黒毛和種遺伝子発現のDNAマイクロアレーによる解析

使用 DNA 微阵列分析日本黑毛基因表达

基本信息

批准号：
14656105
负责人：
辻荘一
金额：
$ 1.98万
依托单位：
Kobe University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

家畜のゲノム研究は急速に発展し、ウシ全ゲノム配列が決定されようとしている。この段階に来て、家畜の経済的な形質に関連する全遺伝子を把握し、家畜の選抜や効率の良い生産を目指す学問が台頭してきた。それが、バイオインフォマティックスである。このバイオインフォマティックス研究にはマイクロアレーを利用した、網羅的・総合的な遺伝子解析が必要となる。我々は、オーストラリアのCooperative Research Center for Cattle and Beef Quality (CRCMQ)、CSIROと共同で、牛肉の肉質の改善に係わる遺伝子を発見するためのcDNAマイクロアレーの製作と、それを用いた分析に取り組んできた。実際には裾、神戸大学農学部附属農場にて、黒毛和種、ホルスタイン種、両者の一代雑種、夫々3頭を供試し、経時的にロース部分の筋肉(約1g)を生体より採取し、mRNAの分析、アミノ酸組成の分析、脂肪酸組成の分析等に取り組んだ。mRNAの分析ではこれらの経時的に採取したサンプルと屠殺時に採取したサンプルとを9、000種類の遺伝子を貼り付けたcDNAマイクロアレーによって分析した。マイクロアレーの作成と分析はオーストラリア側が行った。その結果、肥育開始直後の10ヶ月齢付近で、品種間で著しく異なる遺伝子が、多数発見された。そのうちの一つは、以前から見当をつけていた遺伝子、Stearoyl coAdesaturase (SCD)で、この遺伝子が、牛肉の品質の指標になる事が改めて確認された。また、その他多数の遺伝子が発見されているので、今後はSCD以外の個々の遺伝子一つずつについて、Real-time PCR法などによって経時的に分析に、複数の遺伝子の経時的な動態が黒毛和種の肉質の改善にどのように係わっているかを明らかにしてゆく。この研究によって、何時の時期にどの遺伝子を指標にして調べれば、屠殺時の肉質の指標となるか、肉質改善の目標として、どのような遺伝子を対象にすれば肉質の改善が図れるかが明らかになろうとしていて、極めて期待の大きい成果が得られている。次いで、8頭の黒毛和種を供試し、ビタミンA濃度の肉質に関する影響を分析中で、ビタミンAの肉質に関わる遺伝子に及ぼす影響の発現解析が可能になる。

牲畜基因组研究正在迅速发展，将确定整个牛基因组序列。在此阶段，学者已经出现了，以了解与牲畜经济特征相关的所有基因，并旨在选择牲畜并有效地生产它们。那就是生物信息学。这项生物信息学研究需要使用微阵列进行全面和全面的遗传分析。我们一直在与澳大利亚牛与牛肉质量研究中心（CRCMQ）和CSIRO合作，以创建和分析cDNA微阵列，以发现涉及改善牛肉肉质量并使用它们的基因。实际上，在农场附属的农场，科比大学，日本黑品种，荷斯坦物种，荷斯坦物种和一代混合体的农场进行了测试，并且随着时间的流逝，从生物的生物体中收集了三个头，并且随着时间的流逝，loin的肌肉从生物酸分析中收集了loin的肌肉，以及分析的粉料酸的构成。在对mRNA的分析中，通过cDNA微阵列分析了带有9,000个基因的cDNA微阵列分析的这些样品。微阵列是由澳大利亚方面创建和分析的。结果，在肥大开始后，大约10个月大左右发现了许多在品种之间存在显着差异的基因。其中之一是我们以前已经鉴定出的基因，即硬脂蛋白甲状腺果酶（SCD），该基因再次被证实，该基因是牛肉质量的指标。此外，已经发现了许多其他基因，将来我们将使用实时PCR方法等时间分析SCD以外的每个基因，以阐明多个基因随时间的动态如何与改善日本黑豆物种的肉质质量有关。这项研究旨在阐明哪些基因应在何时何时和哪个时间来调查以成为屠宰肉质的指标，以及哪种基因可用于改善肉质质量，以改善肉质质量的目标，从而产生极高的期望。接下来，测试了8种日本黑人日本物种，并分析了维生素A浓度对肉质质量的影响，从而分析了维生素A对肉质涉及基因的影响的表达。