Establishment of a novel test method for HTLV-1 clonality that captures the onset of ATL

建立一种新的 HTLV-1 克隆性测试方法，捕获 ATL 的发生

• 批准号: 22H02972
• 负责人: 長谷川 寛雄
• 金额: $ 10.07万
• 依托单位: Nagasaki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02972/
• 关键词: HTLV-1; 組み込み部位; 遺伝子検査; ATL

ヒトT 細胞白血病ウイルス1型（HTLV-1）感染者の約5%が成人T 細胞白血病・リンパ腫（ATL）を発症するが、その機序は不明である。申請者らは、HTLV-1のヒトゲノムへの組込み部位を簡便に検出し、クロナリティも評価できる検査の原型（RAISE法）を開発した。これによりATL発症機序の解明に近づいた一方で、クロナリティを定量的に評価できるcut off index (COI)に該当する基準がないことが制約であった。本研究の目的は「クロナリティを定量的に評価できる検査」と「組込み部位解析とHTLV-1遺伝子変異解析によるクローンのリスク評価」の2つを包括した検査系を実用化することである。まずRAISE法に関しては感度と簡便性を高めたRAISING法へと改良を重ねている。RAISE法ではクロナリティ判定に定量性を持たせることが困難であったことから、サンガーシークエンス法から塩基編集効率を測定するプログラム「EditR」（CRISPR J 2018;1(3):239-250.）に着目し、これをベースとした解析ソフトウエアの開発に取り組んだ。シークエンスデータのメインクローンのスペクトル値の割合（クロナリティバリュー）を算出すると、その値はATL症例では0.5-1.0の領域に収束しキャリアにおいては0.1前後の領域に収束する傾向であり、COIが設定可能であった（Commun Biol. 2022 Jun 2;5(1):535.）。一方で他の検体群においてはCOIによって必ずしも高感度・特異度が得られない場合もあり、精度を高める方法の模索を開始している。また、可能な限り長期間の経時的な評価をおこなうことも重要な目的であり、継続中である。さらに、HTLV-1遺伝子解析と組込み部位解析に関しては、クローン毎の評価を開始しており、データを集積中である。

大约 5% 感染人类 T 细胞白血病病毒 1 型 (HTLV-1) 的人会发展为成人 T 细胞白血病淋巴瘤 (ATL)，但其机制尚不清楚。申请人开发了一种原型测试（RAISE方法），可以轻松检测HTLV-1与人类基因组的整合位点，并评估克隆性。尽管这种方法使我们更接近阐明 ATL 的发病机制，但由于缺乏与可定量评估克隆性的截止指数 (COI) 相对应的标准，该方法受到限制。本研究的目的是将包括“定量评估克隆性的测试”和“使用整合位点分析和HTLV-1基因突变分析的克隆风险评估”两种方法的测试系统投入实际使用。首先，RAISE方法改进为RAISING方法，提高了灵敏度和简单性。由于很难用 RAISE 方法提供定量克隆性测定，因此我们开发了程序“EditR”（CRISPR J 2018;1(3):239-250.），该程序通过 Sanger 测序方法测量碱基编辑效率。并在此基础上开发了分析软件。在计算序列数据主克隆的谱值比（克隆度值）时，对于ATL情况，该值趋于收敛在0.5-1.0的范围内，对于载体，该值趋于0.1左右，这是COI设定的值。这是可能的（Commun Biol. 2022 Jun 2;5(1):535.）。另一方面，COI 可能并不总是为其他样本组提供高灵敏度和特异性，因此我们开始探索提高准确性的方法。另一个重要目标是尽可能长时间地进行纵向评估，而且这一目标正在进行中。此外，关于HTLV-1基因分析和整合位点分析，我们已经开始评估每个克隆，目前正在收集数据。

项目成果

RAISING is a high-performance method for identifying random transgene integration sites.

• DOI: 10.1038/s42003-022-03467-w
• 发表时间: 2022-06-02
• 期刊: Communications biology
• 影响因子: 5.9

HTLV-1クロナリティ定量検査RAISING-CLOVAを用いたATL発症リスク評価法の開発

使用HTLV-1克隆性定量测试RAISING-CLOVA开发ATL风险评估方法

• 发表时间: 2022
• 作者: 佐藤知雄;斎藤益満;和田悠作;長谷川寛雄;松平崇弘;今泉芳孝;内丸薫;渡邊俊樹;山野嘉久
• 通讯作者: 山野嘉久

Acute type adult T-cell leukemia cells proliferate in the lymph nodes rather than in peripheral blood

• DOI: 10.1038/s41417-022-00475-0
• 发表时间: 2022-04-22
• 期刊: CANCER GENE THERAPY
• 影响因子: 6.4
• 作者: Mizuguchi，Mariko;Takatori，Mitsuyoshi;Tanaka，Yuetsu
• 通讯作者: Tanaka，Yuetsu

Genome-wide CRISPR screens identify CD48 defining susceptibility to NK cytotoxicity in peripheral T-cell lymphomas.

• DOI: 10.1182/blood.2022015646
• 发表时间: 2022-11-03
• 期刊: BLOOD
• 影响因子: 20.3
• 作者: Chiba, Masahiro;Shimono, Joji;Ishio, Takashi;Takei, Norio;Kasahara, Kohei;Ogasawara, Reiki;Ara, Takahide;Goto, Hideki;Izumiyama, Koh;Otsuguro, Satoko;Perera, Liyanage P.;Hasegawa, Hiroo;Maeda, Michiyuki;Hashino, Satoshi;Maenaka, Katsumi;Teshima, Takanori;Waldmann, Thomas A.;Yang, Yibin;Nakagawa, Masao
• 通讯作者: Nakagawa, Masao

Hsp90阻害剤TAS-116 (pimitespib)のATL前臨床試験評価における有効性

Hsp90抑制剂TAS-116（pimitespib）在ATL临床前试验评价中的疗效

• 发表时间: 2022
• 作者: 伊波英克;池辺詠美;下崎俊介;長谷川寛雄;塚本善之;Yu Wang;佐々木大介;今泉芳孝;宮﨑泰司;柳原克紀;森下和弘
• 通讯作者: 森下和弘