C型肝炎ウイルスワクチン開発のためのCD81の構造生物学的研究
CD81用于丙型肝炎病毒疫苗开发的结构生物学研究
基本信息
- 批准号:14021052
- 负责人:
- 金额:$ 1.92万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
C型肝炎は世界の人口の約3%にあたる1億7千人もの人々に感染するウイルス性の病気であリ、肝臓における主たる病気となっている。C型肝炎ウイルス(HCV)の存在は以前より知られているが、その感染や発症のメカニズムついてはよく理解されていない。PileriらはHCVのエンベロープ蛋白質(E2)がヒトの細胞表面抗原レセプターであるCD81分子の細胞外ドメイン(LEL)に結合することを見出した。CD81分子は236個のアミノ酸からなる4回膜貫通型の膜蛋白質であり、2つの細胞外領域(LEL ; Large Extracellular LooP,およびSEL ; Small Extracellular Loop)と3つの細胞内ドメインおよび4つの膜貫通疎水性領域から形成されている。CD81のLEL/SEL複合体結晶については、SELの共存下でLELの結晶化スクリーニングの信果、MPDを沈殿剤とした場合に、以前得られた2種類のLEL結晶とは全く晶系の異なる結晶が得られた。これを用いてSpring-8にて2.0Å分解能のX線回折データを収集した。この結晶は、晶系がRhombohedralに属し、a=b=61.4,c=144.2Åであり、2.0Å分解能までのデータで、Rsymが6.2%,Completenessが99.5%であった。この強度データを基に、LEL部分のモデル座標を用いて分子置換法により、立体構造決定を行った。その結果、SEL部分であると考えられる30残基のアミノ酸に相当する電子密度がはっきりと得られており、現在、この電子密度部分に対してモデルビルディングを行っている。CD81-LELは5つのα-ヘリックス(A-E)からなり、2量体の形成に関与するStalkサブドメイン(A,B,Eヘリックス)とHCVの結合に関与するHeadサブドメイン(C,D)からなる。SEL部分と考えられる電子密度部分は、C,Dヘリックスに対して垂直な位置に存在してLELと相互作用し、またE-ヘリックスの一部とも相互作用していた。この際、HCVの結合に必須であるPhe186残基は、SELとは結合せず溶媒側に突出して存在し、結晶内で他の対称な分子とパッキングしていた。従って、SEL/LEL複合体の立体構造からも、このPhe186残暮のHCVに結合する重要な部位であると考察できる。
丙型肝炎是一种病毒性疾病,感染 17 万人,约占世界人口的 3%,是一种主要的肝脏疾病。尽管丙型肝炎病毒(HCV)的存在早已为人所知,但其感染和发病机制尚不清楚。 Pileri 等人发现 HCV 包膜蛋白 (E2) 与人类细胞表面抗原受体 CD81 分子的胞外结构域 (LEL) 结合。 CD81分子是由236个氨基酸组成的四跨膜蛋白,由两个胞外区(LEL;大胞外环和SEL;小胞外环)、三个胞内结构域和四个跨膜结构域组成。地区。对于CD81的LEL/SEL复合晶体,在SEL共存下对LEL进行结晶筛选的结果,当使用MPD作为沉淀剂时,该晶体体系与之前获得的两种类型的LEL晶体完全不同。获得。利用这一点,我们在 Spring-8 上收集了 2.0 Å 分辨率的 X 射线衍射数据。该晶体的晶系属于菱面体,a=b=61.4,c=144.2 Å,2.0 Å分辨率下的数据显示Rsym为6.2%,完整性为99.5%。基于该强度数据,使用LEL部分的模型坐标通过分子置换法确定三维结构。结果,明确获得了与被认为是SEL区域的30个氨基酸残基相对应的电子密度,并且目前正在对该电子密度区域进行模型构建。 CD81-LEL由五个α-螺旋(A-E)组成,由参与二聚体形成的茎亚结构域(A、B、E螺旋)和参与HCV结合的头亚结构域(C、D)组成。电子密集区域被认为是 SEL 区域,垂直于 C 和 D 螺旋存在,并与 LEL 以及部分 E 螺旋相互作用。此时,HCV结合所必需的Phe186残基不与SEL结合,而是向溶剂侧突出,并与晶体内的其他对称分子堆积在一起。因此,从SEL/LEL复合物的三维结构来看,可以认为这个Phe186残基是与HCV结合的重要位点。
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Kitadokoro K.: "Subunit association and conformational flexibility in the head subdomain of human CD81 large extracellular loop"Biol. Chem.. 9. 1447-1452 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环头部子域的亚基关联和构象灵活性”Biol。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kitadokoro K.: "X-ray structural analysis of the tetraspanin CD81 long extracellular loop complex with small loop"Spring-8 User Experiment Report. 9. 174-174 (2002)
Kitadokoro K.:“四跨膜蛋白 CD81 长细胞外环复合物与小环的 X 射线结构分析”Spring-8 用户实验报告。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の構造生物学"京都大学低温物質科学研究センター誌. (2003)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体CD81的结构生物学”京都大学低温材料科学研究中心期刊(2003)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
北所健悟: "C型肝炎ウイルスレセプターCD81の細胞外ドメインの立体構造"生物物理学会誌. 240. 75-78 (2002)
Kengo Kitasho:“丙型肝炎病毒受体 CD81 胞外结构域的三级结构”,《生物物理学会杂志》240. 75-78 (2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Kitadokoro K.: "Structural flexibility of human CD81 large extracellular loop.a receptor for HCV envelope E2 glycoprotein"第2回あわじしま感染症・免疫フォーラム講演予稿集. 平成14年. 001-001 (2002)
Kitadokoro K.:“人 CD81 大细胞外环的结构灵活性。HCV 包膜 E2 糖蛋白的受体”2002 年第二届淡路岛传染病和免疫学论坛论文集。001-001 (2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
北所 健悟其他文献
Functional analysis of human herpesvirus-6B entry receptor and its viral ligand
人疱疹病毒6B进入受体及其病毒配体的功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
西田 由貴子;北所 健悟;尾関 百合子;立石 善隆;井上 学;仁木 満美子;金子 幸弘;松本 壮吉;Huamin Tang - 通讯作者:
Huamin Tang
Clostridium perfringens enterotoxin 不活性型変異体 D48A のX線結晶構造解析
产气荚膜梭菌肠毒素失活突变体D48A的X射线晶体结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
浜谷 俊平;神谷 重樹;高橋 梓;堀口 安彦;北所 健悟 - 通讯作者:
北所 健悟
北所 健悟的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('北所 健悟', 18)}}的其他基金
黄色ブドウ球菌の増殖を根こそぎ断つ抗リパーゼ薬創製のための複合体の結晶構造解析
用于制造消除金黄色葡萄球菌生长的抗脂肪酶药物的复合物的晶体结构分析
- 批准号:
24K10199 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ボツリヌス神経毒素複合体赤血球凝集因子の腸管上皮細胞バリア通過機構解明
肉毒杆菌神经毒素复合物血凝因子肠上皮细胞屏障通过机制的阐明
- 批准号:
20051011 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
膜4回貫通型蛋白質テトラスパニンの細胞外ドメインの構造生物学的研究
四跨膜蛋白四跨膜蛋白胞外结构域的结构生物学研究
- 批准号:
14780510 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
C型肝炎ウイルスワクチン開発のためのCD81の構造生物学的研究
CD81用于丙型肝炎病毒疫苗开发的结构生物学研究
- 批准号:
13226056 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
CD81の活性ドメインとHCVウイルス蛋白質の複合体のX線構造解析
CD81活性结构域与HCV病毒蛋白复合物的X射线结构分析
- 批准号:
12780492 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
光回復酵素と損傷DNAの複合体のX線結晶解析
光活化酶与受损 DNA 复合物的 X 射线晶体分析
- 批准号:
10780409 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
膜4回貫通型蛋白質テトラスパニンの細胞外ドメインの構造生物学的研究
四跨膜蛋白四跨膜蛋白胞外结构域的结构生物学研究
- 批准号:
14780510 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
C型肝炎ウイルスワクチン開発のためのCD81の構造生物学的研究
CD81用于丙型肝炎病毒疫苗开发的结构生物学研究
- 批准号:
13226056 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 1.92万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)