コレラ菌における染色体数のバリエーションに関する研究
霍乱弧菌染色体数目变异的研究
基本信息
- 批准号:19K07551
- 负责人:
- 金额:$ 2.83万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-01 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
昨年度はコレラ菌の単一染色体株V060002(Single Chromosome(SC)株)の染色体が2本に分離したバリアント(Two Chromosome(TC)株)をスクリーニングするとともに、両者の増殖能を比較した。本年度はSC株とTC株における遺伝子発現の違いを明らかにするためにRNA-seqを行った。その結果、SC株ではTC株に比べてリボース取り込み系の遺伝子群とCTXファージの複製に関わる遺伝子群の発現がそれぞれ約16倍と約4倍に上昇していた。また、染色数の変動を解析するためのレポーター系を用いてTCからSCへの変換に関わる因子について探索したところ、V060002のゲノムに特異的にコードされる約28 kbpの遺伝子クラスターが重要な役割を担うことが示唆された。この遺伝子クラスターはSalmonella Genomic Island-1(SGI-1)と相同性が高いため、Vibrio Genomic Island-1(VGI-1)と命名した。SGI-1は染色体からの切り出しと複製に関わる遺伝子や接合伝達開始点oriTをコードしているなどプラスミド様の特徴をもつが、その自律的複製と接合伝達を活性化するためにはヘルパープラスミドを導入する必要がある。そこでVGI-1とヘルパープラスミドpVCR94を共存させたところ、両者が単独で存在する場合に比べてTCからSCに変換される効率が100倍以上に上昇した。この結果から、pVCR94の存在下で活性化されるVGI-1由来の因子が単一染色体化を誘導しているものと考えられた。
去年,我们筛选了一个变体(两个染色体(TC)菌株),其中有两个染色体的单染色体V060002(单染色体(SC)菌株)的两个染色体,并比较了两者的增殖潜力。今年,进行RNA-Seq以阐明SC和TC菌株之间基因表达的差异。结果,与TC菌株相比,SC菌株中核糖摄取基因组的表达和参与CTX噬菌体复制的基因分别约为16倍和4倍。此外,当我们使用记者系统搜索TC转化为SC的因素以分析污渍数量的变化时,建议在V060002基因组中特别编码的大约28 kbp的基因簇起着重要作用。该基因簇被称为Vibrio Genomic Island-1(VGI-1),因为它与沙门氏菌基因组岛1(SGI-1)高度同源。 SGI-1具有类似质粒的特征,例如编码与染色体的切除和复制的基因以及共轭传递的起源,但有必要引入辅助质粒以激活其自主复制和共轭透射。因此,当将VGI-1和辅助质粒PVCR94共存时,与单独存在时,从TC到SC的转化效率增加了100倍以上。从这些结果中可以认为,在存在PVCR94的情况下激活的VGI-1衍生因子会诱导单个染色体化。
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
単一染色体を保有するコレラ菌株の解析
含有单染色体的霍乱菌株分析
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yokoi T;Nishiyama K;Kushida Y;Uribayashi K;Kunihara T;Fujimoto R;Yamamoto Y;Ito M;Miki T;Haneda T;Mukai T;Okada N.;山本章治
- 通讯作者:山本章治
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H.Yonehara et al.
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