黒毛和種遺伝子発現のDNAマイクロアレーによる解析

使用 DNA 微阵列分析日本黑毛基因表达

基本信息

批准号：
14656105
负责人：
辻荘一
金额：
$ 1.98万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

家畜のゲノム研究は急速に発展し、ウシ全ゲノム配列が決定されようとしている。この段階に来て、家畜の経済的な形質に関連する全遺伝子を把握し、家畜の選抜や効率の良い生産を目指す学問が台頭してきた。それが、バイオインフォマティックスである。このバイオインフォマティックス研究にはマイクロアレーを利用した、網羅的・総合的な遺伝子解析が必要となる。我々は、オーストラリアのCooperative Research Center for Cattle and Beef Quality (CRCMQ)、CSIROと共同で、牛肉の肉質の改善に係わる遺伝子を発見するためのcDNAマイクロアレーの製作と、それを用いた分析に取り組んできた。実際には裾、神戸大学農学部附属農場にて、黒毛和種、ホルスタイン種、両者の一代雑種、夫々3頭を供試し、経時的にロース部分の筋肉(約1g)を生体より採取し、mRNAの分析、アミノ酸組成の分析、脂肪酸組成の分析等に取り組んだ。mRNAの分析ではこれらの経時的に採取したサンプルと屠殺時に採取したサンプルとを9、000種類の遺伝子を貼り付けたcDNAマイクロアレーによって分析した。マイクロアレーの作成と分析はオーストラリア側が行った。その結果、肥育開始直後の10ヶ月齢付近で、品種間で著しく異なる遺伝子が、多数発見された。そのうちの一つは、以前から見当をつけていた遺伝子、Stearoyl coAdesaturase (SCD)で、この遺伝子が、牛肉の品質の指標になる事が改めて確認された。また、その他多数の遺伝子が発見されているので、今後はSCD以外の個々の遺伝子一つずつについて、Real-time PCR法などによって経時的に分析に、複数の遺伝子の経時的な動態が黒毛和種の肉質の改善にどのように係わっているかを明らかにしてゆく。この研究によって、何時の時期にどの遺伝子を指標にして調べれば、屠殺時の肉質の指標となるか、肉質改善の目標として、どのような遺伝子を対象にすれば肉質の改善が図れるかが明らかになろうとしていて、極めて期待の大きい成果が得られている。次いで、8頭の黒毛和種を供試し、ビタミンA濃度の肉質に関する影響を分析中で、ビタミンAの肉質に関わる遺伝子に及ぼす影響の発現解析が可能になる。

家畜基因组研究进展迅速，整个牛基因组序列即将确定。现阶段，科学已经出现，旨在了解与牲畜经济性状相关的所有基因，并对其进行选择和有效生产。那就是生物信息学。这项生物信息学研究需要利用微阵列进行全面、全面的遗传分析。我们正在与澳大利亚牛和牛肉质量合作研究中心 (CRCMQ) 和 CSIRO 合作创建 cDNA 微阵列，并利用它进行分析，以发现与改善牛肉质量有关的基因。事实上，神户大学农学院附属农场长期从活体中采集了三块腰肉（约1克），我们对氨基酸组成、氨基酸组成、脂肪酸组成等进行了分析。。对于 mRNA 分析，使用包含 9,000 个不同基因的 cDNA 微阵列对一段时间内采集的样本和屠宰时采集的样本进行分析。澳大利亚方面进行了微阵列的创建和分析。结果，在育肥开始后 10 个月左右时，发现了许多基因在品种之间存在显着差异。其中一个基因是硬脂酰辅酶去饱和酶（SCD），这个基因被怀疑了一段时间，现在再次证实这个基因是牛肉品质的指标。此外，随着许多其他基因的发现，Kuroge和Kazu将继续使用实时PCR方法等分析除SCD之外的单个基因，以确定多个基因随时间的动态变化，我们将阐明它是如何进行的。参与改善种子的肉质。这项研究阐明了应该在什么时间研究哪些基因作为屠宰时肉质的指标，以及应该针对哪些基因来改善肉质。我们正在努力实现这一目标，并且正在取得非常有希望的结果。接下来，将对八头日本黑牛进行测试，分析维生素 A 浓度对肉质的影响，这将能够表达分析维生素 A 对肉质相关基因的影响。