Study on the hydration structural changes in coupling with the internal motions of proteins using time-resolved fluorscence measurement

利用时间分辨荧光测量研究与蛋白质内部运动耦合的水合结构变化

• 批准号: 22244054
• 负责人: NAKASAKO Masayoshi
• 金额: $ 30.78万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• 财政年份: 2010
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2010-04-01 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22244054/
• 关键词: タンパク質水和; 水和構造; 分子動力学シミュレーション; 蛍光分光; 和周波測定; 非線形光学; Ｘ線結晶構造解析; 主成分分析; 蛋白質水和構造; 水和構造解析; ドメイン運動; 溶媒応答; トリプトファン蛍光; 分子動力学計算; 水素結合; 時間分解蛍光測定; 和周波; Ｘ線小角度散乱; タンパク質; 和周波分光; X線小角散乱; 溶媒応答関数; 低温X線結晶構造解析; 蛍光発光; 蛋白質水和; 悲線形光学現象; 結晶構造解析; 遺伝子組み換え

Proteins are engaged in the elementary processes of life in cells and fold and function only in aqueous environment. To understand why water is indispensable for proteins it is necessary to visualize the hydration structures of proteins at spatial resolution of atomic level and ps temporal resolution. In this research project, through developing time-resolved fluorescence measurement system dedicated for proteins, we analyzed the dynamics of protein hydration from the experimental point of view using the fluorescence measurement and structure analyses as well as molecular dynamics simulation.

蛋白质仅在水性环境中参与细胞和折叠和功能的基本过程。要了解为什么水是必不可少的蛋白质，必须在原子水平和PS时间分辨率的空间分辨率下可视化蛋白质的水合结构。在该研究项目中，通过开发专门针对蛋白质的时间分辨荧光测量系统，我们使用荧光测量和结构分析以及分子动力学模拟从实验的角度分析了蛋白质水合的动力学。

项目成果

Ｘ線波の干渉で分子の姿・かたちを調べる

使用 X 射线波干涉检查分子的外观和形状

• 发表时间: 2012
• 作者: Y. Takayama;M. Nakasako;T. Oroguchi;Y. Sekiguchi;et al.;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

Coherent X-ray diffraction imaging of non-crystalline particles with sub-micrometer dimensions

亚微米尺寸非晶颗粒的相干 X 射线衍射成像

• 发表时间: 2013
• 作者: 中迫雅由;高山裕貴;苙口友隆;白濱圭也;関口優希;山本雅貴;米倉功治;引間孝明;眞木さおり;高橋幸生;鈴木明大;松永幸大;加藤翔一;星貴彦;関口優希他3名;橋本早紀他4名;小林周他4名;高山裕貴,他4名;高橋幸生他8名;中迫雅由他16名;T. Yoshidome他3名;中迫雅由;中迫雅由;M. Nakasako他21名;M. Nakasako他21名
• 通讯作者: M. Nakasako他21名

経験的水和水分布関数を用いた蛋白質水和構造予測

使用经验水合水分布函数预测蛋白质水合结构

• 发表时间: 2010
• 作者: 松岳大輔;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由

New monoclinic form of bovine pancreatic ribonuclease A from a salt solution and comparison of intermolecular interactions in ribonucleases A

盐溶液中牛胰腺核糖核酸酶 A 的新单斜形式以及核糖核酸酶 A 分子间相互作用的比较

• 发表时间: 2011
• 期刊: Journal of Crystal Growth
• 影响因子: 1.8
• 作者: H.Takusagawa;S.Yamamura;S.Endo;Sugawara;T.Inagaki;M.Nakasako
• 通讯作者: M.Nakasako

分子動力学計算によるグルタミン酸脱水素酵素ドメイン運動に協奏した水和構造変化の観察

使用分子动力学计算观察与谷氨酸脱氢酶结构域运动相一致的水合结构变化

• 发表时间: 2013
• 作者: 苙口友隆;中島 真;中迫雅由
• 通讯作者: 中迫雅由