Genetic and molecular epidemiology study of GWAS-identified pancreatic cancer-associated GP2 gene

GWAS鉴定的胰腺癌相关GP2基因的遗传和分子流行病学研究

• 批准号: 21H03186
• 负责人: 林 櫻松
• 金额: $ 10.48万
• 依托单位: Aichi Medical University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H03186/
• 关键词: 膵がん; GP2; GWAS; SNP; ゲノムワイド関連解析; 遺伝子多型; ファインマッピング

アメリカ国立がん研究所(NCI)との共同研究で、欧米人を対象とした膵がん全ゲノム関連解析(GWAS)のサマリーデータを用いて、GP2遺伝子領域のバリアントと膵がんリスクの関連を検討した。その結果、ヨーロッ人集団ではrs78193826のマイナーアレルTの頻度が0.01％よりも低いため、本遺伝子型に関する情報が得られなかった。さらに、rs78193826と連鎖不平衡関係にあるほかのバリアント（rs117267808, rs73541251など）について検討したところ、いずれも膵がんリスクと有意な関連が認められなかった(P>0.05)。これらの結果より、GP2領域のバリアントは、日本人を含むアジア人に特異的なバリアントであることが示唆された。東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)とのGWAS共同研究で、膵がん症例500人、がん以外の健常人コントロール17551人について、SNPジェノタイピングとインピュテーション（遺伝子型情報の補完）が完了した。SAIGEを用いて、性別や主成分を補正した上でSNPと膵がんリスクの関連を評価した。その結果、膵がんリスクと有意（ゲノムワイド有意水準：P<0.00000005)に関連するSNPは同定されなかったものの、これまでのGWASで報告されている1番、9番、16番染色体のバリアントと膵がんリスクの関連は確認できた。来年度は、より詳細な解析や考察を行う予定である。

在与美国国家癌症研究所 (NCI) 的一项联合研究中，我们使用了欧洲和美洲人群胰腺癌全基因组关联研究 (GWAS) 的汇总数据，以发现 GP2 基因区域的变异与胰腺癌风险之间的关联。我们考虑过。结果，由于rs78193826的次要等位基因T在欧洲人群中的频率低于0.01%，因此无法获得有关该基因型的信息。此外，当我们检查与rs78193826连锁不平衡的其他变异（rs117267808、rs73541251等）时，没有发现与胰腺癌风险显着相关（P>0.05）。这些结果表明 GP2 区域的变异是亚洲人特有的，包括日本人。在与东北医疗大银行组织 (ToMMo) 的一项 GWAS 联合研究中，对 500 例胰腺癌病例和 17,551 名健康非癌症对照完成了 SNP 基因分型和插补（基因型信息的补充）。在调整性别和主要成分后，我们使用 SAIGE 评估了 SNP 与胰腺癌风险之间的关联。结果，虽然没有发现与胰腺癌风险显着相关的SNP（全基因组显着性水平：P<0.00000005），但之前GWAS中报道的1、9和16号染色体上的变异我们证实了胰腺癌之间的关联风险和胰腺癌风险。我们计划明年进行更详细的分析和考虑。

项目成果

Serum Soluble Fas Levels and Incidence of Liver Cancer in Nested Case-Control Study.

巢式病例对照研究中血清可溶性 Fas 水平与肝癌发病率。

• 发表时间: 2023
• 作者: Adachi Y; Nojima M; Mori M; Kubo T; Akutsu N; Sasaki Y; Nakase H; Lin Y; Kurozawa Y; Wakai K; Tamakoshi A;Japan Collaborative Cohort Study.
• 通讯作者: Japan Collaborative Cohort Study.

Effects of gene-lifestyle interactions on obesity based on a multi-locus risk score: A cross-sectional analysis

基于多位点风险评分的基因-生活方式相互作用对肥胖的影响：横断面分析

• DOI: 10.1371/journal.pone.0279169
• 发表时间: 2023
• 影响因子: 3.7
• 作者: Nakamura Sho;Fang Xuemin;Saito Yoshinobu;Narimatsu Hiroto;Ota Azusa et al.
• 通讯作者: Ota Azusa et al.

Prevalence estimates of Helicobacter species infection in pancreatic and biliary tract cancers.

胰腺癌和胆道癌中螺杆菌感染的患病率估计。

• DOI: 10.1111/hel.12866
• 发表时间: 2022
• 影响因子: 4.4
• 作者: Osaki T; Lin Y; Sasahira N; Ueno M; Yonezawa H; Hojo F; Okuda M; Matsuyama M; Sasaki T; Kobayashi S; Tezuka S; Tanaka K; Dan N; Kuruma S; Egawa N; Kamiya S; Kikuchi S.
• 通讯作者: Kikuchi S.

Glycoprotein 2 in health and disease: lifting the veil.

糖蛋白 2 在健康和疾病中的作用：揭开面纱。

• DOI: 10.1186/s41021-021-00229-8
• 发表时间: 2021
• 作者: Lin Y; Nakatochi M; Sasahira N; Ueno M; Egawa N; Adachi Y; Kikuchi S.
• 通讯作者: Kikuchi S.