臍帯血移植後のGVHD発症に関与するmiRNAとその標的遺伝子の同定
脐带血移植后 GVHD 发生过程中相关 miRNA 及其靶基因的鉴定
基本信息
- 批准号:19659240
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
当初の計画では、臍帯血移植に伴うGVHD発症時と治癒時のペアサンプルについて、(1)miRNAの発現プロファイルの解析により、GVHDに伴い発現が変化するmiRNAを同定し、(2)標的遺伝子予測プログラムにより標的転写調節因子候補を絞り込み、(3)同時に行うmRNAの発現プロファイルからモデル計算により得られる転写調節因子の発現・作用プロファイルとの照合により、GVHDの病態形成への関与が大きい転写調節因子およびmiRNA候補を抽出するはずであった。ところが、H20年度となり、サンプルがなかなか集まらなくなった。集まった少数例のサンプルについて、miRNAの発現プロファイルから得られた標的転写調節因子候補群と、mRNAの発現プロファイルから得られた転写調節因子作用プロファイルとの照合を行ったが、やはり統計的に評価しうる結果が得られなかった。そこで、miRNAとmRNAの対数発現強度比データを直接合わせてクラスター分析を行ってみたが、統計的に有意な結果が得られなかった。そのため、in vitroでの実験に変更し、臍帯血と正常人末梢血中の単核球各分画について炎症刺激に伴うmiRNAおよびmRNAの発現プロファイルを比較検討することにした。所内倫理委員会による承認後、サンプルの収集を開始し、平成21年3月末現在、臍帯血については16検体、正常人末梢血については11検体得られ、処理を進めている。これまでにmiRNAのreal time PCRを一部、施工しているが、処理数が非常に多いため、いまだ完了していない。最終的に統計解析を終了した段階で論文投稿する予定である。
最初的计划是(1)分析 miRNA 表达谱,以确定其表达随 GVHD 变化的 miRNA,以及(2)使用与脐带血移植相关的 GVHD 发病和愈合的配对样本来预测靶基因,以编程方式靶向转录调节因子。 (3)通过将mRNA表达谱与通过模型计算获得的转录调节因子的表达和作用谱进行比较,提取候选转录调节因子和miRNA候选物。 。然而,到了2008年,样本采集变得困难起来。对于少量收集的样本,我们将从 miRNA 表达谱获得的靶转录调节因子候选组与从 mRNA 表达谱获得的转录调节因子作用谱进行比较,但仍难以进行统计评估,没有获得结果。因此,我们直接结合miRNA和mRNA的对数表达强度比数据进行聚类分析,但没有得到统计学上显着的结果。因此,我们决定改为体外实验,比较检查脐带血和正常人外周血中各单核细胞组分与炎症刺激相关的miRNA和mRNA表达谱。经机构伦理委员会批准后,开始样本采集,截至2009年3月底,已获取脐带血样本16份、正常人外周血样本11份,正在处理中。到目前为止,已经进行了一些针对miRNA的实时PCR,但由于流程较多,尚未完成。我们计划在最终完成统计分析后提交一篇论文。
项目成果
期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Gene-expression profiles of peripheral blood mononuclear cell subpopulations in acute graft-vs-host disease following cord blood transplantation
- DOI:10.1016/j.exphem.2008.07.007
- 发表时间:2008-12-01
- 期刊:
- 影响因子:2.6
- 作者:Takahashi, Naoyuki;Sato, Noriharu;Tojo, Arinobu
- 通讯作者:Tojo, Arinobu
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