HBV遺伝子のヒト遺伝子への組み込みに対する統合的遺伝子解析から肝発癌を予測する

通过 HBV 基因整合到人类基因中的综合遗传分析预测肝癌的发生

基本信息

批准号：
19K08427
负责人：
藤原圭
金额：
$ 2.25万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K08427/
关键词：
B型肝炎 structural variation integration 肝発癌遺伝子変化 Complex SV 遺伝子解析

项目摘要

B型肝炎ウイルス（HBV）感染は、世界的な公衆衛生上の問題である。幼少期の感染から慢性感染をきたし、肝硬変や肝細胞癌を発症する。我々は、HBVに関して、ウイルス学的、分子疫学的、および臨床的な検討を多数行ってきた。最近では感染症であるCOVID-19の原因ウイルスであるSARS-Cov-2の遺伝子変化に関する研究を行い、HBVと類似した遺伝子変化が発生していることを確認している。ウイルスの遺伝子変化に関する研究を行う中で、我々はstructural variation (SV)に注目している。Insertionやdeletionといった規範的なSVに加え、それらが複雑に重なり起こるcomplex SVsについても過去に多数の研究報告を行っている。HBVはヒトゲノムに挿入されるが、それはHBV integrationと呼ばれている。単純なHBVゲノムのヒトゲノムへの挿入は規範的なSVに含まれるが、過去に、HBVゲノムのいくつかの断片が複合的に挿入されintegrationを起こしていることが報告されており、これらはcomplex SVsと考えられる。今回、HBVに起こるcomplex SVsを元にHBV integrationの解析を行っている。その中で新たにHBVにはpolymorphicなSVが存在することを確認し、それらが、integrationに関連する可能性についても検討を行っている。HBVのintegration自体が宿主ゲノムにとってのSVであり、さらにintegrateされたHBVゲノムが通常の自然に存在するHBVゲノムとは異なり異常な接続によるcomplex SVsを構成していることに注目し、研究を行っている。

乙型肝炎病毒（HBV）感染是一个全球性的公共卫生问题。儿童时期感染会导致慢性感染，从而导致肝硬化和肝细胞癌。我们进行了大量有关 HBV 的病毒学、分子流行病学和临床研究。最近，我们对引起传染病COVID-19的病毒SARS-Cov-2的基因变化进行了研究，并证实发生了与乙型肝炎病毒类似的基因变化。在进行病毒遗传变化的研究时，我们重点关注结构变异（SV）。除了插入和删除等标准SV之外，我们还对复杂SV进行了大量研究报告，其中这些SV以复杂的方式重叠。 HBV 插入人类基因组称为 HBV 整合。虽然将HBV基因组简单插入人类基因组包含在标准SV中，但过去有报道称，HBV基因组的几个片段以复杂的方式插入，导致整合被认为是SV。这次，我们基于 HBV 中出现的复杂 SV 来分析 HBV 整合。其中，我们新确认了HBV中存在多态性SV，并且也在研究它们与整合相关的可能性。我们的研究重点是，HBV 整合本身就是宿主基因组的 SV，并且整合的 HBV 基因组由于异常连接而构成复杂的 SV，这与正常天然存在的 HBV 基因组不同。

项目成果

期刊论文数量（27）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

切除不能肝癌に対するアテゾリズマブ・ベバシズマブ併用療法の有効性・安全性に関する多施設共同研究

阿特珠单抗与贝伐珠单抗联合治疗不可切除肝癌的有效性和安全性多中心合作研究

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kikuchi K;Yamazaki N;Nozawa K;Fukuda H;Shibata T;Machida R;Hamaguchi T;Takashima A;Shoji H;Boku N;Takatsuka S;Takenouchi T;Nishina T;Yoshikawa S;Takahashi M;Hasegawa A;Kawazoe A;Masuishi T;Mizutani H;Kiyohara Y.;松浦健太郎，鈴木孝典，藤原圭，名倉義人，河村逸外，祖父江聡，日下部篤宣，鈴木雄太，奥村文浩，的屋奨，宮木知克，田中義人
通讯作者：
松浦健太郎，鈴木孝典，藤原圭，名倉義人，河村逸外，祖父江聡，日下部篤宣，鈴木雄太，奥村文浩，的屋奨，宮木知克，田中義人

Novel Prediction Model of HCC Development in Chronic Hepatitis B Patients Under Antiviral Therapy.

抗病毒治疗下慢性乙型肝炎患者 HCC 发展的新预测模型。