細胞レベルで見る巨大ウイルス感染現象の多様性

细胞水平上巨病毒感染现象的多样性

基本信息

批准号：
22K15175
负责人：
疋田弘之
金额：
$ 3万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

项目摘要

2003年に報告された巨大ウイルスは細菌に匹敵する大きさのゲノムと粒子を持ち、ウイルスは微小な存在であるという考え方が支配的だった生物学に大きな衝撃を与えた。以降、多数の巨大ウイルスが様々な環境から単離され、ウイルス粒子の構造やゲノム構成が実に多様であることが明らかになった。一方、巨大ウイルスが感染細胞内で示す挙動に関する理解は大きく遅れている。そこで、本研究では様々な巨大ウイルスを用いて、細胞レベルでの感染現象を解析し、その多様性を明らかにするとともに、ウイルス間相互作用にまで踏み込むことを目指している。本年度は、主に巨大ウイルス感染が細胞内でどのように進行するかをモニターするための実験系の構築に取り組んだ。具体的には各ウイルスのDNA量を分子生物学的に定量する系を確立し、感染進行のモニターを可能とした。また、この系を用いて、一部のウイルスについて、ウイルス間相互作用もモニターできることを示した。さらに、一部のウイルスについては経時的なRNA-seqを行い、より網羅的に感染進行を解析するためのデータを得た。これらと並行して、巨大ウイルスの多様性をより詳細に明らかにするために、新規ウイルスの単離も試みた。その中で、新規ウイルスの単離、およびそれらのゲノムレベルでの多様性解析を効率的に行うためのパイプラインを構築し、その有用性について記した論文をプレプリントサーバーにアップロードした。なお、これらの新規ウイルスの単離は本研究計画を発展させる上で極めて有益であった。

2003年报道的巨型病毒具有与细菌相当的基因组和颗粒，并且对生物学产生了重大冲击，在这种情况下，病毒是微小的众生的想法。从那时起，已经揭示了许多巨型病毒已经从各种环境中分离出来，并且病毒颗粒的结构和基因组组成非常多样化。另一方面，了解巨型病毒在感染细胞内表现出的行为显着落后。因此，这项研究旨在使用各种巨型病毒在细胞水平上分析感染现象，阐明这些感染的多样性，甚至采用病毒 - 病毒相互作用的方法。今年，我们主要致力于建造实验系统，以监测细胞内巨型病毒感染的发展。具体而言，建立了一个系统以量化每个病毒分子的DNA量，从而监测感染的进展。还已经表明，该系统可用于监测某些病毒的病毒病毒相互作用。此外，随着时间的流逝，某些病毒受到了RNA-Seq的影响，并获得了数据以更全面地分析感染进展。与这些同时，我们还试图将新型病毒分离，以更详细地详细说明巨型病毒的多样性。其中，构建了一条管道，以有效地分离新的病毒并分析其在基因组水平上的多样性，并将描述其实用性的论文上传到预印术服务器上。此外，这些新型病毒的隔离在制定该研究计划方面非常有益。