モルテン・グロビュール状態における分子内運動のO-ROESY法による研究

O-ROESY法研究熔球态分子内运动

• 批准号: 07280207
• 负责人: 桑田 一夫
• 金额: $ 1.6万
• 依托单位: Gifu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-07280207/
• 关键词: O-ROESY; 緩和行列; スペクトル密度関数; オーダーパラメーター; 緩和時間; モルテン・グロビュール

O-ROESY法のための完全緩和行列法のプログラム(1.CORMA-O-ROESY,2.MARDIGRA-O-ROESY及び3.NONLINEAR-O-ROESY)をFortranで作成した。1は蛋白質または核酸のpdbフォーマット・ファイルから2次元O-ROESYスペクトル強度を算出する。2は、2次元O-ROESY実験から得られた強度から各核間ベクトルの交差緩和時間を完全緩和行列法により算出する。3は2の出力より、スペクトル密度関数(Lipari-Szabotype)のオーダー・パラメーター及び内部回転緩和時間を算出する。2種類の青磁場を用いた場合の3の出力のユニークネスは完全探索法により確認した。またO-ROESY法は未だ理論的に曖昧な部分があったので、れらの点を出来るでけ解決した。即ち、スカラー・カップリングの影響及び遅い(msecオーダー)の運動の影響である。前者はオフ・レゾナンス・ラジオ波照射場では、現実的に無視出来るようになる事が示された。また後者に関しては、O-ROESY法を通じて系統的に観測可能である事が示された。同時にO-ROESY法の量子電磁気力学(QED)的な計算法が、パルスEPRやPHOTON ECHOの様な時間分解光供鳴法に対しても一般に適用出来る事が分かった。実験では,チトクロームCのa.天然状態、b.モルテン・グロピュール状態、c.変性状態について1次元及び2次元O-ROESY測定を行った。1次元スペクトルによる緩和時間解析では、bでは、aやcよりも部分的に緩和時間の短い成分が存在する事が分かった。NMR的にみた場合、これが疎水性コアに由来するのかどうか、現在検討している。

在Fortran中创建了用于O-Roesy方法的O-Roesy方法（1.Corma-o-o-roesy，2.Mardigra-o-roesy和3.nonlinelear-o-Roesy）。 1从蛋白质或核酸的PDB格式文件中计算2D O-ROESY光谱强度。 2是通过从二维O-Roesy实验中通过每个核载体的完全缓解的游行方法获得的强度来计算的。 3从2输出计算频谱密度函数（lipari-szabotype）的顺序参数和内部旋转缓慢时间。使用两种类型的绿色瓷字段时，3输出的唯一性通过完整的搜索方法确认。另外，O-Roesy方法在理论上仍然具有模棱两可的部分，因此我们可以解决它们。也就是说，标量耦合和慢速（MSEC顺序）运动的效果。前者表明，在OFF谐波无线电波辐照区域可能被忽略。结果表明，后者是通过O-Roesy方法系统地观察到的。同时，发现O-Roosy方法的量子电磁力学（QED）的计算方法可以应用于时间分解光方法，例如脉冲EPR和Photon Echo。在实验中，对A.自然状态，B。熔融刺激和C. C. C. controchrome C.进行了一维和二维的O-Roesy测量。根据一个维频谱分析，b表明一些缓解时间较短的组件比A和C较短。就NMR而言，我们目前正在考虑这是否来自疏水核心。

项目成果

桑田 一夫: "蛋白質・核酸系の核磁気緩和現象(I)" 生物物理. 35. 19-23 (1995)

Kazuo Kuwata：“蛋白质/核酸系统中的核磁弛豫现象（I）”生物物理学。 35. 19-23 (1995)

Kazuo Kuwata: "Polariztion-Operator Formalism Description of the Off-Resonance ROESY Experiment" J.Magn.Reson.114. 219-229 (1995)

Kazuo Kuwata：“偏共振 ROESY 实验的极化算子形式主义描述”J.Magn.Reson.114。