NMR Investigation of the Regulation of Gene Expression by RNA Thermometers
RNA 温度计对基因表达调控的 NMR 研究
基本信息
- 批准号:40116492
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Priority Programmes
- 财政年份:2007
- 资助国家:德国
- 起止时间:2006-12-31 至 2013-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Ribonucleic acid oligonucleotides (RNAs) are involved in the regulation of gene expression. RNAs respond to various external stimuli such as changes in the concentration of small metabolites (riboswitch RNAs) but also changes in temperature (RNA thermometers). The external stimulus is transformed into a change in secondary and tertiary structure, often at allosteric sites. Thereby, gene expression can be regulated both at the level of transcription or translation. In this proposal, we will characterize the structural dynamics of novel RNA thermometers discovered in the Narberhaus group (unpublished results) using static and time-resolved NMR spectroscopy. In the first funding period, we have developed a method that allows us to delineate the stability of individual base pairs based on thermodynamic measurements. In addition, we have developed a NMR temperature jump probe. In the second funding period, we will extend our studies to novel RNA thermometers and will apply time-resolved NMR measurements to determine the kinetics and life times of open signalling states of RNA thermometers.
核糖核酸寡核苷酸 (RNA) 参与基因表达的调节。 RNA 对各种外部刺激做出反应,例如小代谢物浓度的变化(核糖开关 RNA)以及温度的变化(RNA 温度计)。外部刺激通常在变构位点转化为二级和三级结构的变化。因此,可以在转录或翻译水平上调节基因表达。在本提案中,我们将使用静态和时间分辨核磁共振波谱来表征纳伯豪斯小组(未发表的结果)发现的新型 RNA 温度计的结构动力学。在第一个资助期间,我们开发了一种方法,使我们能够根据热力学测量来描述单个碱基对的稳定性。此外,我们还开发了核磁共振温度跳跃探针。在第二个资助期,我们将把研究扩展到新型 RNA 温度计,并将应用时间分辨核磁共振测量来确定 RNA 温度计开放信号状态的动力学和寿命。
项目成果
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专著数量(0)
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