实现合理的抗体设计
- 批准号：15H0660615H06606
- 财政年份：2015
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Research Activity Start-upGrant-in-Aid for Research Activity Start-up
相似海外基金
Molecular design of real proteins in virtual space
虚拟空间中真实蛋白质的分子设计
- 批准号：19H0420219H04202
- 财政年份：2019
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Selective and stable protein complex assembly by thermodynamic control of domain swapping
通过结构域交换的热力学控制选择性且稳定的蛋白质复合物组装
- 批准号：19K0569519K05695
- 财政年份：2019
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of surface modification technology using a bacterial adhesive protein
使用细菌粘附蛋白的表面改性技术的开发
- 批准号：17H0134517H01345
- 财政年份：2017
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (A)Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Implementation of massive parallel Evolutionaly Computation from Biological experiment data analysis obtained by wetGA
利用wetGA获得的生物实验数据分析实现大规模并行进化计算
- 批准号：2628009526280095
- 财政年份：2014
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development of the concept for structure-aided rational design of bright fluorescent protein
亮荧光蛋白结构辅助合理设计概念的发展
- 批准号：2168700721687007
- 财政年份：2009
- 资助金额：$ 2.66万$ 2.66万
- 项目类别：Grant-in-Aid for Young Scientists (A)Grant-in-Aid for Young Scientists (A)