Mechanisms of human LINE-1 retrotransposition

人类 LINE-1 逆转录转座机制

基本信息

批准号：
22H02600
负责人：
三好知一郎
金额：
$ 11.07万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research (2023)Kyoto University (2022)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02600/
关键词：
ゲノムレトロトランスポゾン LINE-1 自然免疫 L1 転移

项目摘要

生命の設計図であるゲノムの変化は、長期的にみれば集団の多様性を生み出し進化の原動力となりうるが、短期的には疾患につながる遺伝子破壊も引き起こす諸刃の剣である。Long INterspersed Element-1（LINE-1またはL1）は、転写された自身のRNAをDNAに逆転写することでゲノム上を移動（＝転移）するレトロトランスポゾンである。L1の転移は遺伝子破壊、染色体欠失や転座などゲノム不安定化を誘導し、様々な疾患原因ともなる。しかし、L1の転移プロセスとその制御因子はまだよくわかっていないため、L1が引き起こすゲノム変化の機序もまだ解明されていない。そこで本研究は、プロテオミクス解析と遺伝学的スクリーニングの手法を組み合わせてL1の制御因子を単離し、それらの機能解析を積み重ねることで、未解明のL1転移過程を明らかにする。本研究では、主に下記３つの研究課題に取り組んでいる。１．核内におけるL1のゲノム挿入機構の解明２．細胞質におけるL1複合体制御機構の解明３．遺伝学的スクリーニングによる転移制御因子の探索本年度は、特に２に着目してL1転移を制御する自然免疫応答因子の機能解析を中心に行い、下記で記載するように、その中の１であるHELZ2について詳細なL1抑制機構を明らかにした。これらの研究を積み重ねることで、将来的には転移を人為的に制御する手法の開発や、L1が関与する疾患・ゲノム不安定化の抑制にむけた応用研究にもつながることが期待される。

基因组的变化是一种生命的设计图，是一把双刃剑，从长远来看会导致群体的多样性，并且可能是进化的驱动力，但也会导致基因破坏，导致短暂疾病学期。长长的元素-1（线1或L1）是一种复古转运子，通过将转录的RNA复制到DNA上，在基因组上移动（= =转移）。 L1的转移会诱导基因组本能，例如基因破坏，染色体丢失和迁移，并可能引起各种疾病。但是，由于L1转移过程及其控制因子尚未得到充分了解，因此尚未阐明由L1引起的基因组变化的机理。因此，这项研究通过将蛋白质组学分析和遗传筛选方法结合到分离的L1控制因子并累积这些功能分析来阐明L1转移过程。在这项研究中，我们主要研究以下三个研究问题。 1。 2。阐明核中的L1基因组插入机制2。 2。阐明细胞质中的L1复合系统控制机制通过今年的基因筛查来探索转移控制因子，尤其是在控制L1转移酶的自然免疫反应因子的功能分析中，重点是2，如下所述，揭示了一种详细的L1抑制机制。通过累积这些研究，可以预期，将来，它将导致人为控制转移的方法发展，并应用研究以抑制涉及L1的疾病和基因组不稳定性。

项目成果

期刊论文数量（7）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

The interferon stimulated gene product HERC5 inhibits human LINE-1 retrotransposition

干扰素刺激的基因产物HERC5抑制人LINE-1逆转座

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Nishimori K.;Abdul Fatah A.L.;Watanabe Y.;Ishikawa F.;and Miyoshi T.
通讯作者：
and Miyoshi T.

The interferon stimulated gene-encoded protein HELZ2 inhibits human LINE-1 retrotransposition and LINE-1 RNA-mediated type I interferon induction.

DOI：
10.1038/s41467-022-35757-6
发表时间：
2023-01-13
期刊：
NATURE COMMUNICATIONS
影响因子：
16.6
作者：
Luqman-Fatah, Ahmad;Watanabe, Yuzo;Uno, Kazuko;Ishikawa, Fuyuki;Moran, John V.;Miyoshi, Tomoichiro
通讯作者：
Miyoshi, Tomoichiro

Human LINE-1 retrotransposons: impacts on the genome and regulation by host factors

DOI：
10.1266/ggs.22-00038
发表时间：
2023-01-01
期刊：
GENES & GENETIC SYSTEMS
影响因子：
1.1
作者：
Luqman-Fatah，Ahmad;Miyoshi，Tomoichiro
通讯作者：
Miyoshi，Tomoichiro

Nucleotide excision repair factors, XPC and Rad23b, regulate human LINE-1 retrotransposition

核苷酸切除修复因子 XPC 和 Rad23b 调节人 LINE-1 逆转录转座

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sato M.;Watanabe Y.;Ishikawa F. and Miyoshi T.
通讯作者：
Ishikawa F. and Miyoshi T.

The mechanism of human LINE-1 retrotransposition facilitated by the mitochondrial protein SSBP1

线粒体蛋白SSBP1促进人LINE-1逆转录转座的机制

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
Sugino K.;Tang C-W.;Watanabe Y.;Abdul Fatah A.L.;Makino T.;Ishikawa F.;Moran J.V. and Miyoshi T.
通讯作者：
Moran J.V. and Miyoshi T.

DOI：
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作者：
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期刊：
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通讯作者：
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通讯作者：
Fuyuki Ishikawa

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发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tomoichiro Miyoshi;Motoki Saito;Junko Kanoh;Fuyuki Ishikawa;三好知一郎;石川冬木;石川冬木;浦野健;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa
通讯作者：
Fuyuki Ishikawa

Stress Responses at Telomeres.

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DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tomoichiro Miyoshi;Motoki Saito;Junko Kanoh;Fuyuki Ishikawa;三好知一郎;石川冬木;石川冬木;浦野健;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;石川冬木;石川冬木;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;Fuyuki Ishikawa;石川冬木;Fuyuki Ishikawa
通讯作者：
Fuyuki Ishikawa