胸腺腫および関連自己免疫疾患におけるT細胞の網羅的遺伝子解析による免疫異常の解明

通过 T 细胞的综合遗传分析阐明胸腺瘤和相关自身免疫性疾病的免疫异常

• 批准号: 21K16302
• 负责人: 川上 徹
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Shinshu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K16302/
• 关键词: 胸腺腫; 赤芽球癆; STAT3; ターゲットシーケンス; クローン性造血; T細胞受容体; T細胞; 体細胞遺伝子変異; 自己免疫疾患

本研究の目的は、胸腺腫症例のT細胞の遺伝子変異プロファイルを網羅的遺伝子解析により明らかにし、胸腺腫および関連する自己免疫疾患の診療に有用な新規指標を確立することである。先行研究においてCD4陽性細胞とCD8陽性細胞に分けて全エクソン解析を行い、結果を比較することでCD4陽性細胞、CD8陽性細胞それぞれに特徴的な遺伝子群を同定していたが、それに細胞シグナル伝達、細胞増殖、細胞周期といった機能に関連する遺伝子やT細胞性リンパ腫、クローン性造血などに重要な影響をもつと考えられる遺伝子等を加え、52遺伝子からなる遺伝子解析パネルを作成した。続いて、胸腺腫を含む、のべ132症例の末梢血単核球からDNAを抽出し、作成したパネルを用いてライブラリ化し、ターゲットシーケンスを行った。変異アリル頻度が高い遺伝子についてはダイレクトシーケンスで確認を行った。以前の研究と結果を比較し、解析方法の妥当性を確認した。遺伝子多型やエラーと考えられる変異の除去を行った結果、各症例ごとに中央値で3個の体細胞遺伝子変異を同定し、STAT3遺伝子を含む41遺伝子が複数症例で変異していた。特に、クローン性造血に関わる複数の遺伝子の変異が高頻度に認められた。赤芽球を合併した胸腺腫では他の病型と比較し、変異遺伝子数が少ない傾向があった。一部のクローン性造血関連遺伝子の変異陽性例では免疫抑制療法後に再発しやすい傾向がみられた。今後、可能な症例では時系列に沿った解析を行い、臨床経過との比較を行う方針である。

本研究的目的是通过全面的基因分析，阐明胸腺瘤病例中T细胞的基因突变谱，并建立可用于治疗胸腺瘤及相关自身免疫性疾病的新指标。在之前的研究中，我们分别分析了CD4阳性细胞和CD8阳性细胞的所有外显子，通过比较结果，我们确定了CD4阳性细胞和CD8阳性细胞特征的基因组，由52个基因组成。是通过添加与细胞增殖和细胞周期等功能相关的基因，以及被认为对T细胞淋巴瘤、克隆造血等有重要影响的基因而创建的。接下来，从包括胸腺瘤在内的总共132例患者的外周血单核细胞中提取DNA，并使用所创建的panel创建文库并进行靶向测序。通过直接测序确认具有高突变等位基因频率的基因。结果与以往的研究进行了比较，证实了分析方法的有效性。在去除被认为是错误的基因多态性和突变后，他们在每个病例中鉴定出中位数为 3 个体细胞基因突变，并且在多个病例中包括 STAT3 基因在内的 41 个基因发生突变。特别是，观察到与克隆造血有关的多个基因的突变频率很高。与其他疾病类型相比，有红细胞的胸腺瘤往往具有较少的突变基因。一些克隆性造血相关基因突变的患者在免疫抑制治疗后更容易复发。未来，我们计划对可能的病例进行时间顺序分析，并将其与临床病程进行比较。

项目成果

Comparative analysis of humoral responses to BNT162b2 vaccine among patients with hematologic disorders and organ transplant recipients.

• DOI: 10.1016/j.trim.2022.101713
• 发表时间: 2022-12
• 期刊: TRANSPLANT IMMUNOLOGY
• 影响因子: 1.5
• 作者: Nakazawa, Hideyuki;Sakai, Kaoko;Sudo, Yuriko;Iwabuchi, Ryohei;Sakai, Hitoshi;Nishina, Sayaka;Kawakami, Toru;Kawakami, Fumihiro;Matsuzawa, Shuji;Ito, Toshiro;Kitahara, Mari;Kamijo, Yuji;Umemura, Takeji;Ushiki, Atsuhito;Kanai, Shinichiro;Tsuchiya, Hiroyuki;Ishida, Fumihiro
• 通讯作者: Ishida, Fumihiro

T cell clonal expansion and STAT3 mutations: a characteristic feature of acquired chronic T cell-mediated pure red cell aplasia

• DOI: 10.1007/s12185-022-03310-2
• 发表时间: 2022-03-11
• 期刊: INTERNATIONAL JOURNAL OF HEMATOLOGY
• 影响因子: 2.1
• 作者: Kawakami, Fumihiro;Kawakami, Toru;Ishida, Fumihiro
• 通讯作者: Ishida, Fumihiro

A novel germline GATA2 frameshift mutation with a premature stop codon in a family with congenital sensory hearing loss and myelodysplastic syndrome

先天性感觉性听力损失和骨髓增生异常综合征家族中一种新型种系 GATA2 移码突变，具有提前终止密码子

• DOI: 10.1007/s12185-021-03130-w
• 发表时间: 2021
• 期刊: International Journal of Hematology
• 影响因子: 2.1
• 作者: Nakazawa Hideyuki;Yamaguchi Tomomi;Sakai Hitoshi;Maruyama Masae;Kawakami Toru;Kawakami Fumihiro;Nishina Sayaka;Ishikawa Masumi;Kosho Tomoki;Ishida Fumihiro
• 通讯作者: Ishida Fumihiro

Characteristic mutational profiles of STAT3 and clonal hematopoiesis-related genes in acquired PRCA

获得性 PRCA 中 STAT3 和克隆造血相关基因的特征突变谱

• 发表时间: 2022
• 作者: Toru Kawakami;Taku Yamane;Fumihiro Kawakami;Masae Maruyama;Natsumi Ida;Yuga Mizuno;Ami Asakura;Sayaka Nishina;Hitoshi Sakai;Yumiko Higuchi;Hideyuki Nakazawa;Fumihiro Ishida
• 通讯作者: Fumihiro Ishida