培養細胞を用いた胃粘膜発癌メカニズムと遺伝子変異・ピロリ菌感染相互作用の解明

利用培养细胞阐明胃粘膜癌变机制以及基因突变与幽门螺杆菌感染之间的相互作用

• 批准号: 21K15972
• 负责人: 竹内 康英
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15972/
• 关键词: 胃粘膜発癌; 分子腫瘍学; 遺伝子変異; ドライバー遺伝子変異; 胃粘膜; がん; 分子病理; 腫瘍学

胃粘膜が癌化する過程の詳細を明らかにするため、本研究では事前検討において統計学的な手法をもちいて検出した胃癌ドライバー遺伝子変異の候補が、実際の非腫瘍部胃粘膜上皮細胞においてどの様な分子生物学的変化をもたらすのか、その詳細を解明することと目的としていた。2022年度中には約 30 個の新規胃粘膜組織片を収集できた。現在それらに対して培養実験を実施中である。また並行して、既収集サンプルのデータを再解析し、胃癌ドライバー遺伝子変異の候補の統計学的な有意性の検証と、組織学的評価の相関について検討した。非癌部由来ヒト胃粘膜上皮集塊(n=130)と、それらから単離した胃腺窩(n=50)に対して網羅的遺伝子変異解析を行い、ドライバー遺伝子変異の検索と、胃粘膜における遺伝子変異蓄積・クローン拡大の詳細、組織学的な腸上皮化生の占める面積の相関を検討した。上皮集塊の検討結果からは既知の胃癌ドライバー遺伝子変異が有意なものとして検出され、さらに胃癌ドライバー遺伝子として知られている一部の遺伝子は癌部と比較して非癌部で有意に高い頻度で検出された。非癌部におけるクローン拡大は、癌部におけるクローン拡大とは異なった分子生物学的機序でもたらされている可能性が確認された。胃腺窩の検討では非腸上皮化生領域の胃粘膜で年間約0.4個/エクソーム、腸上皮化生領域の胃粘膜で約1.1個/エクソームの遺伝子変異蓄積が確認された。一方、上皮集塊におけるクローン拡大と、組織学的に腸上皮化生の占める割合には有意な相関はみられなかった。理論的には腸上皮化生とクローン拡大には相関が予想されるため、遺伝子用サンプルと組織評価用サンプルが完全には一致していないことに起因する可能性が推定された。これに関してはレーザーマイクロダイセクションなどの併用を検討している。

为了阐明胃粘膜变为癌的过程，在先前检查中使用统计方法检测到的胃癌驱动器基因突变是实际的非肿瘤气体粘膜上皮。分子生物学变化。在2022年期间，收集了大约30个新的胃粘膜碎片。目前为他们进行文化实验。同时，我们重新分析了已经收集的样品的数据，并检查了胃癌驱动器基因突变候选者的统计意义和组织评估的相关性。对赌博腺体进行了全面的基因突变分析（n = 130），该腺体从非癌部分分离出来，胃粘膜中的驱动器基因突变和胃粘膜中我们检查了基因突变堆积的细节和胃粘膜。克隆膨胀以及肠上皮占据的区域之间的相关性。从上皮质量的研究结果中，已知的胃癌驱动基因突变被检测到一个重要的基因，而在非癌症中，某些被称为胃癌驱动因素的基因明显更高。已经证实，非癌部分中克隆的扩展可能已引入与癌症区域克隆膨胀不同的分子生物学机制。在胃腺的研究中，非肠上皮区域中每年约0.4/外显子的基因粘液，肠上皮上皮的肠上皮化约为1.1/exome。另一方面，上皮质量中克隆的扩展与肠上皮学生的比率之间没有显着相关性。从理论上讲，肠上皮和克隆有望相关，这可能是由于遗传样品和组织评估样品不完全匹配的事实。我们正在考虑为此使用激光微型模具部分。

项目成果

The landscape of genetic aberrations in myxofibrosarcoma

• DOI: 10.1002/ijc.34051
• 发表时间: 2022-04
• 期刊: International Journal of Cancer
• 影响因子: 6.4
• 作者: Y. Takeuchi;Kenichi Yoshida;Adriane Halik;A. Kunitz;Hiromichi Suzuki;N. Kakiuchi;Y. Shiozawa;A. Yokoyama;Y. Inoue;Tomonori Hirano;T. Yoshizato;Kosuke Aoki;Y. Fujii;Y. Nannya;H. Makishima;B. Pfitzner;L. Bullinger;M. Hirata;Keita Jinnouchi;Y. Shiraishi;K. Chiba;Hiroko Tanaka;S. Miyano;T. Okamoto;H. Haga;S. Ogawa;F. Damm

Expansion of Gastric Intestinal Metaplasia with Copy Number Aberrations Contributes to Field Cancerization

• DOI: 10.1158/0008-5472.can-21-1523
• 发表时间: 2022-05-01
• 期刊: CANCER RESEARCH
• 影响因子: 11.2
• 作者: Kumagai, Ken;Shimizu, Takahiro;Seno, Hiroshi
• 通讯作者: Seno, Hiroshi

Indolent feature of Helicobacter pylori-uninfected intramucosal signet ring cell carcinomas with CDH1 mutations

• DOI: 10.1007/s10120-021-01191-8
• 发表时间: 2021-05-07
• 期刊: GASTRIC CANCER
• 影响因子: 7.4
• 作者: Nikaido, Mitsuhiro;Kakiuchi, Nobuyuki;Seno, Hiroshi
• 通讯作者: Seno, Hiroshi

Whole-genome sequencing analysis of an atypical teratoid/rhabdoid tumor in a patient with Phelan?McDermid syndrome: a case report and systematic review

Phelan?McDermid 综合征患者非典型畸胎瘤/横纹肌样瘤的全基因组测序分析：病例报告和系统评价

• DOI: 10.1007/s10014-022-00440-7
• 发表时间: 2022
• 期刊: Brain Tumor Pathology
• 影响因子: 3.3
• 作者: Yamashita Haruki;Arakawa Yoshiki;Terada Yukinori;Takeuchi Yasuhide;Mineharu Yohei;Sumiyoshi Sosuke;Tokunaga Shinya;Nakajima Kohei;Kawabata Naoko;Tanaka Kuniaki;Tanji Masahiro;Umeda Katsutsugu;Minamiguchi Sachiko;Ogawa Seishi;Haga Hironori;Takita Junko;Miy
• 通讯作者: Miy

Molecular classification and diagnostics of upper urinary tract urothelial carcinoma.

• DOI: 10.1016/j.ccell.2021.05.008
• 发表时间: 2021-06-14
• 期刊: CANCER CELL
• 影响因子: 50.3
• 作者: Fujii, Yoichi;Sato, Yusuke;Suzuki, Hiromichi;Kakiuchi, Nobuyuki;Yoshizato, Tetsuichi;Lenis, Andrew T.;Maekawa, Shigekatsu;Yokoyama, Akira;Takeuchi, Yasuhide;Inoue, Yoshikage;Ochi, Yotaro;Shiozawa, Yusuke;Aoki, Kosuke;Yoshida, Kenichi;Kataoka, Keisuke;Nakagawa, Masahiro M.;Nannya, Yasuhito;Makishima, Hideki;Miyakawa, Jimpei;Kawai, Taketo;Morikawa, Teppei;Shiraishi, Yuichi;Chiba, Kenichi;Tanaka, Hiroko;Nagae, Genta;Sanada, Masashi;Sugihara, Eiji;Sato, Taka-Aki;Nakagawa, Tohru;Fukayama, Masashi;Ushiku, Tetsuo;Aburatani, Hiroyuki;Miyano, Satoru;Coleman, Jonathan A.;Homma, Yukio;Solit, David B.;Kume, Haruki;Ogawa, Seishi
• 通讯作者: Ogawa, Seishi