マイクロサテライトＤＮＡマーカーを用いたシオミズツボワムシの遺伝的モニタリング

利用微卫星 DNA 标记对潮光轮虫进行遗传监测

基本信息

批准号：
26925023
负责人：
澤山英太郎
金额：
$ 0.32万
依托单位：
有限会社まる阿水産
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-01 至 2015-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26925023/
关键词：
シオミズツボワムシマイクロサテライトDNA クローン多様性

项目摘要

海産魚の種苗生産において初期餌料として用いられているシオミズツボワムシ(S型ワムシ)の個体数増減と遺伝的多様性についての関連を、マイクロサテライトDNAマーカーを用いたクローン解析により検討した。まず、クローン解析に必要なマイクロサテライトDNAマーカーの選定を行ったところ、4つのマイクロサテライトDNAマーカーを用いてクローン判別をすることで解析集団の全てのクローン型が特定でき、ミトコンドリアDNAのCOIハプロタイプとも一致することが分かった。次に、S型ワムシを1ヶ月間培養し、増殖良好時と培養不調時のワムシについて、ミトコンドリアDNA COI領域によるハプロタイプ解析とマイクロサテライトDNAマーカーによるクローン型解析を行った。ミトコンドリアDNA COI領域による株型判別の結果、全てのワムシはBrachionus plicatilis sp. “Cayman”と判別された。また、培養良好時には2～3種類のハプロタイプが混在していたが、培養不調時には1種類のハプロタイプのみが確認された。マイクロサテライトDNAによるクローン型解析を行ったところ、80個ものクローン型が識別された。また、培養良好時のワムシのクローン多様度は培養不調時と比べて高い傾向が見られた。以上の結果から、ワムシの培養が良好な時はワムシの遺伝的多様度が高いことが明らかとなり、ワムシの個体数増減に遺伝的要因が関与する可能性が示唆された。しかしながら、飼育環境が良好であることで隠蔽種も良好な増殖をし、その結果として遺伝的多様度が高まった可能性も否定できない。そのため、今後は本研究で見られた主要なクローン型を用い、単一クローンでの培養、ならびに複数クローンでの混合培養を行い、個体数の増減と遺伝的多様性の関係について実験的に解析していく必要がある。

我们通过使用微卫星 DNA 标记的克隆分析，研究了用作海水鱼苗生产初始饲料的潮水轮虫（S 型轮虫）的种群变化和遗传多样性之间的关系。首先，我们选择了克隆分析所需的微卫星DNA标记，通过使用四个微卫星DNA标记来区分克隆，我们能够识别分析群体中的所有克隆类型，并将它们鉴定为线粒体DNA COI单倍型。他们匹配。接下来，将S型轮虫培养1个月，对生长良好时和培养不良时的轮虫进行使用线粒体DNA COI区域的单倍型分析和使用微卫星DNA标记的克隆类型分析。使用线粒体 DNA COI 区域进行菌株分型的结果是，所有轮虫均被鉴定为褶皱臂尾轮虫“Cayman”。此外，当培养成功时，两到三种类型的单倍型一起存在，但当培养不成功时，仅确认一种类型的单倍型。使用微卫星 DNA 进行克隆类型分析，鉴定出多达 80 种克隆类型。此外，与培养不良时相比，培养良好时轮虫的克隆多样性往往更高。上述结果表明，当轮虫培养良好时，轮虫的遗传多样性较高，提示遗传因素可能参与了轮虫种群的增加或减少。然而，不可否认的是，有利的饲养环境可能使隐秘物种得以有利地增殖，从而增加了遗传多样性。因此，今后我们将利用本研究发现的主要克隆类型来培养单个克隆以及多个克隆的混合培养物，并通过实验分析种群增加/减少与遗传多样性之间的关系是必要的。。