マイクロサテライトＤＮＡマーカーを用いたシオミズツボワムシの遺伝的モニタリング

利用微卫星 DNA 标记对潮光轮虫进行遗传监测

基本信息

批准号：
26925023
负责人：
澤山英太郎
金额：
$ 0.32万
依托单位：
有限会社まる阿水産
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
财政年份：
2014
资助国家：
日本
起止时间：
2014-04-01 至 2015-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-26925023/
关键词：
シオミズツボワムシマイクロサテライトDNA クローン多様性

项目摘要

海産魚の種苗生産において初期餌料として用いられているシオミズツボワムシ(S型ワムシ)の個体数増減と遺伝的多様性についての関連を、マイクロサテライトDNAマーカーを用いたクローン解析により検討した。まず、クローン解析に必要なマイクロサテライトDNAマーカーの選定を行ったところ、4つのマイクロサテライトDNAマーカーを用いてクローン判別をすることで解析集団の全てのクローン型が特定でき、ミトコンドリアDNAのCOIハプロタイプとも一致することが分かった。次に、S型ワムシを1ヶ月間培養し、増殖良好時と培養不調時のワムシについて、ミトコンドリアDNA COI領域によるハプロタイプ解析とマイクロサテライトDNAマーカーによるクローン型解析を行った。ミトコンドリアDNA COI領域による株型判別の結果、全てのワムシはBrachionus plicatilis sp. “Cayman”と判別された。また、培養良好時には2～3種類のハプロタイプが混在していたが、培養不調時には1種類のハプロタイプのみが確認された。マイクロサテライトDNAによるクローン型解析を行ったところ、80個ものクローン型が識別された。また、培養良好時のワムシのクローン多様度は培養不調時と比べて高い傾向が見られた。以上の結果から、ワムシの培養が良好な時はワムシの遺伝的多様度が高いことが明らかとなり、ワムシの個体数増減に遺伝的要因が関与する可能性が示唆された。しかしながら、飼育環境が良好であることで隠蔽種も良好な増殖をし、その結果として遺伝的多様度が高まった可能性も否定できない。そのため、今後は本研究で見られた主要なクローン型を用い、単一クローンでの培養、ならびに複数クローンでの混合培養を行い、個体数の増減と遺伝的多様性の関係について実験的に解析していく必要がある。

使用微磷灰石DNA标记物通过克隆分析研究了S型Rotifrice甲壳虫（S型rotifrice）种群的增加或减少的关系。首先，当我们选择克隆分析所需的微卫星DNA标记时，我们发现，通过使用四个微卫星DNA标记来区分克隆，可以鉴定分析种群中的所有克隆类型，并且它们还匹配了线粒体DNA的COI单倍型。接下来，培养了S型romatozoa一个月，在良好的生长过程中，romatozoa使用线粒体DNA COI区域进行单倍型分析，并使用微磷灰石DNA标记进行克隆分析。由于线粒体DNA COI区域的应变类型测定，确定所有旋转液为Brachionus plicatilis sp。 “鳄鱼。”此外，当文化良好时，将两到三种单倍型混合在一起，但是当培养很差时，仅确认了一种单倍型。使用微卫星DNA的克隆分析显示多达80个克隆。此外，在良好培养过程中，轮流的克隆多样性被认为比较差的文化中的克隆多样性要高。以上结果表明，当rombicrulture良好时，rombiclulture的遗传多样性很高，这表明遗传因素可能与rombiculture数量的增加或减少有关。但是，良好的繁殖环境也不否认会导致隐藏物种的良好生长，从而增加遗传多样性。因此，将来有必要使用本研究中看到的主要克隆类型在多个克隆中培养它们在单个克隆和混合培养物中，并通过实验分析人数的增加与减少与遗传多样性的关系。