妊娠関連乳癌の病態解明と治療ターゲット探索を目指した網羅的遺伝子解析

全面的遗传分析旨在阐明妊娠相关乳腺癌的病理学并寻找治疗靶点

• 批准号: 22K20783
• 负责人: 橋本 幸枝
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20783/
• 关键词: 妊娠関連乳癌; 遺伝子発現解析; 体細胞変異解析; 網羅的遺伝子解析; シングルセルRNA-seq

妊娠関連乳癌は予後不良な疾患であるが、妊娠関連乳癌の分子学的特徴に関して、過去にいくつか報告はあるものの総じてデータは少なく、特に日本人における妊娠関連乳癌の遺伝子解析に関する報告は過去にはない。本研究の目的は網羅的遺伝子解析(遺伝子発現解析・体細胞変異解析・シングルセルRNA-seq等)を通して妊娠関連乳癌の臨床・分子学的特徴を明らかにすることである。本年度は筑波大学附属病院、および茨城県内の共同研究施設において診断・治療が行われた妊娠関連乳癌の臨床情報・FFPE検体の収集および核酸(DNA, RNA)抽出を行なった。現時点で妊娠期乳癌10例、授乳期乳癌17例、年齢および臨床的サブタイプをmatchさせた非妊娠関連乳癌27例の検体収集が終了している。今後、nCounterによる遺伝子発現解析、および全エクソン解析による遺伝子変異解析を行い、bulkでの解析を進めると同時に新規発生の妊娠関連乳癌についても検体の収集を進める予定である。その後、妊娠関連乳癌の検体を用いたシングルセルRNA-seq解析または空間的トランスクリプトーム解析を実施する予定である。当初シングルセルRNA-seqを施行する予定であったが、癌組織のheterogeneityも考慮するとFFPE検体を用いた空間的トランスクリプトーム解析も検討され、現在実験環境の整備を行っている。それらのデータとbulkの解析結果をまとめ、 妊娠関連乳癌の分子学的特徴を明らかにする。

妊娠相关乳腺癌是一种预后较差的疾病，但过去虽然有一些关于妊娠相关乳腺癌分子特征的报道，但普遍数据较少，特别是目前还没有关于妊娠相关乳腺癌分子特征的报道。日本患者妊娠相关乳腺癌的基因分析尚无。本研究的目的是通过综合遗传分析（基因表达分析、体细胞突变分析、单细胞RNA-seq等）阐明妊娠相关乳腺癌的临床和分子特征。今年，我们收集了筑波大学医院和茨城县联合研究机构诊断和治疗的妊娠相关乳腺癌的临床信息和 FFPE 标本，并提取了核酸（DNA、RNA）。目前已完成年龄和临床亚型匹配的10例妊娠相关乳腺癌、17例哺乳相关乳腺癌、27例非妊娠相关乳腺癌的标本采集。未来，我们计划使用nCounter进行基因表达分析，使用全外显子分析进行基因突变分析，并进行批量分析，以及收集新发生的妊娠相关乳腺癌的标本。之后，我们计划利用妊娠相关乳腺癌样本进行单细胞RNA-seq分析或空间转录组分析。最初我们计划进行单细胞RNA-seq，但考虑到癌组织的异质性，我们也考虑使用FFPE标本进行空间转录组分析，目前正在准备实验环境。我们将总结这些数据和批量分析结果，以阐明妊娠相关乳腺癌的分子特征。