大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析

结直肠黏膜下浸润癌微小RNA综合分析

• 批准号: 21K15406
• 负责人: 永塚 真
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Iwate Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15406/
• 关键词: micro RNA; messenger RNA; 大腸癌; 大腸腫瘍

大腸粘膜下層浸潤癌（リンパ節転移例、非転移例）についてパラフィンからRNAを抽出した、いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった（TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-39, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085）。

在某些情况下，从石蜡中提取RNA的结粘膜浸没癌（淋巴结转移的受试者，非转移性病例），RNA难以提取，并且在某些情况下添加了预发肌甲状体和地下侵袭的某些病例。术前化疗，遗传性肿瘤病例以及免疫染色或MSI分析的病例表明MSI被排除在外。结果，在18例淋巴结转移和21例非转移性疾病的病例中进行了分析。为了进行全面的miRNA分析，使用Affymetrix Genechip miRNA阵列4.0。使用Affymetrix Clario的人类测定法进行全面的mRNA分析。为了比较淋巴结转移与非中性迁移组之间的miRNA表达波动，我们决定提取FDR p <0.05和delta折叠变化> 2。结果，八个miRNA显示了上调（miR-4685-3p，6754-3p，6754-3p，6754-3p，6754-3p，6806-3p，8085，8085，等等）。没有接受下调的规定。使用途径分析研究了miRNA和mRNA之间的关系。有七个mRNA显示了用miRNA（TMEM243和miR-206，4685-3p，6754-3p，6754-3p，metap1和miR-4685-39，camk4和miR-8085，tgoln2，tgoln2和mir-6806-3p，8085，8085）。