口腔扁平上皮癌網羅的遺伝子解析に基づく 免疫チェックポイント阻害薬感受性の評価
基于口腔鳞癌综合基因分析的免疫检查点抑制剂敏感性评价
基本信息
- 批准号:19K19245
- 负责人:
- 金额:$ 2.66万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-01 至 2022-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
日本人の口腔扁平上皮癌(OSCC:oral squamous cell carcinoma)の遺伝学的特徴を解明することを目的とし、76遺伝子を対象に次世代シーケンサーによる体細胞変異解析を行った。その結果、TP53は最も高頻度に変異を認める遺伝子であることが分かった。また、変異のほとんどはTP53のDNA結合ドメインに集中しており、TP53タンパクに機能的に有害な影響を及ぼす可能性が予測された。TP53変異による影響を解明することを目的として、TP53変異を認めた症例に対し、次世代シーケンサーを用いて、mRNAレベルで発現アレルの解析を行った。DNAレベルで認めた変異は、mRNAレベルで発現が認められなかった。この理由として、同一症例であっても病変の部位によって変異を有さない可能性や、遺伝子発現の調節や異常などが考えられるが、明らかではない。
为了阐明日语中口服鳞状细胞癌(OSCC)的遗传特征,我们使用了76个基因的下一代测序仪进行了体细胞突变分析。结果,发现TP53是最常见的突变基因。此外,大多数突变集中在TP53的DNA结合结构域中,并且可以预测它们可能对TP53蛋白具有功能有害的影响。为了阐明TP53突变的作用,使用下一代测序仪在TP53突变的情况下在mRNA水平上分析了表达等位基因。在DNA水平上观察到的突变未在mRNA水平上表达。原因是,即使在同一情况下,也可能没有突变,具体取决于病变的部位,并且该基因表达受到调节和异常。但是,这尚不清楚。
项目成果
期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Analysis of gene expression profile for oral squamous cell carcinoma.
口腔鳞状细胞癌基因表达谱分析。
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:金子児太郎;宮本洋一;赤池孝章;杉崎リサ;小川 隆;近津大地;上條竜太郎;大澤 侑子
- 通讯作者:大澤 侑子
Somatic mutations in oral squamous cell carcinomas in 98 Japanese patients and their clinical implications
98 例日本口腔鳞状细胞癌患者的体细胞突变及其临床意义
- DOI:10.1016/j.ctarc.2021.100456
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yuko Osawa ;Ken-Ichi Aoyama ;Kazuyoshi Hosomichi ;Masahiro Uchibori ;Atsushi Tajima ;Minoru Kimura ;Yoshihide Ota
- 通讯作者:Yoshihide Ota
Whole- exome sequence analysis for Japanese oral squamous cell carcinomas.
日本口腔鳞状细胞癌的全外显子组序列分析。
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Kitajima Hiroaki;Iwai Toshinori;Yajima Yasuharu;Mitsudo Kenji;大澤 侑子
- 通讯作者:大澤 侑子
共 3 条
- 1
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