Identification of tumor driver lncRNAs in myeloid tumors and development of lncRNA-targeting therapies

骨髓瘤中肿瘤驱动lncRNA的鉴定和lncRNA靶向疗法的开发

• 批准号: 22H03100
• 负责人: 合山 進
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H03100/
• 关键词: lncRNA; 骨髄系腫瘍; NEAT1; CRISPR/Cas13; 核酸医薬; NONO; Cas13; Split-GFP

DNAから転写されるRNAには、タンパク質をコードするRNA（mRNA）と、タンパク質をコードしないノンコーディングRNA（ncRNA）がある。これまではmRNAが研究の中心だったが、最近の研究でncRNAも様々な生命現象の制御に関与していることがわかってきた。本研究では、長鎖ノンコーティングRNA (long noncoding RNA：lncRNA)の動態を解析するための新しい技術を開発し、またlncRNAを標的とする核酸医薬もしくは低分子化合物を開発する。これまでに、骨髄系腫瘍細胞で高発現している主要なRNAおよびRNA結合タンパクを、OOPS法を用いて同定した。また、パラスペックル構成因子であるNEAT1 (lncRNA)-NONO(RNA結合タンパク)複合体を対象に様々な技術開発を行い、NEAT1-NONO結合を可視化するdCas13/Split-GFPシステム、NEAT1-NONO結合を定量することのできるdCas13/Split-NanoBitシステム、そしてNEAT1-NONO複合体周囲の分子をビオチン化するdCas13/Split-TurboIDシステムを開発した。さらに、dCas13/Split-TurboIDシステムを用いて、NEAT1-NONO複合体と相互作用する分子やゲノム領域の網羅的解析を行った。これらの結果を基に、パラスペックルを中心とする分子ネットワークの全貌を解明すべく進めている。さらに、骨髄系腫瘍におけるIMPDH(GTP合成系の律速酵素)やDTX2(E3ユビキチンリガーゼ)の役割を明らかにした。今後はこれらの成果を基に、lncRNAを標的とした治療法、治療薬の開発を進めていきたい。

由DNA转录而来的RNA包括蛋白质编码RNA（mRNA）和不编码蛋白质的非编码RNA（ncRNA）。迄今为止，mRNA一直是研究的焦点，但最近的研究表明，ncRNA还参与多种生物现象的调节。在这项研究中，我们将开发新技术来分析长非编码RNA（lncRNA）的动力学，并开发针对lncRNA的核酸药物或小分子化合物。到目前为止，我们已经使用 OOPS 方法鉴定了在骨髓肿瘤细胞中高表达的主要 RNA 和 RNA 结合蛋白。另外，副散斑构成因子NEAT1，我们开发了多种针对 (lncRNA)-NONO（RNA 结合蛋白）复合物的技术，包括可可视化 NEAT1-NONO 结合的 dCas13/Split-GFP 系统，以及可量化 NEAT1-NONO 结合的 dCas13/Split-GFP 系统。我们开发了 NanoBit 系统和 dCas13/Split-TurboID 系统，可对 NEAT1-NONO 复合物周围的分子进行生物素化。此外，使用 dCas13/Split-TurboID 系统，我们对与 NEAT1-NONO 复合物相互作用的分子和基因组区域进行了全面分析。基于这些结果，我们正在努力阐明以副斑点为中心的整个分子网络。此外，我们还阐明了 IMPDH（GTP 合成系统中的限速酶）和 DTX2（E3 泛素连接酶）在骨髓瘤中的作用。未来，我们希望基于这些结果，继续开发针对lncRNA的治疗方法和药物。

项目成果

Decitabine induces excessive DNA-DNMT1 crosslinks and perturbs faithful mitosis of myeloid tumors

地西他滨诱导过度的 DNA-DNMT1 交联并扰乱骨髓瘤的忠实有丝分裂

• 发表时间: 2022
• 作者: Tomohiro Yabushita;Shuhei Asada;Keita Yamamoto;Naru Sato;Yutaka Enomoto;Yosuke Tanaka;Tomofusa Fukuyama;Atsuya Nishiyama;Makoto Nakanishi;Toshio Kitamura;Susumu Goyama
• 通讯作者: Susumu Goyama

Mitotic perturbation is a key mechanism of action of decitabine in myeloid tumor treatment

• DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113098
• 发表时间: 2023-09-26
• 期刊: CELL REPORTS
• 影响因子: 8.8
• 作者: Yabushita，Tomohiro;Chinen，Takumi;Goyama，Susumu
• 通讯作者: Goyama，Susumu

CRISPR-dCas9 activation全ゲノムスクリーニング法による骨髄系腫瘍に対するDecitabineの作用機序の解明

利用CRISPR-dCas9激活全基因组筛选方法阐明地西他滨对骨髓瘤的作用机制

• 发表时间: 2023
• 作者: 藪下 知宏;知念 拓実;西山 敦哉;南谷 泰仁;中西 真;北川 大樹;北村 俊雄;合山 進
• 通讯作者: 合山 進

健康長寿実現のために、CHIPとどう向き合うか？

我们该如何对待CHIP才能实现健康长寿？

• 发表时间: 2022
• 作者: 藪下 知宏;知念 拓実;西山 敦哉;南谷 泰仁;中西 真;北川 大樹;北村 俊雄;合山 進;合山進;合山進
• 通讯作者: 合山進

RUNX1 Inhibition Using Lipid Nanoparticle-Mediated Silencing RNA Delivery as an Effective Treatment for Acute Leukemias

• DOI: 10.1016/j.exphem.2022.05.001
• 发表时间: 2022-08-01
• 期刊: EXPERIMENTAL HEMATOLOGY
• 影响因子: 2.6
• 作者: Iida, Kohei;Tsuchiya, Akiho;Goyama, Susumu
• 通讯作者: Goyama, Susumu