Unraveling the principles of microbiota function for rationally-designed biotherapeutics

揭示合理设计生物治疗药物的微生物群功能原理

• 批准号: 20H05627
• 负责人: 本田 賢也
• 金额: $ 410.09万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-07-30 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H05627/
• 关键词: 常在細; 抗生物質耐性菌; ワクチン; 大腸がん; 代謝疾患; 腸内細菌; 百寿; 常在細菌; 多剤耐性菌; がん

1.免疫疾患・ワクチン、2.多剤耐性菌感染、3.代謝疾患、4.がん、5.健康長寿、に影響する常在細菌を探索した。まず、Paraprevotella claraが、トリプシンやTMPRSS2の分解を介してMurine hepatitis virusの腸管感染を阻害することを見いだした。さらにP. claraのトリプシン分解遺伝子はCOVID19感染症における腸炎発症と逆相関していることを見いだした。これを論文として報告した（Nature. 2022）。また、抗生物質耐性菌を除去できる有益な細菌種を探索し、ヒト便から31菌株を単離し、そのうち、18種類のFirmicutesを中心とした菌株の組み合わせが、クレブシェラ株だけではなく、接着浸潤性大腸菌などに対しても腸管からの除去効果を発揮することを見いだした。更にそのメカニズムもトランスポゾンミュータジェネシスを用いることで明らかにすることができた。代謝疾患を改善する細菌種を探索する研究においては、低タンパク食が、白色脂肪組織において、腸内細菌依存的にBeige細胞を強力に誘導することを見出した。健常者にFDG-PET行って、FDGの集積が確認された1名の便から単離した33菌株にBeige細胞誘導を促進する作用があることがわかった。大腸がんに影響する細菌種の探索研究では、APCf/f x KrasLSL-G12D x Tp53f/f x Cdx2-CreERT2マウス (AKTCマウス)が腸内細菌依存的に大腸腫瘍を発症すること、更に、大腸がん切除標本上皮から単離した14菌株にAKTCマウスにおける大腸腫瘍発症作用があることが分かった。そして百寿者の便サンプルから3-oxo-LCAやallo-iso-LCAといった特殊な胆汁酸を代謝合成する細菌を同定し、それらの細菌種はステロイドも代謝することがわかった。

我们探索了1。免疫疾病和疫苗，2。多药耐药细菌感染，3。代谢性疾病，4。癌症，5。健康寿命和5。影响的正常细菌。首先，我们发现paraprevotella clara通过胰蛋白酶和TMPRSS2的降解抑制鼠肝炎病毒中的肠道感染。此外，我们发现P. clara的胰蛋白酶降解基因与CoVID19感染中的肠炎发作成反比。据报道这是一篇论文（自然，2022年）。我们还探索了可以去除抗生素抗性细菌的有益细菌物种，并从人的凳子中孤立了31种菌株，发现菌株（主要是18种富公司）的组合对从肠道中除去肠道具有影响，而不仅仅是针对Klebshera菌株，而且还反对粘附的E. coliions Infration Infration Inftrations coli coli coli coli coli coli coli coli coli andernective colherent Invasitive decherent offasive decherent offasive and themernective。此外，可以使用转座子诱变来阐明这种机制。在探索改善代谢疾病的细菌物种的研究中，我们发现低蛋白质饮食以肠道依赖性方式强烈诱导白脂肪组织中的米色细胞。在健康个体中进行了FDG-PET，发现从一个粪便中分离出33个菌株，在该粪便中确认FDG积累有促进米色细胞诱导的作用。 In a search for bacterial species affecting colon cancer, it was found that APCf/f x KrasLSL-G12D x Tp53f/f x Cdx2-CreERT2 mice (AKTC mice) develop colon tumors in an intestinal dependent manner, and that 14 strains isolated from the epithelium of the colon carcinoma have a colon tumor-onsetting effect in AKTC mice.然后从100人的粪便样品中鉴定出代谢性合成特殊胆汁酸（例如3-氧基-LCA和Allo-ISO-LCA）的细菌，发现这些细菌种类也代谢类固醇。

项目成果

腸内細菌による抗生物質耐性菌・ウィルス感染制御

肠道细菌控制抗生素耐药细菌和病毒感染

• 发表时间: 2021
• 作者: Nakazawa Yuga;Iinuma Hiromi;Iwashita Yoshihisa;Iwata Yoshiyuki;Cicek Ersin;Otani Masashi;Kawamura Naritoshi;Kitamura Ryo;Kondo Yasuhiro;Saito Naohito;Sue Yuki;Takeuchi Yusuke;Hasegawa Kazuo;Hayashizaki Noriyosu;Mibe Tsutomu;Morishita Takatoshi;Yasuda Hiro;本田賢也;本田賢也
• 通讯作者: 本田賢也

腸内細菌を標的とした疾患治療法の開発

针对肠道细菌的疾病治疗方法的开发

• 发表时间: 2021
• 作者: Katoh Takayuki;Suga Hiroaki;本田賢也
• 通讯作者: 本田賢也

Staphylococcus cohnii is a potentially biotherapeutic skin commensal alleviating skin inflammation

• DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109052
• 发表时间: 2021-04-27
• 期刊: CELL REPORTS
• 影响因子: 8.8
• 作者: Ito, Yoshihiro;Sasaki, Takashi;Honda, Kenya
• 通讯作者: Honda, Kenya

Targeted suppression of human IBD-associated gut microbiota commensals by phage consortia for treatment of intestinal inflammation

• DOI: 10.1016/j.cell.2022.07.003
• 发表时间: 2022-08-05
• 期刊: CELL
• 影响因子: 64.5
• 作者: Federici, Sara;Kredo-Russo, Sharon;Elinav, Eran
• 通讯作者: Elinav, Eran

Mining the gut microbiota and identifying effector microbes that causally affect the host physiology

挖掘肠道微生物群并识别对宿主生理机能产生因果影响的效应微生物

• 发表时间: 2021
• 作者: Sadanobu;Toshiyuki;本田賢也
• 通讯作者: 本田賢也