妊娠関連乳癌の病態解明と治療ターゲット探索を目指した網羅的遺伝子解析

全面的遗传分析旨在阐明妊娠相关乳腺癌的病理学并寻找治疗靶点

• 批准号: 22K20783
• 负责人: 橋本 幸枝
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20783/
• 关键词: 妊娠関連乳癌; 遺伝子発現解析; 体細胞変異解析; 網羅的遺伝子解析; シングルセルRNA-seq

妊娠関連乳癌は予後不良な疾患であるが、妊娠関連乳癌の分子学的特徴に関して、過去にいくつか報告はあるものの総じてデータは少なく、特に日本人における妊娠関連乳癌の遺伝子解析に関する報告は過去にはない。本研究の目的は網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセルRNA-seq等)を通して妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかにすることである。本年度は筑波大学附属病院、および茨城県内の共同研究施設において診断・治療が行われた妊娠関連乳癌の臨床情報・FFPE検体の収集および核酸(DNA, RNA)抽出を行なった。現時点で妊娠期乳癌10例、授乳期乳癌17例、年齢および臨床的サブタイプをmatchさせた非妊娠関連乳癌27例の検体収集が終了している。今後、nCounterによる遺伝子発現解析、および全エクソン解析による遺伝子変異解析を行い、bulkでの解析を進めると同時に新規発生の妊娠関連乳癌についても検体の収集を進める予定である。その後、妊娠関連乳癌の検体を用いたシングルセルRNA-seq解析または空間的トランスクリプトーム解析を実施する予定である。当初シングルセルRNA-seqを施行する予定であったが、癌組織のheterogeneityも考慮するとFFPE検体を用いた空間的トランスクリプトーム解析も検討され、現在実験環境の整備を行っている。それらのデータとbulkの解析結果をまとめ、 妊娠関連乳癌の分子学的特徴を明らかにする。

与妊娠相关的乳腺癌是一种预后不佳的疾病，但是尽管有几份有关与妊娠相关乳腺癌的分子特征的报道，但总体上很少有数据，并且没有关于与妊娠相关乳腺癌的遗传分析的报道，尤其是在日本患者中。这项研究的目的是通过全面的遗传分析（基因表达分析，躯体突变分析，单细胞RNA-Seq等）阐明与妊娠相关乳腺癌的临床和分子特征。今年，有关妊娠相关乳腺癌，收集的FFPE标本以及提取的核酸（DNA，RNA）的临床信息，核酸（DNA，RNA）在库库巴大学医院诊断和治疗，并在Ibaraki preftect的联合研究设施中进行了诊断和治疗。迄今为止，已经完成了10种怀孕乳腺癌，17种乳腺癌和27种与临床亚型相匹配的标本。将来，我们计划使用所有外显子分析使用NCOUNTER和基因突变分析基因表达，并使用批量进行分析，同时还为新开发的与妊娠相关的乳腺癌收集标本。单细胞RNA-seq分析或空间转录组分析将使用与妊娠相关乳腺癌的标本进行。尽管最初计划执行单细胞RNA-seq，但考虑到癌症组织的异质性，还研究了使用FFPE标本的空间转录组分析，目前正在开发实验环境。总结了这些数据和大量分析结果，以揭示与妊娠相关乳腺癌的分子特征。