Molecular systematical Studies of Cupressaceae and Taxodiaceae using DNA sequence information

利用 DNA 序列信息对柏科和杉科进行分子系统研究

基本信息

  • 批准号:
    11460073
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 9.28万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B).
  • 财政年份:
    1999
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1999 至 2000
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The molecular evolution of two families, Cupressaceae and Taxodiaceae, was elucidated using DNA sequence information on four chloroplast DNA genes, atpA, petA, rbcL, and rpo3. The principal results are as follows :(1) The molecular phylogeny of families Cupressaceae and Taxodiaceae revealed that they consisted of five clades and that family Cupressaceae was comprised within family Taxodiaceae.(2) In petA gene, the sequence polymorphism was recognized between Chamaecyparis obtusa and C.obtusa var. formosana. Using this information, the two species came to be identified correctly.(3) In the phylogeny of the genus Chamaecyparis, Alaska cypress (Chamaecyparis nootkatensis) was distant-related from the remaining six species/variety phylogenetically. This genus was divided into three clades.(4) The hybridity of Leyland cypress (x Cupressocyparis leylandii) was verified based on DNA information. We found the molecular evidence that the nucleic genome of Leyland cypress originated from Monterey cypress (Cupressus macrocarpa) and Alaska cypress in the Cupressaceae and that this species is of hybrid origin.(5) Systematical position of Alaska cypress was predicted in the genus Chamaecyparis. A new finding that this species should be classified as a member of the genus Cupressus was revealed based on molecular phylogenetic trees.(6) The family Cupressaceae was divided into two monophylic clades distributed in the northern hemisphere and the southern hemisphere. The genera of the southern hemisphere diverged at first. The genera Thujopsis and Thuja secondary separated, and the genera Cupresus and Juniperus were newly formed.(7) The genus Callitris was the latest-diverged in family Cupressaceae and the species of this genus was radiated in a relatively short term.
使用四个叶绿体DNA基因,ATPA,PETA,RBCL和RPO3的DNA序列信息阐明了两个家族的分子进化,即cupressaceae和cupressaceae和taxodiaceae。主要结果如下:(1)家族的杯形科和分型科的分子系统发育表明,它们由五个进化枝组成,而cupressaceae家族蛋白科组成。(2)在PETA基因中,在Chamaecyparis gotusa gotusa gotusa gotusaparis optrymorphism in taxododiaceae中。和C.Obtusa var。孔萨纳。 (3)在Chamaecyparis属的系统发育中,阿拉斯加柏树(Chamaecyparis nootkatensis)与剩余的六个物种/多样性的系统发育相关。该属分为三个进化枝。(4)根据DNA信息对Leyland Cypress(X Cupressocyparis leylandii)的杂种进行了验证。我们发现了分子证据,表明Leyland赛普拉斯的核心基因组起源于cupressaceae中的Monterey Cypress(Cupressus Macrocarpa)和Alaska Cypress,并且该物种是杂种起源的。一个新的发现,应根据分子系统发育树揭示该物种应归类为Cupressus属的成员。(6)(6)将家族杯状科分为两个分布在北半球和南半球的单叶枝。南半球的属起初有所不同。 Thujopsis属和Thuja次生分离,新形成的纯冠状动脉和Juniperus属。(7)Callitris属是在杯状科中最新的,该属的物种在相对短期内散发出来。

项目成果

期刊论文数量(53)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Isoda, K., Shiraishi, S.: "Identification of chloroplast DNA haplotypes of Abies firma and A.homolepis using a polymerase chain reaction with species-specific primers."J.For.Res.. 4. 291-294 (1999)
Isoda, K., Shiraishi, S.:“使用物种特异性引物的聚合酶链式反应鉴定冷杉和同型冷杉的叶绿体 DNA 单倍型。”J.For.Res.. 4. 291-294 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Isoda, K., Shiraishi, S., Watanabe, S., Kitamura, K.: "Molecular evidence of natural hybridization between Abies veitchii and A.homolepis (Pinaceae) revealed by chloroplast, mitochondrial and nuclear DNA markers."Mol.Ecol.. 9. 1965-1974 (2000)
Isoda, K.、Shiraishi, S.、Watanabe, S.、Kitamura, K.:“通过叶绿体、线粒体和核 DNA 标记揭示冷杉和 A.homolepis(松科)之间自然杂交的分子证据。”Mol.Ecol
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Yamaguchi,N.,Shiraishi,S.,Sasaki.Y.,and Yamamoto.C.: "Moleccular Evidence of the Hybrid Origins of Leyland Cypress(x Cupressocyparis leylandii)"Jounal of Foresut Research. 5(1)(印刷中). (2000)
Yamaguchi, N.、Shiraishi, S.、Sasaki. 和 Yamamoto C.:“Leyland Cypress (x Cupressocyparis leylandii) 杂交起源的分子证据”Foresut 研究杂志 5(1)(出版中)。 (2000)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Yamaguchi, N., Shiraishi, S., Sasaki, Y., Yamamoto, C.: "Molecular evidence of the hybrid origins of Leyland cypress (x Cupressocyparis leylandii)."J.For.Res.. 5. 35-38 (2000)
Yamaguchi, N.、Shiraishi, S.、Sasaki, Y.、Yamamoto, C.:“利兰柏 (x Cupressocyparis leylandii) 杂交起源的分子证据。”J.For.Res.. 5. 35-38 (
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Isoda,K.: "Allelic sequence polymorphisms in the intron region of the nuclear-encoded GapC gene preceded the speciation of the three closely related Abies species (Pinaceae)"Theor.Appl.Genet.. 102. 244-250 (2001)
Isoda,K.:“核编码的 GapC 基因内含子区域的等位基因序列多态性先于三个密切相关的冷杉物种(松科)的物种形成”Theor.Appl.Genet.. 102. 244-250 (2001)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

SHIRAISHI Susumu其他文献

SHIRAISHI Susumu的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('SHIRAISHI Susumu', 18)}}的其他基金

A simple sequencing system of complete chloroplast genome using long PCR and NGS in coniferous species
在针叶树种中使用长 PCR 和 NGS 的完整叶绿体基因组的简单测序系统
  • 批准号:
    25660124
  • 财政年份:
    2013
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
A simple system for developing the microsatellite markers using RSE-PCR and pyrosequencing
使用 RSE-PCR 和焦磷酸测序开发微卫星标记的简单系统
  • 批准号:
    24658138
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
A new feed profiling using DNA information for wild-herbivores
利用野生食草动物 DNA 信息进行新的饲料分析
  • 批准号:
    22658050
  • 财政年份:
    2010
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Global transcriptome analysis of the pine wilt disease and application to the resistance breeding
松材线虫病全转录组分析及其在抗性育种中的应用
  • 批准号:
    21380100
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Constructing a new breeding system for afforestation CDM in tropical Acacia forestry
构建热带金合欢林造林CDM新型育种体系
  • 批准号:
    17208014
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
Genetic mapping in Japanese coniferous tree species using microsatellite DNA markers
使用微卫星 DNA 标记对日本针叶树种进行遗传图谱分析
  • 批准号:
    13460070
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
An evaluation system of resistance ability of Japanese black pine clones against pine wood nematode based on parentage diagnoses using DNA molecular markers
基于DNA分子标记亲子鉴定的黑松无性系抗松材线虫能力评价体系
  • 批准号:
    12556024
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Construction of a new improvement system using DNA molecular technique in the forest tree species
利用DNA分子技术构建森林树种新改良体系
  • 批准号:
    09556032
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Molecular systematical Studies of conifer using DNA sequence information
利用 DNA 序列信息对针叶树进行分子系统研究
  • 批准号:
    09460070
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
A new identification system of sugi (Cryptomeria japonica) cultivars based on DNA typing
基于DNA分型的杉树品种新鉴定系统
  • 批准号:
    06556024
  • 财政年份:
    1994
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

相似国自然基金

中国“垺氏藻”时期淡水红藻的分类及分子系统发育研究
  • 批准号:
    32300175
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
叶上衣目地衣的分子系统发育及属种多样性研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目
中国丽蚌属整合分类学与分子系统发育研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
丽蝇科亚科级阶元分子系统发育和演化历史研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
牛肝菌科三个重要物种复合群的多样性、分子系统发育及生物地理
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2022
  • 资助金额:
    54 万元
  • 项目类别:
    面上项目

相似海外基金

Structural and functional basis of bacterial transcriptional regulation
细菌转录调控的结构和功能基础
  • 批准号:
    10712023
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
Phylogenomic mechanisms of trait evolution and resilience to disease
性状进化和疾病恢复力的系统发育机制
  • 批准号:
    10713885
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
Investigating the Role of cnb-1 and chpf-1 in GABA DD Motor Neuron Remodeling and Synapse Maintenance
研究 cnb-1 和 chpf-1 在 GABA DD 运动神经元重塑和突触维持中的作用
  • 批准号:
    10680262
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
Discovering human divergent activity-regulated elements using comparative, computational, and functional approaches
使用比较、计算和功能方法发现人类不同活动调节的元素
  • 批准号:
    10779701
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
Rationally guided discovery platform for monoclonal antibodies against carbohydrate antigens using virus-like particle conjugate immunization and high throughput selection
使用病毒样颗粒缀合物免疫和高通量选择的合理引导的针对碳水化合物抗原的单克隆抗体的发现平台
  • 批准号:
    10574738
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.28万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了