ラット精巣形成不全症病因遺伝子の探索:候補遺伝子検索とBACコンティグの作製

寻找导致大鼠睾丸发育不全的基因:候选基因搜索和 BAC 重叠群创建

基本信息

  • 批准号:
    12760204
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.45万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    2000
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2000 至 2001
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は精巣形成不全症(HGN)ラットの原因遺伝子(hgn)を、ポジショナルクローニング法あるいはポジショナルキャンディデート法により同定しようと言うものである。本年度は、HGN系統とBrown Norway系統との間の外交配から得られたF1とHGN系統のhgn/hgnとの戻し交配で得られた約600個体の雄について、hgn遺伝子座周辺のマイクロサテライトを用いてタイピングを行い、hgn存在領域を含むファインマップを作成した。同時にRat/Hamster Radiation Hybrid Panelを用いてhgn存在領域のRHマップを作成した。これらの結果から、hgn遺伝子座がD10Rat30とD10Rat68との間の約0.36cM(22.6.cR)の領域に存在し、D10Rat69、D10Arb9(Aldo3)、およびwhn(winged helix of nude)遺伝子座と完全連鎖していることが判明した。この情報をもとに、YAC(酵母人口染色体)ライブラリーをPCRでスクリーングしたが、選択したYACライブラリーからはhgn存在領域を網羅する単一のクローンを見いだすことはできなかった。来年度は、複数のクローンによるコンティグを完成させるべくスクリーニングを行うと同時に、由来の異なるYACに関してのスクリーニングを検討している。また、ラット第10染色体のhgn存在領域と相同なマウス第11染色体上の領域にマップされている複数のEST(D11Ertd18e、D11Ertd250e、D11Ertd72eなど)あるいは機能的遺伝子(Ywhae、Supt6h、Ube2b-rs2など)について、精巣での発現の調査、シーケンス、サザンによるタイピング等を行ったが、現在までのところ有力な候補は見出されていない。来年度も引き続き候補遺伝子検索を継続する予定である。
本研究旨在利用定位克隆或定位候选方法鉴定睾丸发育不全(HGN)大鼠的致病基因(hgn)。今年,我们调查了约 600 只雄性的 hgn 基因位点周围的微卫星,这些雄性是通过将 HGN 系和布朗挪威系之间的异交获得的 F1 与 HGN 系的 hgn/hgn 进行回交而创建的,包括 HGN 区域。 。同时,我们使用大鼠/仓鼠辐射混合面板创建了 HGN 区域的 RH 地图。这些结果表明,hgn 基因座存在于 D10Rat30 和 D10Rat68 之间约 0.36 cM (22.6.cR) 的区域,并且与 D10Rat69、D10Arb9 (Aldo3) 和 whn (裸翅螺旋) 基因座完全连锁。确实如此。基于该信息,通过PCR筛选YAC(酵母人工染色体)文库,但从所选YAC文库中没有发现覆盖HGN区域的单个克隆。明年,我们将筛选多个克隆的完整重叠群,同时我们正在考虑筛选不同来源的YAC。此外,多个EST(D11Ertd18e、D11Ertd250e、D11Ertd72e等)映射到小鼠11号染色体上的一个区域,该区域与大鼠10号染色体的hgn区域同源,我们研究了睾丸中功能基因(Ywhae、Supt6h、Ube2b-rs2 等)的表达,对它们进行了测序,并进行了 Southern 分型,但迄今为止尚未发现有希望的候选基因。我们计划明年继续寻找候选基因。

项目成果

期刊论文数量(4)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Toshio Akimato,Hiroetsu Suzuki, et al: "Locus of Dominant Hairless Gene(Ht) Causing Abnormal Hair and Keratinization Maps to Rat Chromosome 10."Experimental Animals. 49(2). 137-140 (2000)
Toshio Akimato、Hiroetsu Suzuki 等人:“显性无毛基因 (Ht) 导致大鼠 10 号染色体异常毛发和角化图谱。”实验动物。
  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hiroetsu Suzuki, et al: "A locus responsible for osteochondrodysplasia (ocd) is located on rat Chromosome 11."Mammalian Genome. 11. 464-465 (2000)
Hiroetsu Suzuki 等人:“导致骨软骨发育不良 (ocd) 的基因座位于大鼠 11 号染色体上。”哺乳动物基因组。
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