C型肝炎ウイルスワクチン開発のためのCD81の構造生物学的研究

CD81用于丙型肝炎病毒疫苗开发的结构生物学研究

基本信息

  • 批准号:
    14021052
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

C型肝炎は世界の人口の約3%にあたる1億7千人もの人々に感染するウイルス性の病気であリ、肝臓における主たる病気となっている。C型肝炎ウイルス(HCV)の存在は以前より知られているが、その感染や発症のメカニズムついてはよく理解されていない。PileriらはHCVのエンベロープ蛋白質(E2)がヒトの細胞表面抗原レセプターであるCD81分子の細胞外ドメイン(LEL)に結合することを見出した。CD81分子は236個のアミノ酸からなる4回膜貫通型の膜蛋白質であり、2つの細胞外領域(LEL ; Large Extracellular LooP,およびSEL ; Small Extracellular Loop)と3つの細胞内ドメインおよび4つの膜貫通疎水性領域から形成されている。CD81のLEL/SEL複合体結晶については、SELの共存下でLELの結晶化スクリーニングの信果、MPDを沈殿剤とした場合に、以前得られた2種類のLEL結晶とは全く晶系の異なる結晶が得られた。これを用いてSpring-8にて2.0Å分解能のX線回折データを収集した。この結晶は、晶系がRhombohedralに属し、a=b=61.4,c=144.2Åであり、2.0Å分解能までのデータで、Rsymが6.2%,Completenessが99.5%であった。この強度データを基に、LEL部分のモデル座標を用いて分子置換法により、立体構造決定を行った。その結果、SEL部分であると考えられる30残基のアミノ酸に相当する電子密度がはっきりと得られており、現在、この電子密度部分に対してモデルビルディングを行っている。CD81-LELは5つのα-ヘリックス(A-E)からなり、2量体の形成に関与するStalkサブドメイン(A,B,Eヘリックス)とHCVの結合に関与するHeadサブドメイン(C,D)からなる。SEL部分と考えられる電子密度部分は、C,Dヘリックスに対して垂直な位置に存在してLELと相互作用し、またE-ヘリックスの一部とも相互作用していた。この際、HCVの結合に必須であるPhe186残基は、SELとは結合せず溶媒側に突出して存在し、結晶内で他の対称な分子とパッキングしていた。従って、SEL/LEL複合体の立体構造からも、このPhe186残暮のHCVに結合する重要な部位であると考察できる。
丙型肝炎是一种病毒性疾病,感染 17 万人,约占世界人口的 3%,是一种主要的肝脏疾病。尽管丙型肝炎病毒(HCV)的存在早已为人所知,但其感染和发病机制尚不清楚。 Pileri 等人发现 HCV 包膜蛋白 (E2) 与人类细胞表面抗原受体 CD81 分子的胞外结构域 (LEL) 结合。 CD81分子是由236个氨基酸组成的四跨膜蛋白,由两个胞外区(LEL;大胞外环和SEL;小胞外环)、三个胞内结构域和四个跨膜结构域组成。地区。对于CD81的LEL/SEL复合晶体,在SEL共存下对LEL进行结晶筛选的结果,当使用MPD作为沉淀剂时,该晶体体系与之前获得的两种类型的LEL晶体完全不同。获得。利用这一点,我们在 Spring-8 上收集了 2.0 Å 分辨率的 X 射线衍射数据。该晶体的晶系属于菱面体,a=b=61.4,c=144.2 Å,2.0 Å分辨率下的数据显示Rsym为6.2%,完整性为99.5%。基于该强度数据,使用LEL部分的模型坐标通过分子置换法确定三维结构。结果,明确获得了与被认为是SEL区域的30个氨基酸残基相对应的电子密度,并且目前正在对该电子密度区域进行模型构建。 CD81-LEL由五个α-螺旋(A-E)组成,由参与二聚体形成的茎亚结构域(A、B、E螺旋)和参与HCV结合的头亚结构域(C、D)组成。电子密集区域被认为是 SEL 区域,垂直于 C 和 D 螺旋存在,并与 LEL 以及部分 E 螺旋相互作用。此时,HCV结合所必需的Phe186残基不与SEL结合,而是向溶剂侧突出,并与晶体内的其他对称分子堆积在一起。因此,从SEL/LEL复合物的三维结构来看,可以认为这个Phe186残基是与HCV结合的重要位点。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kitadokoro K.: "Subunit association and conformational flexibility in the head subdomain of human CD81 large extracellular loop"Biol. Chem.. 9. 1447-1452 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环头部子域的亚基关联和构象灵活性”Biol。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kitadokoro K.: "X-ray structural analysis of the tetraspanin CD81 long extracellular loop complex with small loop"Spring-8 User Experiment Report. 9. 174-174 (2002)
Kitadokoro K.:“四跨膜蛋白 CD81 长细胞外环复合物与小环的 X 射线结构分析”Spring-8 用户实验报告。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の構造生物学"京都大学低温物質科学研究センター誌. (2003)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体CD81的结构生物学”京都大学低温材料科学研究中心期刊(2003)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の細胞外ドメインの立体構造"生物物理学会誌. 240. 75-78 (2002)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体 CD81 胞外结构域的三级结构”,《生物物理学会杂志》240. 75-78 (2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kitadokoro K.: "Structural flexibility of human CD81 large extracellular loop.a receptor for HCV envelope E2 glycoprotein"第2回あわじしま感染症・免疫フォーラム講演予稿集. 平成14年. 001-001 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环的结构灵活性。HCV 包膜 E2 糖蛋白的受体”2002 年第二届淡路岛传染病和免疫学论坛论文集。001-001 (2002)。
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