機能性副腎腫瘍のゲノム・エピゲノム解析とAIによる新規診断法の確立

利用功能性肾上腺肿瘤的基因组/表观基因组分析和人工智能建立新的诊断方法

基本信息

批准号：
19K18003
负责人：
米谷充弘
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kanazawa University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では機能性副腎腫瘍におけるステロイドホルモン過剰産生および腫瘍発生・進展機構に関して、エピジェネティク制御に着目して明らかにする。さらにゲノム・エピゲノム解析と臨床情報、画像情報を統合して、新たな機能性・良悪性の診断法の確立につなげる。2021年度はKCNJ5やPRKACAといった機能性副腎腫瘍に高頻度に変異が見られる遺伝子をターゲットとして、次世代シーケンサーを用いて解析を実施した。次世代シーケンサーでの解析により、副腎腫瘍に関してこれまで報告歴のある17遺伝子を対象として解析を実施した。結果として、機能性副腎腫瘍80例と非機能性副腎腫瘍13例の解析を実施した。機能性副腎腫瘍の中で、原発性アルドステロン症おいて67％、クッシング症候群において77％、褐色細胞腫において45％の症例でターゲットとした遺伝子の一つに変異を認めた。この結果は、各々の腫瘍において約30-50％にまだ未知の遺伝子変異を有している可能性を示唆している。また報告例のある複数の遺伝子変異を認める症例はなく、また同時に解析した非機能性副腎腫瘍には解析遺伝子には変異を認めなかった。この解析の中で大変興味深いことに、これまでに報告がある遺伝子ではあるが変異部位がこれまでに未報告である症例やホルモン産生特異的な遺伝子変異とホルモン過剰産生が一致していない症例が見出された。これらは新たな知見であり、2022年度以降に報告を予定している。また、遺伝子変異とエピゲノム異常の関連に関して評価するために、すでに確立しているパイロシークエンス法を用いた手法で解析していく準備を進めている。2021年度は副腎腫瘍に関して、筆頭著者として国際誌へ2報の論文報告を行い、今年度も原発性アルドステロン症を中心とした臨床論文2報を責任著者として国際誌に報告した。

在这项研究中，我们将阐明功能性肾上腺肿瘤中类固醇激素的过量产生以及肿瘤发生和进展的机制，重点关注表观遗传调控。此外，通过整合基因组/表观基因组分析、临床信息和图像信息，我们将建立新的功能性和良性/恶性诊断方法。 2021年，我们针对功能性肾上腺肿瘤中频繁突变的基因，例如KCNJ5和PRKACA，并使用下一代测序仪进行了分析。使用下一代测序仪，我们分析了先前报道的与肾上腺肿瘤相关的 17 个基因。结果，我们分析了 80 例功能性肾上腺肿瘤和 13 例无功能性肾上腺肿瘤。在功能性肾上腺肿瘤中，67%的原发性醛固酮增多症病例、77%的库欣综合征病例和45%的嗜铬细胞瘤病例的靶基因之一发现突变。这些结果表明，大约 30-50% 的每种肿瘤可能具有未知的基因突变。此外，没有发现已报道的多种基因突变的病例，并且在同时分析的无功能肾上腺肿瘤中所分析的基因中也没有发现突变。在该分析中，非常有趣的是，存在先前报告的基因的突变位点尚未报告的情况，以及发现激素产生特异性基因突变和激素过量产生不匹配的情况。这些都是新发现，计划于 2022 年或更晚发布。此外，为了评估基因突变与表观基因组异常之间的关系，我们正准备使用已经建立的焦磷酸测序方法进行分析。 2021年，我作为第一作者在国际期刊上发表了两篇有关肾上腺肿瘤的论文，今年我还作为第一作者发表了两篇有关原发性醛固酮增多症的临床论文，并在国际期刊上进行了报道。

项目成果

期刊论文数量（61）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Effect of potassium on DNA methylation of aldosterone synthase gene

钾对醛固酮合酶基因DNA甲基化的影响

DOI：
10.1097/hjh.0000000000002742
发表时间：
2021
期刊：
影响因子：
4.9
作者：
Takeda Yoshimichi;Demura Masashi;Wang Fen;Karashima Shigehiro;Yoneda Takashi;Kometani Mitsuhiro;Aomo Daisuke;Hashimoto Atsushi;Horike Shin;Meguro;Takeda Yoshiyu
通讯作者：
Takeda Yoshiyu

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