巨大ヒトゲノム導入による機能解析

引入巨型人类基因组进行功能分析

基本信息

  • 批准号:
    08283218
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1996
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1996 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は巨大DNAのマニピュレーションに画期的威力を発揮できるYACテクノロジーを応用して、(1)YAC導入による機能解析、(2)導入YACの動態の解析、(3)導入効率の改善と発現クローニング法への応用を行なって、新しい側面からバイオサイエンスをサポートすることを目的とする。本年度は導入実験の対象として、ヒトMDR1遺伝子領域を用いて、以下の点について検討を加え実績を上げた。1)YACを用いることにより、いわゆる挿入位置効果を回避できるか?:MDR1のcDNAを用いた導入実験(Ueda et al.1988)によると、薬剤耐性トランスフェクタント/Neo^rトランスフェクタントの効率は0.06%である。今回ヒトMDR1遺伝子を持つYAC導入株を単離し解析したところ、全てのクローンでヒトMDR1遺伝子が発現し、制ガン剤ビンクリスチンに耐性を獲得していた。すなわち、YACを用いることにより導入DNAの挿入位置効果を回避できる可能性が示唆された。2)YAC導入法をどのようにシス制御機構解析に応用できるか?:導入株のいずれにおいても、導入ヒトMDR1遺伝子の増幅及び発現促進が認められたのに対し、マウスの内在性mdr遺伝子の発現、増幅は見られなかった。この選択的発現機構につきいくつかの可能性を検討した結果、DNAメチル化による制御が示唆された。5aza-CdR処理によりマウスの内在性mdr遺伝子の発現が誘導され、この可能性が確認されるとともに、YAC導入によるシス制御機構の解析の有効性が示された。3)移入効率上昇の試み:PEGより融合効率の上昇が期待されるリポゾーム・センダイウイルスフュージョンをYAC導入に応用するために、YACのリポゾームへの封入を試みたが剪断力によるDNAの断片化が避けられなかった。線状巨大DNAは剪断力に弱いというYAC DNAの存在状態そのものを根本的に見直す必要があると考えられた。今後、移入の効率を上昇させるために、YACを環状化した後導入する方法を開発する。そのために、酵母菌内で環状化させるためのベクターを構築する。
本研究应用在巨型DNA操作方面具有革命性力量的YAC技术,以(1)通过引入YAC来分析功能,(2)分析引入的YAC的动力学,以及(3)提高和表达引入效率。通过将其应用于克隆方法,从新的角度支持生物科学。今年,我们以人类MDR1基因区域为导入实验对象,进行了以下几点研究并取得了成果。 1)使用YAC能否避免所谓的插入位置效应?:根据使用MDR1 cDNA的导入实验(Ueda et al. 1988),耐药转染子/Neo^r转染子的效率为0.06%。当我们分离和分析YAC引入的携带人类MDR1基因的菌株时,我们发现所有克隆都表达人类MDR1基因,并且已经获得了对抗癌药物长春新碱的耐药性。换句话说,表明通过使用YAC可以避免引入的DNA的插入位置效应。 2)YAC导入方法如何应用于顺式调控机制分析?:在所有导入的菌株中,观察到导入的人MDR1基因的扩增和表达促进,而没有观察到表达或扩增。通过检查这种选择性表达机制的几种可能性,建议通过 DNA 甲基化进行控制。 5aza-CdR处理诱导小鼠内源性mdr基因的表达,证实了这种可能性,并证明了通过引入YAC来分析顺式调节机制的有效性。 3) 尝试提高转移效率:为了将脂质体-仙台病毒融合应用于YAC导入,与PEG相比,预计会提高融合效率,我们尝试将YAC封装到脂质体中,但由于剪切力而发生了DNA断裂。这是不可避免的。人们认为有必要从根本上重新考虑YAC DNA本身的存在状态,即线性巨型DNA抵抗剪切力的能力较弱。未来我们将开发一种在环化后引入YAC的方法,以提高转移效率。为此,构建了用于酵母环化的载体。

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
H.Kusaba: "Functional expression of yeast artificial chromosome (YAC)-human multidrug resistance genesin mouse cells." Genome Research. 5. 245-258 (1995)
H.Kusaba:“酵母人工染色体(YAC)-人类多药耐药基因在小鼠细胞中的功能表达。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Taniguchi,K.: "A human canalicular multispecific or ganic anion transporter (cMOAT) gene is overexpressed in cisplatin resistant human cancer cell lines with decreased drug accumulation." Cancer Research. 56. 4124-4129 (1996)
Taniguchi,K.:“人小管多特异性或有机阴离子转运蛋白 (cMOAT) 基因在顺铂耐药的人癌细胞系中过度表达,药物蓄积减少。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Taniguchi,K.: "Drug-incluced down-regulation of topoisomeraase I in human epider moid cancer cells resistant to saintopin and camptothecins." Cancer Research. 56. 2348-2354 (1996)
Taniguchi, K.:“在对圣托品和喜树碱耐药的人表皮样癌细胞中,药物导致拓扑异构酶 I 下调。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hisano,T.: "Increased Expression of T-Plastin Gene in Cisplatin-Resistant Human Cancer Cells : Identification by mRNA Differential Dysplay." FEBS Letter. 397. 101-107 (1996)
Hisano,T.:“顺铂抗性人类癌细胞中 T-Plastin 基因的表达增加:通过 mRNA 差异性失调进行鉴定”。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
K.Torigoe: "YAC-based 1.5 Mb contig spanning the human multidrug resistantce gene region and delineating the amplification unit in two human multidrug resistant cell lines." Genome Research. 5. 233-244 (1995)
K.Torigoe:“基于 YAC 的 1.5 Mb 重叠群跨越人类多重耐药基因区域,并描绘了两种人类多重耐药细胞系中的扩增单元。”
  • DOI:
  • 发表时间:
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