ヒト全ゲノムタイリングアレイを用いた骨軟骨細胞分化研究の新戦略

使用人类全基因组平铺阵列进行骨软骨细胞分化研究的新策略

基本信息

批准号：
18659452
负责人：
今村健志
金额：
$ 2.11万
依托单位：
Japanese Foundation For Cancer Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18659452/
关键词：
マイクロアレイ整理活性シグナル伝達発現制御細胞・組織

项目摘要

Transforming growth factor-β(TGF-β)は発生・分化から癌・炎症性疾患の病態に至るまで、広範な作用を持つサイトカインである。また、TGF-βは骨・軟骨組織に多く存在し、軟骨細胞や骨芽細胞の分化を制御している。これまでにDNAマイクロアレイの活用により、骨・軟骨細胞分化におけるTGF-βの標的遺伝子の同定がおこなわれ、骨・軟骨細胞分化の鍵となる様々な遺伝子が明らかにされつつあるが、未だその全貌は明らかでない。一方で、最近miRNAなどの発見により、蛋白質をコードする転写産物を大きく上回るnon-coding RNAが存在し、シグナル伝達系において重要な機能を果たしていることが明らかとなってきた。従って、骨軟骨細胞分化においても、旧来のDNAアレイでは評価できなかったこれらの標的を含めて発現解析をおこなうことは、TGF-βの真の作用メカニズムを把握する上で欠かせない課題といえる。本研究では、ヒト全ゲノムタイリングアレイを用いた、ChIP-on-chip法によるTGF-β反応性転写領域の網羅的解析を行い、ヒト間葉系幹細胞のTGF-β刺激時の正常な転写プロファイルをヒト上皮細胞のそれと比較し、ヒト間葉系幹細胞の骨・軟骨細胞分化におけるTGF-βシグナルの下流のnon-coding RNAの役割を明らかにすることを目的に研究をおこなった。具体的には、ヒト全ゲノムタイリングアレイを用いた、TGF-βシグナル伝達分子Smad2/3のゲノム上の結合部位の同定に成功した。

转化生长因子-β (TGF-β) 是一种细胞因子，具有广泛的作用，从发育和分化到癌症和炎症性疾病的病理学。此外，TGF-β在骨和软骨组织中含量丰富，并控制软骨细胞和成骨细胞的分化。迄今为止，通过DNA微阵列已经确定了TGF-β在骨和软骨细胞分化中的靶基因，并且正在阐明对骨和软骨细胞分化至关重要的各种基因，但完整的情况仍不清楚。清除。另一方面，最近的发现（例如miRNA）揭示了非编码RNA的存在，远远超过了蛋白质编码转录本，并且在信号转导系统中发挥着重要功能。因此，在骨软骨细胞分化中，对这些无法使用传统 DNA 阵列进行评估的靶点进行表达分析是了解 TGF-β 真正作用机制的一项重要任务。在本研究中，我们利用人类全基因组平铺阵列，利用 ChIP-on-chip 对 TGF-β 反应性转录区域进行了全面分析，并确定了人类间充质干细胞在 TGF-β 刺激过程中是否发生正常转录的目的。本研究的目的是将其与人上皮细胞的概况进行比较，并阐明TGF-β信号下游的非编码RNA在人间充质干细胞的骨软骨细胞分化中的作用。具体来说，我们使用人类全基因组平铺阵列成功鉴定了基因组上 TGF-β 信号分子 Smad2/3 的结合位点。

项目成果

期刊论文数量（4）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

DOI：
{{ item.doi }}
发表时间：
{{ item.publish_year }}
期刊：
{{ item.journal_name }}
影响因子：
{{ item.factor }}
作者：
{{ item.authors }}
通讯作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ journalArticles.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ monograph.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ sciAawards.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ conferencePapers.updateTime }}

作者：
{{ item.author }}

数据更新时间：{{ patent.updateTime }}

今村健志其他文献

生命のダイナミズム・不均一性・確率性・〜個体で細胞を「みて」「知る」-

生命的动态性、异质性和随机性——“看到”和“了解”细胞作为个体——

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
影响因子：
0
作者：
中島利博;八木下尚子他2名;Ito I et al.;Kimura A et al.;Kashiwagi Y et al.;Hanyu A et al.;Koinuma D at al.;Kido S et al.;Nakano A et al.;Takahata et al.;Tominaga H et al.;Horiguchi K et al.;Koinuma D et al.;Yuzawa H et al.;Fuknnaga E et al.;Tominaga H et al.;Inoue Y et al.;Katsuno Y et al.;今村健志;今村健志;今村健志;今村健志;今村健志;Takeshi Imamura;Takeshi Imamura;今村健志;今村健志;今村健志
通讯作者：
今村健志