CNRカドヘリン分子群の機能と系統進化の解析

CNR-cadherin分子的功能和系统发育分析

基本信息

批准号：
16027263
负责人：
先崎浩次
金额：
$ 3.84万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

脊椎動物系統進化の過程でのCNR分子群の機能を明らかにするにあたり、ゼブラフィッシュCNRのゲノム構造解析を行った。マウスCNR遺伝子の共通領域をプローブとしてゼブラフィッシュcDNAライブラリーからゼブラフィッシュCNR(z34)を単離し、このゼブラフィッシュCNRをプローブとしてゼブラフィッシュBAC(Bacterial Artificial Chromosome)ゲノムライブラリーからゼブラフィッシュCNRゲノム領域を含むBACクローンを得た。ショットガンシークエンス法によりBACクローンの全遺伝子配列の同定を行いゼブラフィッシュCNRのゲノム構造を明らかにした。同時にゼブラフィッシュゲノム解析を行っていた他のグループによりゼブラフィッシュCNRのゲノム構造を明らかにしたとの報告がなされ、比較の結果、私たちが解析していたゼブラフィッシュCNRゲノム構造が含まれていない解析結果であった。そこで、ゼブラフィッシュゲノム解析の結果と私たちが解析したゼブラフィッシュCNRゲノム構造解析の結果をまとめ報告した。マウスやヒトのCNRゲノム構造とゼブラフィッシュのゲノム構造を比較解析した結果、マウスやヒトと比べゼブラフィッシュではCNR分子の数が増え、さらに複雑なゲノム構造を形成していた。また、ゼブラフィッシュCNR遺伝子はマウスやヒトにはないアイソフォームが存在することが明らかにされた。これらのことからゼブラフィッシュにおいてはマウスやヒトと異なるCNR分子の機能が想定される。

在阐明CNR分子基在脊椎动物系统演化过程中的功能时，进行了斑马鱼CNR的基因组结构分析。斑马鱼CNR（Z34）从小鼠CNR基因的公共区域分离为探针作为探针，作为CNR基因组区域。通过shot弹枪序列法鉴定了BAC克隆的吉仪半肌，并揭示了斑马鱼CNR的基因组结构。同时，据报道，进行斑马鱼基因组分析的其他组揭示了斑马鱼CNR的基因组结构，并且由于比较，它不包括斑马鱼CNR基因组结构分析结果。因此，我们报告了斑马鱼基因组分析的结果以及我们分析的斑马鱼CNR基因组结构分析的结果。与小鼠和人类相比，斑马鱼中的小鼠和人CNR基因组结构和斑马鱼基因组结构的比较和分析，CNR分子的数量增加，并且形成了更复杂的基因组结构。还揭示了斑马鱼CNR基因在小鼠和人类中找不到同工型。从这些事实来看，在斑马鱼中假定CNR分子与小鼠和人类不同的功能。