便プロテオーム解析を用いた小児外科疾患のトランスレーショナルリサーチ

利用粪便蛋白质组分析进行儿科外科疾病的转化研究

• 批准号: 20K20469
• 负责人: 藤代 準
• 金额: $ 16.64万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20K20469/
• 关键词: 便; プロテオーム解析; 胆道閉鎖症; 早期診断バイオマーカー; 胎便; 腸内細菌叢; 急性虫垂炎; ヒルシュスプルング病; 尿; プロテオーム; 新生児; 小児外科; 壊死性腸炎; 細菌メタゲノム解析

①かずさDNA研究所と共同して開発したData-independent acquisition massspectrometry（DIA）ベースの便プロテオーム解析を利用した研究を進めている。①-1: 胆道閉鎖症（BA）の早期診断と早期治療を目指し非侵襲的に採取可能な便を利用してBAの早期診断バイオマーカーの探索研究を継続している。本研究成果は2020年に国際誌に発表し2021年度は国内外の学会で多く発表し評価を得た。2022年度も継続して検体収集を行なっている。また葛西手術後の腸内環境に関する解析も進めている。①-2: 胎便中に含まれるヒト由来タンパク質に着目して新生児期に発症する消化管疾患のバイオマーカー探索および病因の解明を目的とした胎便研究に着手している。2019年から2021年にかけての約2年間に東京大学医学部附属病院で259症例の胎便を収集しプロテオーム解析を行い胎便中に存在する5,370種類のヒト由来タンパク質の検出に成功した。本研究では、詳細な臨床データとともに統計学的手法を用いて多角的に解析を行った（unpublished data）。本研究成果は2022年度の学会で発表し現在論文作成中である。①-3: 新生児期にストーマ造設を行った児に関して遠位側腸管へのストーマ排液注入（MFR: mucosal fistula refeeding）の効果についての研究を進めている。本研究成果は2021年度、2022年度の学会で発表し現在論文作成中である。② 腸内細菌叢解析研究では理化学研究所と連携して進めている。②-1 筑波大学との共同研究において小児急性虫垂炎患児の唾液、便、虫垂内容液を採取し解析を行った。本研究成果は2021年度、2022年度の学会で発表し既に国際誌へ掲載された。②-2 Hirschsprung病類縁疾患の腸内細菌叢解析を進めている。

①我们正在使用与 Kazusa DNA 研究所合作开发的基于数据独立采集质谱 (DIA) 的粪便蛋白质组分析进行研究。 ①-1：以胆道闭锁（BA）的早期诊断和早期治疗为目标，我们正在继续利用可非侵入性采集的粪便样本，对用于早期诊断BA的生物标志物进行探索性研究。该研究成果于2020年在国际期刊上发表，2021年在国内外多个学术会议上发表并获得好评。样本采集将于 2022 年继续进行。我们还在对葛西手术后的肠道环境进行分析。 ①-2：以胎便中含有的人类来源蛋白质为中心，开始对胎便进行研究，旨在寻找生物标志物并阐明新生儿期胃肠道疾病的病因。从2019年到2021年的两年时间里，我们从东京大学医院的259例病例中收集了胎便并进行了蛋白质组分析，成功检测了胎便中存在的5,370种人类来源的蛋白质。在本研究中，我们利用详细的临床数据和统计方法（未发表的数据）进行了多方面的分析。这项研究的结果将在2022年的学术会议上公布，目前正在准备一篇论文。 ①-3：我们正在研究粘膜瘘再喂养（MFR）对新生儿期造口婴儿的影响。这项研究的结果将在2021年和2022年的学术会议上发表，目前正在准备一篇论文。 ② 与RIKEN合作进行肠道菌群分析研究。 ②-1 在与筑波大学的联合研究中，我们收集并分析了急性阑尾炎儿童的唾液、粪便和阑尾液。该研究成果已在2021年和2022年的学术会议上发表，并已在国际期刊上发表。 ②-2 我们正在进行先天性巨结肠相关疾病的肠道菌群分析。

项目成果

A Comprehensive Microbial Analysis of Pediatric Patients with Acute Appendicitis

儿科急性阑尾炎患者的综合微生物分析

• DOI: 10.1016/j.jmii.2023.03.006
• 发表时间: 2023
• 作者: 1.Aiyoshi T; Kakihara T; Watanabe E; Tanaka N; Ogata Y; Masuoka H; Kurokawa R; Fujishiro J; Masumoto K; Wataru S.
• 通讯作者: Wataru S.

Discovery of candidate stool biomarker proteins for biliary atresia using deep proteome analysis by data-independent acquisition mass spectrometry(The Best Asian Poster Award)

通过数据独立采集质谱进行深度蛋白质组分析，发现胆道闭锁的候选粪便生物标志物蛋白（最佳亚洲海报奖）

• 发表时间: 2021
• 作者: Eiichiro Watanabe; Yusuke Kawashima; Wataru Suda; Tomo Kakihara; Shinya Takazawa; Daisuke Nakajima; Ren Nakamura; Akira Nishi; Kan Suzuki; Osamu Ohara; Jun Fujishiro.
• 通讯作者: Jun Fujishiro.

DIAGNOSIS METHOD, DIAGNOSIS KIT AND TREATMENT METHOD FOR BILIARY ATRESIA

胆道闭锁的诊断方法、诊断试剂盒和治疗方法

• 发表时间: 2020

Discovery of Candidate Stool Biomarker Proteins for Biliary Atresia Using Proteome Analysis by Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry

通过数据独立采集质谱法进行蛋白质组分析，发现胆道闭锁的候选粪便生物标志物蛋白

• DOI: 10.3390/proteomes8040036
• 发表时间: 2020-11-27
• 期刊: Proteomes
• 影响因子: 3.3
• 作者: Watanabe E;Kawashima Y;Suda W;Kakihara T;Takazawa S;Nakajima D;Nakamura R;Nishi A;Suzuki K;Ohara O;Fujishiro J
• 通讯作者: Fujishiro J

胎便に含まれるヒト由来タンパク質に関する網羅的タンパク質解析研究

胎便中人源蛋白的综合蛋白分析研究

• 发表时间: 2022
• 作者: 設楽佳彦;渡辺栄一郎;柿原知;木本豪;向井丈雄;杉本美紀;伊藤淳;井上毅信;鹿嶋晃平;垣内五月;永松健;藤代準;高橋尚人
• 通讯作者: 高橋尚人