フザリウム病原菌の分生胞子形成時における発現遺伝子群のカタログ化

镰孢菌病原体分生孢子形成过程中表达的基因编目

• 批准号: 16658019
• 负责人: 柘植 尚志
• 金额: $ 2.37万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16658019/
• 关键词: 植物病原糸状菌; Fusarium oxysporum; 胞子形成関連遺伝子; EST解析; 転写制御因子

土壌伝染性糸状菌Fusarium oxysporumは、小型胞子、大型胞子および厚膜胞子の3種の分生(無性)胞子を形成し、これらが自然界での伝染源、耐久生存器官として重要な機能を果たしている。本菌は、栄養豊富な完全培地では胞子を形成しないが、カルボキシメチルセルロース(CMC)を唯一の炭素源とする培地では、ほとんど菌糸生育せず、小型胞子と大型胞子を大量に形成する。本研究では、両培養条件下でのEST(expressed sequence tag)解析に基づき、胞子形成時特異的な遺伝子群を同定するとともに、それら遺伝子の胞子形成変異株における発現解析によって、発現遺伝子群のカタログ化を行った。研究成果の概要は以下のとおりである。1.完全培地培養時とCMC培地培養時のEST解析によって、それぞれ約540個の異なる遺伝子由来のcDNAクローンを同定した。データベース相同性解析によってこれらクローンを推定機能別に分類したところ、半数以上が機能未知の新規遺伝子であることが明らかとなった。さらに、両ライブラリーを比較したところ、共通なクローンは約20%であり、栄養成長時と胞子形成時の発現遺伝子群が顕著に異なることが明らかとなった。2.リアルタイムRT-PCR法によって、CMC培地培養時に特異的に高発現する173クローンを選抜した。さらに、これらクローンについて、胞子形成に関与する2つの転写制御遺伝子(REN1およびFoSTUA)の変異株における発現を野生株と比較解析し、両遺伝子が発現制御する遺伝子群を同定した。以上の結果に基づき、胞子形成時の発現遺伝子群をそれらの推定機能、栄養成長時と胞子形成時の発現レベル、REN1またはFoSTUAによる制御の有無などの項目についてカタログ化した。

土壤感染的丝状真菌氧气孢子形成了三种类型的先天性（无性）孢子：小孢子，大孢子和clastulus孢子，它们是自然界感染和耐用器官的来源。该细菌不会在完全富含营养的培养基中形成孢子，而是在含有羧甲基纤维素（CMC）的培养基中作为唯一的碳源，它几乎不会生长菌丝体，并形成大量的大小孢子。在这项研究中，我们在两种培养条件下使用EST（表达的序列标签）分析在孢子形成过程中鉴定了特异性的基因组，并通过对孢子形成突变体中这些基因的表达分析来分类表达的基因组。研究结果的概述如下。 1。在完整的培养基和CMC培养基期间，通过EST分析鉴定出源自大约540个不同基因的cDNA克隆。当这些克隆通过数据库同源性分析通过预测函数进行分类时，揭示了其中一半以上是具有未知功能的新基因。此外，在比较两个文库时，发现大约20％的克隆是常见的，并且在营养生长和孢子形成过程中表达的基因组显着差异。 2。通过实时RT-PCR选择了在CMC培养基期间高度表达的173个克隆。此外，对于这些克隆，将两个转录调节基因与突变菌株（REN1和FOSTUA）涉及突变菌株（Ren1和Fostua）的表达与野生菌株的表达进行了比较，并鉴定了两个基因调节表达的基因组。基于上述结果，在孢子形成时的预测功能，营养生长时和孢子形成时表达水平以及是否由Ren1或Fostua控制，对孢子形成时的表达基因组进行了分类。

项目成果

植物感染生理談話会論文集(第40号)自他識別と応答のバイオフロンティア(羽柴輝良, 高橋英樹編)

植物感染生理学研讨会论文集（第40期）自我他人识别和反应的Biofrontier（由Teruyoshi Hashiba和Hideki Takahashi编辑）

• 发表时间: 2004
• 作者: Matsumoto;S.;K.Kitahara;H.Komatsu;K.Abe;K.Tsutsui;D.X.Li et al.;Yasukouchi A;K.Ukena et al.;柘植尚志
• 通讯作者: 柘植尚志

REN1 is required for development of microconidia and macroconidia, but not of chlamydospores, in the plant pathogenic fungus Fusarium oxysporum

• DOI: 10.1534/genetics.166.1.113
• 发表时间: 2004-01-01
• 期刊: GENETICS
• 影响因子: 3.3
• 作者: Ohara, T;Inoue, I;Tsuge, T
• 通讯作者: Tsuge, T

FoSTUA, encoding a basic helix-loop-helix protein, differentially regulates development of three kinds of asexual spores, macroconidia, microconidia, and chlamydospores, in the fungal plant pathogen Fusarium oxysporum

• DOI: 10.1128/ec.3.6.1412-1422.2004
• 发表时间: 2004-12-01
• 期刊: EUKARYOTIC CELL
• 作者: Ohara, T;Tsuge, T
• 通讯作者: Tsuge, T