コレラ菌における染色体数のバリエーションに関する研究

霍乱弧菌染色体数目变异的研究

基本信息

  • 批准号:
    19K07551
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.83万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2019
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2019-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

昨年度はコレラ菌の単一染色体株V060002(Single Chromosome(SC)株)の染色体が2本に分離したバリアント(Two Chromosome(TC)株)をスクリーニングするとともに、両者の増殖能を比較した。本年度はSC株とTC株における遺伝子発現の違いを明らかにするためにRNA-seqを行った。その結果、SC株ではTC株に比べてリボース取り込み系の遺伝子群とCTXファージの複製に関わる遺伝子群の発現がそれぞれ約16倍と約4倍に上昇していた。また、染色数の変動を解析するためのレポーター系を用いてTCからSCへの変換に関わる因子について探索したところ、V060002のゲノムに特異的にコードされる約28 kbpの遺伝子クラスターが重要な役割を担うことが示唆された。この遺伝子クラスターはSalmonella Genomic Island-1(SGI-1)と相同性が高いため、Vibrio Genomic Island-1(VGI-1)と命名した。SGI-1は染色体からの切り出しと複製に関わる遺伝子や接合伝達開始点oriTをコードしているなどプラスミド様の特徴をもつが、その自律的複製と接合伝達を活性化するためにはヘルパープラスミドを導入する必要がある。そこでVGI-1とヘルパープラスミドpVCR94を共存させたところ、両者が単独で存在する場合に比べてTCからSCに変換される効率が100倍以上に上昇した。この結果から、pVCR94の存在下で活性化されるVGI-1由来の因子が単一染色体化を誘導しているものと考えられた。
去年,我们筛选了一个变体(两个染色体(TC)菌株),其中有两个染色体的单染色体V060002(单染色体(SC)菌株)的两个染色体,并比较了两者的增殖潜力。今年,进行RNA-Seq以阐明SC和TC菌株之间基因表达的差异。结果,与TC菌株相比,SC菌株中核糖摄取基因组的表达和参与CTX噬菌体复制的基因分别约为16倍和4倍。此外,当我们使用记者系统搜索TC转化为SC的因素以分析污渍数量的变化时,建议在V060002基因组中特别编码的大约28 kbp的基因簇起着重要作用。该基因簇被称为Vibrio Genomic Island-1(VGI-1),因为它与沙门氏菌基因组岛1(SGI-1)高度同源。 SGI-1具有类似质粒的特征,例如编码与染色体的切除和复制的基因以及共轭传递的起源,但有必要引入辅助质粒以激活其自主复制和共轭透射。因此,当将VGI-1和辅助质粒PVCR94共存时,与单独存在时,从TC到SC的转化效率增加了100倍以上。从这些结果中可以认为,在存在PVCR94的情况下激活的VGI-1衍生因子会诱导单个染色体化。

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
消化器病学サイエンス
胃肠病学
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    塩川雅広;児玉裕三;塩川雅広
  • 通讯作者:
    塩川雅広
単一染色体を保有するコレラ菌株の解析
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yokoi T;Nishiyama K;Kushida Y;Uribayashi K;Kunihara T;Fujimoto R;Yamamoto Y;Ito M;Miki T;Haneda T;Mukai T;Okada N.;山本章治
  • 通讯作者:
    山本章治
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Takenouchi T;Sugama S;Sato M;Kitani H;山本 章治;荒川 賢治;立野 智資;荒川賢治;荒川賢治;荒川賢治;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;山本 章治;岩國 美由季;鈴木 敏弘;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    見崎 裕也;山本 章治;鈴木 敏弘;岩國 美由季;高橋 譲;稲田 晋宣;木梨 陽康;荒川 賢治
  • 通讯作者:
    荒川 賢治
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    Takenouchi T;Sugama S;Sato M;Kitani H;山本 章治;荒川 賢治;立野 智資;荒川賢治;荒川賢治;荒川賢治;荒川 賢治;望月 進;鈴木 敏弘;楊 英杰;木梨 陽康;荒川 賢治;荒川 賢治;望月 進;立野 智資;楊 英杰;H.Yonehara et al.
  • 通讯作者:
    H.Yonehara et al.

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作者:{{ showInfoDetail.author }}

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