大腸粘膜下層浸潤癌におけるmicro RNA網羅的解析

结直肠黏膜下浸润癌微小RNA综合分析

• 批准号: 21K15406
• 负责人: 永塚 真
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Iwate Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15406/
• 关键词: micro RNA; messenger RNA; 大腸癌; 大腸腫瘍

大腸粘膜下層浸潤癌（リンパ節転移例、非転移例）についてパラフィンからRNAを抽出した、いくつかの症例でRNAの抽出に難渋し一部固有筋層浸潤、漿膜下層浸潤症例も症例として追加した。術前化学療法が行われた症例、遺伝性腫瘍症例、免疫染色やMSI解析でMSIが示唆された症例は除外とした。結果としてリンパ節転移例18例, 非転移例21例で解析を行なった。網羅的miRNA解析はaffymetrix GeneChip miRNA Array 4.0を用いた。網羅的mRNA解析はaffymetrix Clario S human assayを用いた。リンパ節転移群と非転移群のmiRNA発現変動の比較はFDR p<0.05かつdelta Fold change>絶対値2を越えるものを抽出することとした。その結果8個のmiRNA (miR-4685-3p, 6754-3p, 6806-3p, 8085など)でup regulationを示した。down regulationを示したものは認めなかった。up regulationを示したmiRNAとmRNAの相互関係をパスウェイ解析で検討した。miRNAでup regulationを示し、down regulationを示したmRNAは7パターンであった（TMEM243とmiR-206, 4685-3p, 6754-3p, METAP1とmiR-4685-39, CAMK4とmiR-8085, TGOLN2とmiR-6806-3p, 8085）。

结直肠粘膜下浸润性癌（淋巴结转移病例、非转移病例）石蜡提取RNA。部分病例提取RNA困难，增加部分固有肌层侵犯、浆膜下层侵犯病例。排除术前化疗的病例、遗传性肿瘤病例以及免疫染色或MSI分析提示MSI的病例。结果，对淋巴结转移18例和非转移21例进行了分析。使用 affymetrix GeneChip miRNA Array 4.0 进行全面的 miRNA 分析。使用 affymetrix Clario S 人体检测进行综合 mRNA 分析。为了比较淋巴结转移组和非转移组之间的miRNA表达变化，我们决定提取FDR p<0.05且delta倍数变化>绝对值2的那些。结果，8 个 miRNA（miR-4685-3p、6754-3p、6806-3p、8085 等）显示出调节作用。没有观察到下调的证据。通过通路分析研究了表现出调节作用的 miRNA 和 mRNA 之间的相互关系。七种 miRNA 模式显示上调和下调（TMEM243 和 miR-206、4685-3p、6754-3p、METAP1 和 miR-4685-39、CAMK4 和 miR-8085、TGOLN2 和 miR-6806-3p、8085）。