L-Mafを中心とした転写因子のX線構造生物学的研究

以L-Maf为中心的转录因子的X射线结构生物学研究

• 批准号: 09277216
• 负责人: 箱嶋 敏雄
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09277216/
• 关键词: bZIP; bHLH; DNA結合モチーフ; 塩基配列; 分子認識; 構造生物学

1)PHO4-DNA複合体結晶酵母由来のリン酸代謝系の転写因子PHO4のDNA結合ドメインとその認識配列DNA(PHO5遺伝子のUASp2)との複合体の結晶構造を分解能2.8Åで決定し、EMBO.J(1997)に発表した。従来のbHLHモチーフでは見られなかった第三のヘリックスがループ部分に存在すること、及び、E-boxと呼ばれるbHLHの認識する共通配列(CACGTG)に続く3'-側の2塩基対を余分に認識していることを発見した。ホモ二量体の非対称認識を示す最初の例である。2)Papl-DNA複合体結晶また、分裂酵母由来のAP-1様転写因子PaplのDNA結合ドメインとDNAオリゴマーとの高分解能(2Å以上)複合体結晶を作成して、MIRより位相決定した。bZIPの認識する共通配列はAP-1及びATF/CREBサイトに大別されるが、Papl(認識配列TAACGTTA)などの幾つかのbZIP転写因子はこれとは異なる種々の配列を認識することが知られており、その認識メカニズムは不明であった。本構造はこの非共通配列をもつ複合体の最初の解析例であり、塩基認識の多様性について新しいパラダイムを提出できる可能性がある。3)IRF2-DNA複合体結晶更に、マウス由来の転写因子IRF-2のDNA結合ドメインとDNAオリゴマーとの複合体結晶を、MIR-MRより位相決定した。IRF-2は繰り返し配列にタンデムに結合しており、IRF-1/DNA結晶で報告されているような大きなDNAの湾曲が局所的には存在するもの、分子全体としては互いに打ち消し合っていることが明らかになった。これらのPapl/DNAとIRF-1/DNAの複合体は、現在、更に構造精密化中である。

1）PHO4之间的络合物的晶体结构，源自PHO4及其认知序列DNA（PHO5基因的UASP2）的Pho4-DNA复合晶体酵母的DNA键结构域由分解，EMBO，EMBO，EMBO确定它在.J（1997）中宣布。在循环部分中存在的第三个螺旋在传统的BHLH基序中没有发现，并且在BHLH识别的公共阵列（CACGTG）的3个侧的2个底座上有一个额外的两个基准对我被认可了。这是同剂剂量的不对称识别的第一个例子。 2）PAPL-DNA复合物晶体，AP-1-SAMA-SAMA样转录因子PAPL DNA结合结构域和DNA低聚物（2Å或更多）产生了一个复杂的晶体（2Å或更多），并根据miR确定。 BZIP识别的常见阵列被广泛分为AP-1和ATF/CREB位点，但众所周知，某些BZIP转移因子（例如PAPL）（公认的序列TAACGTTA）识别其不同的序列，并且识别是不同的序列。机制未知。这种结构是对这个非通用阵列的复合物的首次分析，并且可以提交新的范式，以了解基本识别的多样性。 3）进一步的IRF2-DNA复合物晶体，已经从miR-MR确定了小鼠衍生的IRF-2的DNA组合结构域和DNA低聚物之间的复合晶体。 IRF-2反复粘结到一个重复的阵列，并且有一个大的DNA曲率，由IRF-1/DNA晶体报告，整个分子彼此相互取消。这些PAPL/DNA和IRF-1/DNA的复合物目前处于结构精度之下。

项目成果

M.Kato: "Insights into multistep phosphorelay from the crystal structure" Cell. 88・5. 717-723 (1997)

M.Kato：“从晶体结构洞察多步磷光继电器”Cell 88・5。

T.Shimizu: "Crystal Structure of PHO4 bHLH domain-DNA complex" EMBO Journal. 16・15. 4689-4697 (1997)

T.Shimizu：“PHO4 bHLH结构域-DNA复合物的晶体结构”EMBO杂志16・15（1997）。

S.Kuge: "Use of a fusion protein to obtain well-ordered crystal" Protein Science. 6・8. 1783-1786 (1997)

S.Kuge：“使用融合蛋白获得有序晶体”《蛋白质科学》6·8（1997）。

T.Kishi: "Crystallization and preliminary X-ray studies of neuropsin" Journal of Stuctural Biology. 118. 248-251 (1997)

T.Kishi：“神经蛋白酶的结晶和初步 X 射线研究”结构生物学杂志。

A.Toumoto: "Preliminary X-ray studies on a new crystal form of PHO4-DNA" Acta Crystallographica. D53・1. 103-104 (1997)

A.Toumoto：“PHO4-DNA 新晶体形式的初步 X 射线研究”Acta D53·1（1997）。