特発性低身長の網羅的遺伝子解析による新規責任遺伝子の探索

通过综合遗传分析寻找导致特发性身材矮小的新基因

• 批准号: 19K17287
• 负责人: 島 彦仁
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K17287/
• 关键词: 低身長; 遺伝子解析; 網羅的遺伝子解析; 低身長; 遺伝子解析; 網羅的遺伝子解析

本研究において、2021年については、本学倫理委員会において承認された計画書（成長障害における遺伝的要因の探索、東北大学大学院 医学系研究科倫理委員会 2019-1-016号）にそって患者コホートの構築、遺伝子解析を進めた。患者コホートの構築においては、昨年度に引き続き基準を満たす患者を抽出した。順次、各患者に対して研究について説明を行い、両親及び患者本人のインフォームドコンセント又はアセントを取得した患者からは患者のスケジュールされた治療のために必要な血液検査のタイミングで遺伝子検査用の血液の提供を受けた。遺伝子解析を行う研究計画であることから研究参加にあたっては両親などで十分に検討を頂くように説明している。遺伝子解析については、上記で提供をうけた検体を順次全エクソームシークエンス、また本年度からは全ゲノムシークエンスを行った。2022年度まで約25名の患者から研究参加に同意いただき、うち約20名の患者でwet解析はを終了した。なお、wet解析の終了したデータをより効率的かつ正確に遺伝子変化を同定することを目的に、東北大学メディカルメガバンクの管理するスーパーコンピューターを活用し、パイプラインを改良している。なお、SARS-CoV-2の流行に伴い、低身長患者の受診が抑制された影響のため、本研究立案時点よりも低身長患者の受診が大きく減少しており、患者コホートの構築に大きな影響が出ている。現在、上記の２つの取り組みを進め、低身長の新規責任遺伝子の探索を進めているところである。

在这项研究中，在2021年，我们根据大学伦理委员会批准的计划进行了一系列患者和遗传分析（探索生长障碍的遗传因素，东北大学医学研究生院，第2019-1-016号）。在患者队列的建设中，符合标准的患者与去年一样被选中。逐渐解释了每个患者的研究，并在父母获得知情同意或上升的患者中，在患者预定治疗所需的血液检查时间内为患者本身接受血液进行基因检测。由于这是一项涉及遗传分析的研究计划，因此解释是父母和其他人在参与研究时应彻底考虑。关于遗传分析，上面提供的标本是依次执行的整个外显子组序列，从今年开始，进行了整个基因组序列。直到2022财年，大约25名患者同意参加研究，并且在大约20名患者中完成了湿分析。此外，为了在湿分析完成的数据上更有效，更准确地识别遗传变化，通过使用Toohoku University Medial Megabank管理的超级计算机，可以改善管道。此外，由于SARS-COV-2爆发的影响，自计划这项研究的时间以来，参观较短患者的患者人数已大大减少，该研究对患者队列的构建产生了重大影响。目前，我们正在进行上述两个倡议，目前正在寻找新的责任基因，以提高身材矮小。