C型肝炎ウイルスワクチン開発のためのCD81の構造生物学的研究

CD81用于丙型肝炎病毒疫苗开发的结构生物学研究

基本信息

  • 批准号:
    14021052
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

C型肝炎は世界の人口の約3%にあたる1億7千人もの人々に感染するウイルス性の病気であリ、肝臓における主たる病気となっている。C型肝炎ウイルス(HCV)の存在は以前より知られているが、その感染や発症のメカニズムついてはよく理解されていない。PileriらはHCVのエンベロープ蛋白質(E2)がヒトの細胞表面抗原レセプターであるCD81分子の細胞外ドメイン(LEL)に結合することを見出した。CD81分子は236個のアミノ酸からなる4回膜貫通型の膜蛋白質であり、2つの細胞外領域(LEL ; Large Extracellular LooP,およびSEL ; Small Extracellular Loop)と3つの細胞内ドメインおよび4つの膜貫通疎水性領域から形成されている。CD81のLEL/SEL複合体結晶については、SELの共存下でLELの結晶化スクリーニングの信果、MPDを沈殿剤とした場合に、以前得られた2種類のLEL結晶とは全く晶系の異なる結晶が得られた。これを用いてSpring-8にて2.0Å分解能のX線回折データを収集した。この結晶は、晶系がRhombohedralに属し、a=b=61.4,c=144.2Åであり、2.0Å分解能までのデータで、Rsymが6.2%,Completenessが99.5%であった。この強度データを基に、LEL部分のモデル座標を用いて分子置換法により、立体構造決定を行った。その結果、SEL部分であると考えられる30残基のアミノ酸に相当する電子密度がはっきりと得られており、現在、この電子密度部分に対してモデルビルディングを行っている。CD81-LELは5つのα-ヘリックス(A-E)からなり、2量体の形成に関与するStalkサブドメイン(A,B,Eヘリックス)とHCVの結合に関与するHeadサブドメイン(C,D)からなる。SEL部分と考えられる電子密度部分は、C,Dヘリックスに対して垂直な位置に存在してLELと相互作用し、またE-ヘリックスの一部とも相互作用していた。この際、HCVの結合に必須であるPhe186残基は、SELとは結合せず溶媒側に突出して存在し、結晶内で他の対称な分子とパッキングしていた。従って、SEL/LEL複合体の立体構造からも、このPhe186残暮のHCVに結合する重要な部位であると考察できる。
丙型肝炎是一种病毒疾病,感染了17万人,约占世界人口的3%,是肝脏的主要疾病。丙型肝炎病毒(HCV)的存在已有一段时间了,但是感染和发育的机制尚不清楚。 Pileri等。发现HCV(E2)的包膜蛋白与人细胞表面抗原受体CD81分子的细胞外结构域(LEL)结合。 CD81分子是由236个氨基酸组成的四跨膜膜蛋白,由两个细胞外区域(LEL;大细胞外环;和SEL;小细胞外循环)组成,三个细胞内域和四个跨内膜脑植物杂物区。关于CD81的LEL/SEL复合物晶体,当MPD在SEL存在下用作沉淀物时,获得与先前获得的Lel晶体完全不同的晶体。使用此情况,通过Spring-8收集了分辨率为2.0Å的X射线衍射数据。该晶体具有菱形的结晶系统,A = B = 61.4,C =144.2Å,数据分辨率高达2.0Å,RSYM为6.2%,完整性为99.5%。基于此强度数据,使用LEL部分的模型坐标来确定三维结构。结果,已经清楚地获得了与30个被认为是SEL部分的氨基酸相对应的电子密度,目前正在为该电子密度部分进行模型构建。 CD81-lel由五个α-螺旋(A-e)组成,由与HCV结合的二聚体和头部亚域(C,d)形成的茎子域(A,B,E螺旋)组成。电子密度部分(被认为是SEL部分)位于垂直于C和D螺旋的位置,并与LEL相互作用,并且也与E-Helix的一部分相互作用。目前,对于HCV结合至关重要的PHE186残基不与SEL结合,而是朝向溶剂侧的突出,并且在晶体内挤满了其他对称分子。因此,SEL/LEL复合物的三维结构可以被认为是与Phel186幸存的HCV结合的重要位点。

项目成果

期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kitadokoro K.: "Subunit association and conformational flexibility in the head subdomain of human CD81 large extracellular loop"Biol. Chem.. 9. 1447-1452 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环头部子域的亚基关联和构象灵活性”Biol。
  • DOI:
  • 发表时间:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kitadokoro K.: "X-ray structural analysis of the tetraspanin CD81 long extracellular loop complex with small loop"Spring-8 User Experiment Report. 9. 174-174 (2002)
Kitadokoro K.:“四跨膜蛋白 CD81 长细胞外环复合物与小环的 X 射线结构分析”Spring-8 用户实验报告。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の構造生物学"京都大学低温物質科学研究センター誌. (2003)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体CD81的结构生物学”京都大学低温材料科学研究中心期刊(2003)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の細胞外ドメインの立体構造"生物物理学会誌. 240. 75-78 (2002)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体 CD81 胞外结构域的三级结构”,《生物物理学会杂志》240. 75-78 (2002)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
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    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kitadokoro K.: "Structural flexibility of human CD81 large extracellular loop.a receptor for HCV envelope E2 glycoprotein"第2回あわじしま感染症・免疫フォーラム講演予稿集. 平成14年. 001-001 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环的结构灵活性。HCV 包膜 E2 糖蛋白的受体”2002 年第二届淡路岛传染病和免疫学论坛论文集。001-001 (2002)。
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