ラット精巣形成不全症病因遺伝子の探索:候補遺伝子検索とBACコンティグの作製

寻找导致大鼠睾丸发育不全的基因:候选基因搜索和 BAC 重叠群创建

基本信息

  • 批准号:
    12760204
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.45万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 2001
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は精巣形成不全症(HGN)ラットの原因遺伝子(hgn)を、ポジショナルクローニング法あるいはポジショナルキャンディデート法により同定しようと言うものである。本年度は、HGN系統とBrown Norway系統との間の外交配から得られたF1とHGN系統のhgn/hgnとの戻し交配で得られた約600個体の雄について、hgn遺伝子座周辺のマイクロサテライトを用いてタイピングを行い、hgn存在領域を含むファインマップを作成した。同時にRat/Hamster Radiation Hybrid Panelを用いてhgn存在領域のRHマップを作成した。これらの結果から、hgn遺伝子座がD10Rat30とD10Rat68との間の約0.36cM(22.6.cR)の領域に存在し、D10Rat69、D10Arb9(Aldo3)、およびwhn(winged helix of nude)遺伝子座と完全連鎖していることが判明した。この情報をもとに、YAC(酵母人口染色体)ライブラリーをPCRでスクリーングしたが、選択したYACライブラリーからはhgn存在領域を網羅する単一のクローンを見いだすことはできなかった。来年度は、複数のクローンによるコンティグを完成させるべくスクリーニングを行うと同時に、由来の異なるYACに関してのスクリーニングを検討している。また、ラット第10染色体のhgn存在領域と相同なマウス第11染色体上の領域にマップされている複数のEST(D11Ertd18e、D11Ertd250e、D11Ertd72eなど)あるいは機能的遺伝子(Ywhae、Supt6h、Ube2b-rs2など)について、精巣での発現の調査、シーケンス、サザンによるタイピング等を行ったが、現在までのところ有力な候補は見出されていない。来年度も引き続き候補遺伝子検索を継続する予定である。
这项研究试图使用位置克隆或位置候选方法来鉴定睾丸发育不全(HGN)大鼠的病因基因(HGN)。在今年,从HGN谱系和棕色挪威线之间的外交获得的HGN谱系中的F1和HGN/HGN之间获得的大约600名男性正在使用HGN轨迹周围的微片岩进行键入,以创建一个含有HGN Specion区域的精美地图。同时,使用大鼠/仓鼠辐射杂种面板创建了HGN存在区域的RH图。这些结果表明,HGN基因座位于D10RAT30和D10RAT68之间约0.36 cm(22.6.cr)的区域,并与D10RAT69,D10ARB9(Aldo3)(Aldo3)和WHN(裸螺旋)轨迹完全链接。基于此信息,PCR筛选了YAC(酵母菌染色体)库,但无法找到覆盖所选YAC库中HGN存在区域的单个克隆。明年,我们将筛选与多个克隆一起完成重叠群,我们还将考虑筛选不同起源的YAC。 Furthermore, multiple ESTs (such as D11Ertd18e, D11Ertd250e, D11Ertd72e) or functional genes (such as Ywhae, Supt6h, Ube2b-rs2) mapped to the region on mouse chromosome 11, which is homologous to the hgn presence region of rat chromosome 10, were investigated for expression in the testes, sequenced, and typing using Southern, but no potential candidates have被发现迄今为止。我们计划明年继续寻找候选基因。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Toshio Akimato,Hiroetsu Suzuki, et al: "Locus of Dominant Hairless Gene(Ht) Causing Abnormal Hair and Keratinization Maps to Rat Chromosome 10."Experimental Animals. 49(2). 137-140 (2000)
Toshio Akimato、Hiroetsu Suzuki 等人:“显性无毛基因 (Ht) 导致大鼠 10 号染色体异常毛发和角化图谱。”实验动物。
  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hiroetsu Suzuki, et al: "A locus responsible for osteochondrodysplasia (ocd) is located on rat Chromosome 11."Mammalian Genome. 11. 464-465 (2000)
Hiroetsu Suzuki 等人:“导致骨软骨发育不良 (ocd) 的基因座位于大鼠 11 号染色体上。”哺乳动物基因组。
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