イメージングマスによる肺癌及び特発性肺線維症の発症・進展の分子機構に関する検討

利用影像质量研究肺癌及特发性肺纤维化发病进展的分子机制

• 批准号: 17659244
• 负责人: 柳澤 聖
• 金额: $ 1.54万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17659244/
• 关键词: プロテオミクス; バイオインフォマティクス; 質量分析器; 発現プロファイリング; ヒト肺癌; バイオマーカー; イメージング; 難治性呼吸器疾患

ヒト肺癌の発症・進展の分子機構の解明に寄与する事を目指して、本年度は以下の成果を得た。1.マトリクス支援レーザー脱離イオン化質量分析器(MALDI MS)を応用し、174症例の非小細胞肺癌(NSCLC)から手術摘出された腫瘍組織(training cohort;116検体,test cohort 58検体)及び正常肺組織(27検体)計201検体を用いた直接的網羅的タンパク発現プロファイル解析を遂行し、training cohortにおける検討結果から、2600種類以上の異なるタンパク発現情報を取得した。2.取得したタンパク発現情報に基づき、NSCLC術後予後予測を可能とするプロファイルの抽出を、バイオインフォマティクス手法を最大限に活用する事により行い、NSCLC術後予後に有意に関連の認められる178個のタンパクからなる発現プロファイルを見出した。3.上述の予後関連タンパク発現プロファイルに基づき、NSCLC術後予後予測モデルの構築を目指し、weighted voting法を応用し、10-fold cross validationによるモデル最適化を行った結果、25個のシグナルを用いた予測モデルの構築に至った。この予測モデルの汎用性の検証を、58症例からなるtest cohortから取得されたデータセットを用いて行った結果、予測モデルを用いた判別に基づくoverall survivalは、High-risk群(中間生存=24か月)と、Low-risk群(中間生存=未達)との間で統計的学的有意差を認め(P<0.001)、その高い予測精度が独立したデータセットにおいても確認された。これらの成果は、MALDIMSを用いたタンパク発現プロファイル解析が、臨床試料に応用可能であり、予防・診断・治療法の開発に向けた分子標的の探索に有用である可能性を示すものと考えた。

今年获得了以下结果，目的是促进人类肺癌发作和进展的分子机制。 1。矩阵支持激光戒断离子，比较数量分析仪（MALDI MS），并已从174例非small细胞肺癌（NSCLC）（训练队列； 116个样品，测试队列58个样品）中去除组织（27个样本）总计进行直接全面的蛋白质表达谱分析，并从训练队列中的研究结果中获得了2600多种不同的蛋白质表达信息。 2。基于获得的蛋白质表达信息，通过最大化bioginphomatics方法进行术后预测的轮廓提取，并与术后NSCLC手术显着相关。 3。基于上述预后相关的蛋白质表达谱，目的是在手术后构建术后预测模型，因此使用了加权投票方法，并通过25个信号通过10倍的交叉验证来优化该模型。该建筑已建造。由于使用从测试队列获得的数据集，该数据集是基于预测模型的58个情况，基于预测模型。中间生存=不允许）（p <0.001），并且在数据集中也以独立的预测准确性进行了确认。这些结果认为，使用Maldims的蛋白质分析可以应用于临床试验，并且可能有助于寻找预防，诊断和治疗方法的分子靶标。

项目成果

Proteomic patterns of preinvasive bronchial lesions

• DOI: 10.1164/rccm.200502-274oc
• 发表时间: 2005-12-15
• 期刊: AMERICAN JOURNAL OF RESPIRATORY AND CRITICAL CARE MEDICINE
• 影响因子: 24.7
• 作者: Rahman, SMJ;Shyr, Y;Massion, PP
• 通讯作者: Massion, PP

Altered regulation of c-jun and its involvement in anchorage-independent growth of human lung cancers

c-jun 调节的改变及其参与人类肺癌的锚定非依赖性生长

• 发表时间: 2006
• 期刊: Oncogene 25
• 作者: Maeno;K.;Masuda;A.;Yanagisawa;K.;Konishi;H.;Osada;H.;Saito;T.;Ueda;R.,;Takahashi;T.
• 通讯作者: T.

Reduced expression of Dicer associated with poor prognosis in lung cancer patients

• DOI: 10.1111/j.1349-7006.2005.00015.x
• 发表时间: 2005-02-01
• 期刊: CANCER SCIENCE
• 影响因子: 5.7
• 作者: Karube, Y;Tanaka, H;Takahashi, T
• 通讯作者: Takahashi, T

Identification of a metastasis signature and the DLX4 homeobox protein as a regulator of metastasis by combined transcrintome approach.

通过联合转录组方法鉴定转移特征和作为转移调节因子的 DLX4 同源框蛋白。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Oncogene (in press)
• 作者: Matsuno;Kuniharu;松原 弘明;松原 弘明;松原 弘明;Matsubara H et al.;Tomida S et al.
• 通讯作者: Tomida S et al.

Thioredoxin-1 modulates transcription of cyclooxygenase-2 via hypoxia-inducible factor-1alpha in non-small cell lung cancer

硫氧还蛋白-1 通过缺氧诱导因子-1α 在非小细胞肺癌中调节环氧合酶-2 的转录

• 发表时间: 2006
• 期刊: Cancer Research 66・1
• 作者: Matsuno;Kuniharu;松原 弘明;松原 弘明;松原 弘明;Matsubara H et al.;Tomida S et al.;Yang L et al.;Takeuchi T et al.;Csiki I et al.;Maeno K et al.;Csiki I
• 通讯作者: Csiki I