Phylodynamics of regional Streptococcus pneumoniae serotype 19A-ST320 lineage in Okinawa prefecture and the analysis of pbp1a transmission between different pneumococcal clones in Japan

冲绳县地区肺炎链球菌血清型19A-ST320谱系的系统动力学及日本不同肺炎球菌克隆间pbp1a传播分析

• 批准号: 21K15432
• 负责人: 中野 哲志
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: National Institute of Infectious Diseases
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15432/
• 关键词: 肺炎球菌; 19A-ST320; 全ゲノム解析; 侵襲性肺炎球菌感染症; カルバペネム耐性; pbp1a; 肺炎球菌; 19A-ST320; 全ゲノム解析; 侵襲性肺炎球菌感染症; カルバペネム耐性; pbp1a

沖縄県および日本本島で検出される多剤耐性肺炎球菌クローン19A-ST320株の解析の全ゲノム解析を行った。19A-ST320クローン株は本邦においては沖縄県において高頻度に検出される一方で、日本本島では検出が稀である。本研究では、全ゲノム解析を用いて、沖縄県で高頻度に検出される同クローン株が、日本本島由来で沖縄県で流行する素地があるのか、あるいは沖縄県に諸外国から流入があるのか、を解析した。全ゲノム解析の結果では沖縄株は米国で検出される同クローン株と近縁であることが判明した。ベイズ解析によるとこの流入は1990年代から2000年にかけて起こったと考えられる。沖縄県の地政学的な要素を考慮に入れると、同株は米軍基地に関連して米国より沖縄県に流入している可能性が示唆される。

进行了整个基因组分析，用于分析在冲绳县和日本主要岛屿中检测到的多药耐药性肺炎球菌克隆19A-ST320。尽管日本的冲绳县经常发现19A-ST320克隆菌株，但在日本主要岛屿上很少被发现。在这项研究中，使用全基因组分析，我们分析了在冲绳县经常发现的克隆菌株起源于日本主要岛屿，并且在冲绳县普遍存在，还是其他国家涌入冲绳县。整个基因组分析的结果表明，冲绳菌株与在美国检测到的同一克隆菌株密切相关。贝叶斯分析表明，这种涌入发生在1990年代至2000年之间。考虑到冲绳县的地缘政治因素，这表明该股票可能已经从美国与美国军事基地有关。