HBV遺伝子のヒト遺伝子への組み込みに対する統合的遺伝子解析から肝発癌を予測する

通过 HBV 基因整合到人类基因中的综合遗传分析预测肝癌的发生

基本信息

批准号：
19K08427
负责人：
藤原圭
金额：
$ 2.25万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K08427/
关键词：
B型肝炎 structural variation integration 肝発癌遺伝子変化 Complex SV 遺伝子解析

项目摘要

B型肝炎ウイルス（HBV）感染は、世界的な公衆衛生上の問題である。幼少期の感染から慢性感染をきたし、肝硬変や肝細胞癌を発症する。我々は、HBVに関して、ウイルス学的、分子疫学的、および臨床的な検討を多数行ってきた。最近では感染症であるCOVID-19の原因ウイルスであるSARS-Cov-2の遺伝子変化に関する研究を行い、HBVと類似した遺伝子変化が発生していることを確認している。ウイルスの遺伝子変化に関する研究を行う中で、我々はstructural variation (SV)に注目している。Insertionやdeletionといった規範的なSVに加え、それらが複雑に重なり起こるcomplex SVsについても過去に多数の研究報告を行っている。HBVはヒトゲノムに挿入されるが、それはHBV integrationと呼ばれている。単純なHBVゲノムのヒトゲノムへの挿入は規範的なSVに含まれるが、過去に、HBVゲノムのいくつかの断片が複合的に挿入されintegrationを起こしていることが報告されており、これらはcomplex SVsと考えられる。今回、HBVに起こるcomplex SVsを元にHBV integrationの解析を行っている。その中で新たにHBVにはpolymorphicなSVが存在することを確認し、それらが、integrationに関連する可能性についても検討を行っている。HBVのintegration自体が宿主ゲノムにとってのSVであり、さらにintegrateされたHBVゲノムが通常の自然に存在するHBVゲノムとは異なり異常な接続によるcomplex SVsを構成していることに注目し、研究を行っている。

丙型肝炎病毒（HBV）感染是全球公共卫生问题。感染发生在童年时期，并发展出慢性感染，导致肝硬化和肝细胞癌。我们已经进行了许多有关HBV的病毒学，分子流行病学和临床研究。最近，我们已经对导致感染性疾病Covid-19的病毒SARS-COV-2的遗传变化进行了研究，并确认正在发生类似于HBV的遗传变化。在对病毒遗传变化的研究中，我们专注于结构变异（SV）。除了插入和删除等规范性SV外，我们还在复杂的SV上写了许多研究报告，其中这些报告在复杂的SV中重叠。 HBV插入了人类基因组，这称为HBV整合。将简单的HBV基因组插入人类基因组中被包括在规范性的SV中，但过去据报道，HBV基因组的几个片段已被合并以进行整合，这些片段被认为是复杂的SVS。这次，我们正在分析基于HBV中发生的复杂SV的HBV集成。其中，我们已经确认HBV中有新的多态性SV，并且还考虑了这些可能与整合有关的可能性。我们正在通过关注HBV整合本身是宿主基因组的SV来进行研究，而与正常的，天然发生的HBV基因组不同，综合的HBV基因组构成了由于异常连接而引起的复杂SV。

项目成果

期刊论文数量（27）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

切除不能肝癌に対するアテゾリズマブ・ベバシズマブ併用療法の有効性・安全性に関する多施設共同研究

阿特珠单抗与贝伐珠单抗联合治疗不可切除肝癌的有效性和安全性多中心合作研究

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kikuchi K;Yamazaki N;Nozawa K;Fukuda H;Shibata T;Machida R;Hamaguchi T;Takashima A;Shoji H;Boku N;Takatsuka S;Takenouchi T;Nishina T;Yoshikawa S;Takahashi M;Hasegawa A;Kawazoe A;Masuishi T;Mizutani H;Kiyohara Y.;松浦健太郎，鈴木孝典，藤原圭，名倉義人，河村逸外，祖父江聡，日下部篤宣，鈴木雄太，奥村文浩，的屋奨，宮木知克，田中義人
通讯作者：
松浦健太郎，鈴木孝典，藤原圭，名倉義人，河村逸外，祖父江聡，日下部篤宣，鈴木雄太，奥村文浩，的屋奨，宮木知克，田中義人

Novel Prediction Model of HCC Development in Chronic Hepatitis B Patients Under Antiviral Therapy.

抗病毒治疗下慢性乙型肝炎患者 HCC 发展的新预测模型。