アミロイド触媒型の原始酵素モデルに着想した人工酵素のデザインと応用

受淀粉样蛋白催化原始酶模型启发的人工酶的设计与应用

基本信息

批准号：
22H01873
负责人：
真壁幸樹
金额：
$ 8.9万
依托单位：
Yamagata University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H01873/
关键词：
アミロイド触媒アミロイド蛋白質工学人工酵素 βシート

项目摘要

本研究では触媒活性のあるアミロイド（アミロイド触媒）の部分配列を我々がこれまで研究してきたペプチド会合模倣体（PSAM）へ移植し、球状タンパク質上で活性を詳細に評価を行う。これまでのアミロイド触媒で亜鉛をヒスチジンに配位させた構造が報告されているため、この構造の模倣から研究を開始した。PSAMのβシート上の片面にヒスチジンを24箇所と8箇所導入した変異体を作製した（それぞれCat-H24およびCat-H8と命名）。これらは人工遺伝子合成サービスを利用して、目的遺伝子を作った。Cat-H24およびCat-H8遺伝子を大腸菌組換え体として発現し、Ni-NTAカラムにて精製を行った。精製後のサンプルのpoly-Hisタグをスロンビン消化にて切断除去したサンプルを調製した。CDスペクトルにて元のPSAMと同様のβシートに富んだ構造を有していることを見出した。また、サイズ排除クロマトグラフィーの結果から、Cat-H24は実験条件にて主に二量体、Cat-H8は主に単量体として存在していることが明らかとなった。この二種類のPSAM変異体について、触媒活性をエステル加水分解と脱リン酸化反応で評価した。これら２つの反応を利用した理由は、反応生成物として色を持つ分子が生成する系を利用することで、簡便に反応速度論を評価することができるためである。触媒反応測定の結果、Cat-H24はエステル加水分解活性を持ち、金属イオンが不要であることが明らかとなった。これは報告のあるアミロイド触媒とことなるため反応メカニズムの解明を進めていく。また、脱リン酸化反応ではマグネシウムイオン依存的にCat-H24の触媒活性が現れることが明らかとなった。以上から、現時点でアミロイド触媒の触媒活性を移植したモデル蛋白質分子の設計に成功している。

在这项研究中，将淀粉样蛋白（淀粉样蛋白催化剂）的催化活性部分序列植入了我们迄今为止一直在研究的肽缔合模拟物（PSAM）中，并且对球状蛋白质的活性进行了详细评估。由于已经报道了使用淀粉样蛋白催化剂与组氨酸协调的先前结构，因此开始研究这种结构。制备了突变体，其中在PSAM的β薄片的一侧引入了24和8组氨酸（分别为CAT-H24和CAT-H8）。这些使用人工基因合成服务来创建感兴趣的基因。 CAT-H24和CAT-H8基因表示为大肠杆菌的重组，并使用Ni-NTA柱进行纯化。通过通过凝血酶消化裂解纯化样品的多his标签来制备样品。在CD频谱中发现，它具有富含Beta板的结构，类似于原始PSAM。此外，大小排除色谱的结果表明，在实验条件下，CAT-H24主要作为二聚体存在，CAT-H8主要作为单体存在。通过酯水解和去磷酸化反应评估这两个PSAM突变体的催化活性。使用这两种反应的原因是，可以通过利用一个系统作为反应产物来轻松评估反应动力学。催化反应测量表明，CAT-H24具有酯水解活性，不需要金属离子。这是淀粉样蛋白催化剂的报告，因此我们将继续阐明反应机制。还揭示了CAT-H24的催化活性在去磷酸化反应中以镁依赖性方式出现。从上面，可以设计一种已植入淀粉样蛋白催化剂的催化活性的模型蛋白分子。