NMRによる蛋白質構造の協調的内部運動と機能制御相関解析

使用 NMR 进行蛋白质结构的协同内部运动和功能控制相关性分析

基本信息

批准号：
20050022
负责人：
楯真一
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Hiroshima University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度は,以下の研究成果を得た.1. DHFRループ変異体の内部運動性解析初年度に引き続いてG67A,G67V変異体の内部運動性の解析をすすめた.本年度は,野生体とG67V,G67A変異体により誘導される内部運動性変化の再現性を含めた実験精度の検証を行うと同時に,内部運動速度の分布を精密に解析した.その結果,活性変調が観測されたG67Vでは,内部運動速度は750sec^<-1>を中心に分布しているが,活性変化の小さいG67Aと野生体は500sec^<-1>を中心とした速度分布を持っている.また,揺らぎを持つ構造部も,G67VはG67Aおよび野生体と異なっていることが分かった.構造揺らぎの速度・構造上の分布の違いが活性変調と関係することが示唆された.2. ストップドフローを用いたDHFR変異体の反応速度変化G67V変異体のkcatの低下がどのような反応ステップの変調によるかを解析した.その結果,hydride transfer速度は約20%低下していることが分かった,観測されたkcat変化の全てがhydride transfer過程の低下により説明されるものではないが,構造揺らぎの変化がhydride transfer過程にも影響を与えることを明らかにした.

在这个财政年度，进行了以下研究结果，包括G67A突变体引起的内部运动变化的可重复性，同时进行了内部运动速度的分布观察到的g67v的结果是分布在750秒^<-1>左右的结果，但是具有较小活动的G67a，野生体的速度分布为500秒^<-1>。该部分还发现，G67V与G67a和野生体有所不同结果分析了由于突变体引起的KCAT的速度。由于氢化物转移过程的减少而解释了，但已经表明结构波动的变化也会影响氢化物转移过程。

项目成果

期刊论文数量（27）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Protein adaptation to high-pressure environments. in Protein Adaptation in Extremophiles., in : Protein Adaptation in Extremophiles. Molecular Anatomy and Physiology of proteins series (Eds. Thomas, T. and Siddiqui, K. S.)

蛋白质适应高压环境。

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
C. Kato;T. Sato;F. Abe;E. Ohmae;H. Tamegai;K. Nakasone;K. Siddiqui;and T. Thomas
通讯作者：
and T. Thomas

酸化LDL受容体蛋白質LOX-1の構造機能特性と本来の役割

氧化型LDL受体蛋白LOX-1的结构功能特征及原始作用

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
西脇匡崇;山根慶典;白旗崇;宮本久一;御崎洋二;楯真一
通讯作者：
楯真一

Protein structural dynamics and function relationships revealed by NMR spectroscopy

核磁共振波谱揭示蛋白质结构动力学和功能关系

DOI：
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tokutsu;R.;Iwai;M. and Minagawa;J.;石川直子;Shin-ichi Tate
通讯作者：
Shin-ichi Tate

異方性核スピン相互作用を利用する新規NMR技術による超高分子量タンパク質の分子形態観測

使用利用各向异性核自旋相互作用的新 NMR 技术观察超高分子量蛋白质的分子形态

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
T.Matsuo;K.Onai;K.Okamoto;J.Minagawa;M.Ishiura;井上和秀;楯真一
通讯作者：
楯真一

Coupling effects of distal loops on structural stability and enzymatic activity of Escherichia coli dihydrofolate reductase revealed by deletion mutants

DOI：
10.1016/j.bbapap.2009.12.011
发表时间：
2010-04-01
期刊：
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS
影响因子：
3.2
作者：
Horiuchi, Yuji;Ohmae, Eiji;Gekko, Kunihiko
通讯作者：
Gekko, Kunihiko

DOI：
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楯真一

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通讯作者：
楯　真一

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作者：
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通讯作者：
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发表时间：
2017
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0
作者：
栃尾尚哉;川嵜亮祐;青木大将;梅原康平;吉村優一;上脇隼一;Holger Flechsig;冨樫祐一;楯真一;冨樫祐一;Holger Flechsig;冨樫祐一;Yuichi Togashi;冨樫祐一;Holger Flechsig
通讯作者：
Holger Flechsig