振幅可変型水晶発振子を用いる複雑系タンパク質間相互作用の解明
使用可变振幅晶体振荡器阐明复杂的蛋白质-蛋白质相互作用
基本信息
- 批准号:16655066
- 负责人:
- 金额:$ 2.11万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
- 财政年份:2004
- 资助国家:日本
- 起止时间:2004 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
申請者らはこれまでに、水晶発振子の振動数がその電極上に結合する質量に比例して減少する(-1Hz=0.62ng cm-2)ことを利用して、様々な生体分子間相互作用の定量的解析を行ってきた。これまでは、水晶発振子の電圧を一定にして物質の結合による振動数の減少を見てきたが、本研究では、発振させる電圧を変化させることにより振幅を変化させ、結合している物質の解離と結合を制御できることを利用して、細胞内の複雑系タンパク質の相互作用の解析を定量的に行うことを目的にして研究を行い、以下の成果を得た。DNAポリメラーゼはテンプレート鎖に沿ってDNAを伸長する酵素であるが、ポリメラーゼはDNA鎖に横から挟み込むように結合しているだけであるので、それ単独ではDNA鎖を長く伸長できない。生体ではクランプとクランプローダーといわれるタンパク質と複合体を作ることによりポリメラーゼをはずれにくくし、長いDNA鎖を伸長できるようにしていると考えられている。水晶発振子の表面にDNA鎖とポリメラーゼ複合体を固定化し、振動電圧を3Vから5Vに増加させることにより振幅を大きくした。このことにより、弱く相互作用していたクランプやクランプローダーがDNA鎖から離れ、振幅を下げると可逆的に再結合する現象が水晶発振子の振動数変化から観察できた。このことからDNAポリメラーゼ複合体の結合の強さを定量化する事ができ、タンパク質複合体の再構築の制御が水晶発振子の振幅からできることがわかった。
到目前为止,申请人已经利用晶体振荡器的频率与与其电极结合的质量成比例降低的事实(-1Hz=0.62ng cm-2)研究了各种生物分子之间的相互作用,并对其效应进行了定量分析。已进行。到目前为止,我们已经通过保持晶体振荡器的电压恒定来研究由于材料键合而导致的频率降低,但在本研究中,我们将通过改变振荡电压并利用控制离解和结合的能力来改变振幅。为了定量分析细胞内复杂蛋白质的相互作用,我们进行了研究,并获得了以下结果。 DNA聚合酶是一种沿着模板链延伸DNA的酶,但由于聚合酶仅通过从侧面夹住DNA链来与DNA链结合,因此它本身无法将DNA链延伸很长。人们认为,在活生物体中,通过与称为夹钳加载器的夹子和蛋白质形成复合物,它们使聚合酶难以移动,从而使长DNA链得以延长。将DNA链和聚合酶复合物固定在晶体振荡器的表面上,通过将振荡电压从3V增加到5V来增加振幅。结果,弱相互作用的夹具和夹具加载器与DNA链分离,当振幅降低时,它们可逆地重新结合,这可以从晶体振荡器频率的变化中观察到。由此,可以定量DNA聚合酶复合物的结合强度,并且发现蛋白质复合物的重构可以通过晶体振荡器的振幅来控制。
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Adsorption behabior of poly(N-p-vinylbenzyl-4-o-beta-D-galactosyl-[1-4]-D-gluconamide) by quartz-crystal microbalance
石英晶体微天平对聚(N-对乙烯基苄基-4-o-β-D-半乳糖基-[1-4]-D-葡萄糖酰胺)的吸附行为
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:R.Takei;S.J.Seo;C.S.Cho;Y.Okahata;T.Akaike
- 通讯作者:T.Akaike
Kinetic Studies of DNA Cleavage Reactions catalyzed by an ATP-dependent Deoxyribonuclease on a 27-MHz Quartz-Crystal Microbalance
27 MHz 石英晶体微天平上 ATP 依赖性脱氧核糖核酸酶催化的 DNA 裂解反应的动力学研究
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:H.Matsuno;H.Furusawa;Y.Okahata
- 通讯作者:Y.Okahata
Kinetic Studies of Site-Direct Mutational Isomalto-dextranase Catalyzed Hydrolytic Reactions on a 27 MHz Quartz-crystal Microbalance
27 MHz 石英晶体微天平上定点突变异麦芽糖葡聚糖酶催化水解反应的动力学研究
- DOI:
- 发表时间:2005
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:T.Nihira;M.Mizuno;T.Tonozuka;Y.Sakano;T.Mori;Y.Okahata
- 通讯作者:Y.Okahata
Kinetic Study of Phosphorylation-dependent Complex Formation between the Kinase-Inducible Domain (KID) of CREB and the KIX Domain of
CREB 激酶诱导结构域 (KID) 与 KIX 结构域之间磷酸化依赖性复合物形成的动力学研究
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:H.Matsuno;H.Furusawa;Y.Okahata
- 通讯作者:Y.Okahata
Kinetic Studies of Amylopectin Cleavage Reactions Catalyzed by Phosphorylase b using a 27 MHz Quartz Crystal Microbalance
使用 27 MHz 石英晶体微天平研究磷酸化酶 b 催化的支链裂解反应的动力学
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:H.Nishino;A.Murakawa;T.Mori;Y.Okahata
- 通讯作者:Y.Okahata
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
岡畑 恵雄其他文献
図解 バイオ活用技術のすべて、DNA配向化フィルム(東工大生命理工編)
关于生物利用技术的全部图解,DNA定向胶片(东京工业大学编辑)
- DOI:
- 发表时间:
2004 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
岡畑 恵雄;川崎 剛美 - 通讯作者:
川崎 剛美
全反射蛍光顕微鏡を用いた脂質膜上での脂質分子と膜タンパク質の動的挙動解析
使用全内反射荧光显微镜分析脂质分子和脂质膜上的膜蛋白的动态行为
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
辻 健太郎;古澤 宏幸;岡畑 恵雄 - 通讯作者:
岡畑 恵雄
岡畑 恵雄的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('岡畑 恵雄', 18)}}的其他基金
振幅変動型水晶発振子を用いる複雑系タンパク質の相互作用の解明
使用可变振幅晶体振荡器阐明复杂的蛋白质相互作用
- 批准号:
14658184 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
一分子ポリマーサイエンス
单分子高分子科学
- 批准号:
13895022 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
超臨界流体中での脂質修飾酵素を用いる酵素触媒反応
在超临界流体中使用脂质修饰酶的酶催化反应
- 批准号:
13875180 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
水晶発振子を用いる分子シンクロナイゼーションの定量的評価
使用晶体振荡器定量评估分子同步
- 批准号:
13022223 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
超臨界流体中での脂質修飾酵素を用いる酵素触媒反応
在超临界流体中使用脂质修饰酶的酶催化反应
- 批准号:
12878104 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
水晶発振子を用いるバイオターゲッティングの定量的評価
使用晶体振荡器对生物靶向进行定量评估
- 批准号:
12019220 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
水晶発振子を用いるバイオターゲッティングの定量的評価
使用晶体振荡器对生物靶向进行定量评估
- 批准号:
11132215 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
大きな異方的電導性を示すDNA配向フィルムの作製
具有大各向异性电导率的 DNA 取向薄膜的制备
- 批准号:
11875204 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
配向化DNA薄膜の構築と電極反応
定向DNA薄膜的构建及电极反应
- 批准号:
11118226 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
DNA二重らせん鎖の配向固定化傾斜機能フィルム
用于固定 DNA 双螺旋链方向的功能梯度薄膜
- 批准号:
10123210 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
相似海外基金
液-液相分離により生成したタンパク質液滴内における分子間相互作用のラマン顕微解析
液-液相分离产生的蛋白质液滴内分子间相互作用的拉曼显微分析
- 批准号:
24K01505 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
新型抗腫瘍性物質が誘導する細胞骨格タンパク質間の相互作用の解析と応用
新型抗肿瘤物质诱导的细胞骨架蛋白相互作用分析及应用
- 批准号:
23K26783 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
化合物-タンパク質間相互作用予測AIモデルとドッキングシミュレーションの統合
化合物-蛋白质相互作用预测AI模型与对接模拟的集成
- 批准号:
24KJ1510 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
タンパク質間相互作用調節機能が期待される多環性天然物の効率的合成経路の開発
开发多环天然产物的有效合成路线,有望具有调节蛋白质-蛋白质相互作用的能力
- 批准号:
24K02156 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
サブタイプ選択的なタンパク質間相互作用制御を実現する植物ホルモン受容体リガンド
实现蛋白质-蛋白质相互作用亚型选择性控制的植物激素受体配体
- 批准号:
24KJ0445 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.11万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows