DNP approach for structural determination of large protein-RNA complexes by solid-state NMR

通过固态 NMR 确定大蛋白质-RNA 复合物结构的 DNP 方法

基本信息

项目摘要

In this research project we aim to investigate the feasibility of dynamic nuclear polarization (DNP) aided experiments for structural studies of large protein-RNA complexes by solid-state NMR. Solid-state NMR has been successfully applied for studies of amyloid fibrils, membrane proteins and large protein complexes; first ssNMR studies on protein-RNA complexes have been reported recently. While structural information on small protein-RNA complexes can be obtained in a reasonable time, studies of large complexes are much more time consuming - and often unfeasible - due to lack of sensitivity and severe signal overlap. DNP provides a significant boost in sensitivity for NMR experiments by transferring electron spin polarization of a paramagnetic polarizing agent to nuclear spins. NMR signal enhancement factors typically reach two orders of magnitude. This leads to time savings of the order of tens of thousands and opens the possibility to perform 3D and 4D experiments within few days. The unique collaboration of our research groups, being active in RNA structural biology by MAS NMR as well as DNP-enhanced MAS NMR, will allow us to develop methods for structural studies of large RNP complexes in close-to-native environment at atomic resolution. The methodology developed within this project will find broad applicability in several areas of structural biology.
在该研究项目中,我们旨在研究动态核极化(DNP)的可行性(DNP)辅助实验,用于固态NMR对大蛋白RNA复合物的结构研究。固态NMR已成功地用于研究淀粉样蛋白原纤维,膜蛋白和大蛋白质复合物的研究。最近已经报道了有关蛋白-RNA复合物的首次SSNMR研究。尽管可以在合理的时间内获得有关小蛋白RNA复合物的结构信息,但由于缺乏敏感性和严重的信号重叠,对大型复合物的研究更加耗时(通常是不可行)。 DNP通过将顺磁性偏振剂的电子自旋极化转移到核自旋方面,从而显着提高了NMR实验的敏感性。 NMR信号增强因子通常达到两个数量级。这导致了成千上万的时间节省的时间,并在几天内开放了执行3D和4D实验的可能性。 MAS NMR和DNP增强的MAS NMR活跃于RNA结构生物学的独特合作将使我们能够开发用于原子分辨率接近本地环境中大型RNP复合物的结构研究的方法。该项目中开发的方法将在结构生物学的几个领域中找到广泛的适用性。

项目成果

期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Professor Dr.-Ing. Björn Corzilius其他文献

Professor Dr.-Ing. Björn Corzilius的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Professor Dr.-Ing. Björn Corzilius', 18)}}的其他基金

Investigation of site-specific dynamic nuclear polarization on biomolecules
生物分子位点特异性动态核极化的研究
  • 批准号:
    232503709
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Independent Junior Research Groups
Erforschung und Entwicklung von gepulsten Methoden der dynamischen Kernpolarisation (DNP) in der magnetischen Kernresonanz (NMR)
核磁共振(NMR)动态核极化(DNP)脉冲方法的研究与开发
  • 批准号:
    97072260
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Research Fellowships

相似国自然基金

基于高阶读数的拓扑关联结构域识别和比对方法研究
  • 批准号:
    62372156
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
面向在轨大型结构的空间机器人多机协同接管控制方法研究
  • 批准号:
    52305036
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
高维结构约束的光场视频稀疏模型压缩理论与方法
  • 批准号:
    62371278
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
板材结构中应力的超声兰姆波零频分量评价方法研究
  • 批准号:
    12374420
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    53 万元
  • 项目类别:
    面上项目
面向颅内斑块微结构的超高场磁共振血管壁三维多参数定量方法研究
  • 批准号:
    62301548
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

Host-Guest Complexation: A Modular Approach for Structural Control (MAS-Control) in Supramolecular Polymerization
主客体络合:超分子聚合中结构控制(MAS-Control)的模块化方法
  • 批准号:
    EP/Y027965/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Fellowship
Structure-Focused Multi-task Learning Approach for structural pattern recognition and analysis
用于结构模式识别和分析的以结构为中心的多任务学习方法
  • 批准号:
    24K20789
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Comparative structural study of Buddhist temples and villages in Medieval Kibi region.
中世纪吉备地区佛教寺庙和村庄的结构比较研究。
  • 批准号:
    23K00831
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Modulators of cardiomyocyte structure to promote functional recovery during cardiac regeneration and repair
心肌细胞结构调节剂促进心脏再生和修复过程中的功能恢复
  • 批准号:
    10751640
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
Control of insulin secretion by mitochondrial fusion
通过线粒体融合控制胰岛素分泌
  • 批准号:
    10753730
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了