多次元プロテオミクスを利用した新規染色体タンパク質の探索

使用多维蛋白质组学寻找新型染色体蛋白质

• 批准号: 24870020
• 负责人: 太田 信哉
• 金额: $ 1.91万
• 依托单位: Kochi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-08-31 至 2014-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24870020/
• 关键词: 分裂期; 染色体; プロテオミクス

本研究の目的は、分裂期染色体の凝縮や分配機構に関わる新規のタンパク質を同定することである。この目的を達成するために、近年普及した定量的なプロテオーム解析をさらに改良し、複数の定量値を統計学的に組み合わせた手法、多次元プロテオミクスにおいて、分裂期染色体タンパク質と予測された機能未知タンパク質の分裂期細胞内での局在の決定を試み、これまでにこの手法で、12種類の新規セントロメアタンパク質を含む、30種類の新規染色体タンパク質を同定した。1　そこで本年度の研究では、更なる機能的分裂期染色体タンパク質同定のため、上記のプロテオミクス解析から染色体タンパク質と予測されるタンパク質の局在をさらに確認し、興味深いタンパク質を見いだすことを試みた。これまでに、100種類の標的遺伝子のうち25種類のヒトホモログをクローニングした。クローニングした遺伝子はGFP融合タンパク質の形でヒト細胞に導入したが、これまでに有力な新規遺伝子の発見には至っていない。2　また、同時に我々がこれまでに見いだした興味深い新規セントロメアタンパク質の機能解析を行った。これにより、この新規タンパク質は分裂前中期において染色体パッセンジャー複合体のセントロメアの局在と姉妹染色体の接着維持に必須であることが示唆された。

本研究的目的是鉴定参与有丝分裂染色体凝聚和分离机制的新型蛋白质。为了实现这一目标，我们进一步改进了近年来流行的定量蛋白质组分析，我们正在使用多维蛋白质组学，一种统计上结合多个定量值的方法，来鉴定有丝分裂染色体蛋白和未知功能的蛋白质。方法，迄今为止我们已经鉴定了30种新型染色体蛋白，其中包括12种新型着丝粒蛋白。 1 因此，在今年的研究中，为了进一步鉴定功能性有丝分裂染色体蛋白，我们进一步证实了上述蛋白质组分析中预测为染色体蛋白的蛋白质的定位，并试图发现有趣的蛋白质。迄今为止，他们已经克隆了 100 个目标基因中 25 个的人类同源物。克隆的基因以GFP融合蛋白的形式引入人体细胞，但迄今为止尚未发现有希望的新基因。 2 同时，我们对我们发现的一种有趣的新着丝粒蛋白进行了功能分析。这表明这种新蛋白对于染色体过客复合物的着丝粒定位和前期中期姐妹染色体凝聚力的维持至关重要。

项目成果

Understanding the architecture of vertebrate kinetochores using quantitative proteomics

使用定量蛋白质组学了解脊椎动物动粒的结构

• 发表时间: 2012
• 作者: T. Shiota;M. Maruyama;M. Miura;Y. Tamura;K. Yamano;M. Esaki;and T. Endo;田村 康;Makiko Kobayashi;Yamashino Takahumi;Yamashino Takahumi;Ito Shogo;Kumiko Samejima;Laura Wood
• 通讯作者: Laura Wood

Kif4 and Condensin promote lateral compaction of mitotic chromosome in parallel and are opposed by TopoisomraseII-alpha

Kif4 和 Condensin 并行促进有丝分裂染色体的横向压缩，并受到 TopoisomraseII-α 的对抗

• 发表时间: 2012
• 作者: T. Shiota;M. Maruyama;M. Miura;Y. Tamura;K. Yamano;M. Esaki;and T. Endo;田村 康;Makiko Kobayashi;Yamashino Takahumi;Yamashino Takahumi;Ito Shogo;Kumiko Samejima;Laura Wood;鮫島久美子
• 通讯作者: 鮫島久美子