転座型白血病のDNAチップを用いた分子機構の解析

DNA芯片分析易位白血病的分子机制

• 批准号: 15023214
• 负责人: 林 泰秀
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15023214/
• 关键词: 遺伝子; ゲノム; バイオテクノロジー; マイクロアレイ; 癌

転座型白血病細胞の新規転座関連遺伝子を単離して、その遺伝子の発生と分化における役割およびキメラ遺伝子の標的遺伝子を検索した。我々はこれまで11q23転座型白血病のMLL遺伝子の相手遺伝子をCBP, P300,ABI1,AF5q31など8種単離した。今年度は転座型急性リンパ性白血病(ALL)の新鮮検体を用いて、転座の相手による発現の相違をDNAChipを用いて検索した。t(4;11)15検体、t(11,19)6検体、t(5;11)2検体および対照としてt(12;21)6検体、t(1;19)3検体をAffymetrix社のDNA Chip(12,600個)により発現プロファイルの解析を行った。t(4;11)とt(11;19)の両方に共通して発現がみられる遺伝子がFLT3,HOXA9,HOXA10等50種にみられた。MLL再構成のある21検体中予後による発現パターンの相違がみられ(P=0.01)、転写因子のCBF2遺伝子が予後良好群で、CDP遺伝子が予後不良群で高発現を示した。また21例で共通して発現が高かったFLT3遺伝子の変異を調べたところ、乳児ALL 44例中8例(18%)で変異がみられた。また小児ALL 112例では、高2倍体ALL 19例中4例(21.5%)に変異がみられたが、TEL-AML1、E2A-PBX1、BCR-ABL例では変異はみられなかった。これらの遺伝子の発現を定量reverse transcriptase(RT)-PCRでチェックしたところ、ほぼアレイの発現と一致していた。これらの遺伝子を詳細に検討し、共通する下流遺伝子をしぼる作業を進めている。現在、昨年単離したMLL-SEPT6融合cDNAを導入した細胞をマウスに移植し、増殖や造腫瘍性の検討も行っている。

我们在易位型白血病细胞中分离出一种新的易位相关基因，并寻找其在发育和分化中的作用，以及嵌合基因的靶基因。迄今为止，我们已经分离出8个与11q23易位白血病MLL基因相关的基因，包括CBP、P300、ABI1和AF5q31。今年，我们使用 DNAChip 来寻找易位伴侣的表达差异，使用易位急性淋巴细胞白血病 (ALL) 的新鲜标本。 t(4;11) 的 15 个样本、t(11,19) 的 6 个样本、t(5;11) 的 2 个样本、t(12;21) 的 6 个样本和 t(1;19) 的 3 个样本Affymetrix 用作对照，使用 DNA 芯片（12,600 个）分析表达谱。发现 50 个基因（包括 FLT3、HOXA9 和 HOXA10）在 t(4;11) 和 t(11;19) 中普遍表达。在21个MLL重排样本中，不同预后的表达模式存在差异（P=0.01），转录因子CBF2基因在预后良好组中高表达，CDP基因在预后不良组中高表达。此外，当我们调查 FLT3 基因（该基因在 21 例病例中普遍表达）的突变时，在 44 名婴儿 ALL 病例中发现了 8 名突变（18%）。此外，在 112 例儿童 ALL 病例中，19 例超二倍体 ALL 病例中有 4 例（21.5%）观察到突变，但在 TEL-AML1、E2A-PBX1 或 BCR-ABL 病例中未观察到突变。当通过定量逆转录酶（RT）-PCR检查这些基因的表达时，表达几乎与芯片的表达相匹配。我们目前正在详细研究这些基因并缩小常见下游基因的范围。目前，导入去年分离的MLL-SEPT6融合cDNA的细胞正在被移植到小鼠体内，并正在研究其增殖和致瘤性。

项目成果

Xu G: "Frequent mutations in the GATA-1 gene in the transient myeloproliferative disorder of Down syndrome."Blood. 102・8. 2960-2968 (2003)

Xu G：“唐氏综合症短暂性骨髓增生性疾病中 GATA-1 基因的频繁突变”，Blood 102・8 2960-2968（2003）。

Hiwatari M: "Fusion of an AF4-related gene, LAF4, to MLL in childhood acute lymphoblastic leukemia with t(2;11)(q11;q23)."Oncogene. 22・18. 2851-2855 (2003)

Hiwatari M：“儿童急性淋巴细胞白血病中 AF4 相关基因 LAF4 与 t(2;11)(q11;q23) 的融合。”Oncogene 22・18 (2003)。

Echlin-Bell DR: "Polymorphisms in the MLL breakpoint cluster region (BCR)."Hum Genet. 113・1. 80-91 (2003)

Echlin-Bell DR：“MLL 断点簇区域（BCR）中的多态性”。Hum Genet，113・1（2003）。

Terui, K: "Successful treatment of acute myelomonocytic leukaemia with NUP98-HOXDII fusion transcripts and monitoring of minimal residual disease."Br.J.Haematol. 120・2. 274-276 (2003)

Terui, K：“利用 NUP98-HOXDII 融合转录本成功治疗急性粒单核细胞白血病并监测微小残留病。”Br.J.Haematol 120・2 (2003)。

Obana K: "Aberrations of p16LNK4A, p14ARF and p15INK4B genes in pediatric solid tumors."Int J Oncol.. 23・4. 11511-11577 (2003)

Obana K：“儿科实体瘤中 p16LNK4A、p14ARF 和 p15INK4B 基因的畸变。”Int J Oncol.. 23・4（2003）。