ポリジェニックリスクスコアを用いた自殺リスクの予測と遺伝学的解明

使用多基因风险评分预测和遗传阐明自杀风险

• 批准号: 21H02852
• 负责人: 菱本 明豊
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Kobe University (2023)Yokohama City University (2021-2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21H02852/
• 关键词: 自殺; GWAS; ポリジェニックリスクスコア; ゲノムワイド関連解析; 自殺; GWAS; ポリジェニックリスクスコア; ゲノムワイド関連解析

自殺についての遺伝学的知見の獲得は、自殺者試料の収集が困難なため他精神科領域に比して世界的に遅れていた。申請者らは国内唯一・単一機関として世界最大規模の自殺者DNA試料とゲノムワイド関連解析（genome-wide association study; GWAS）データを有し、GWASデータから算出できる個人ごとの自殺ポリジェニックリスクスコア（polygenic risk score; PRS）が、個人の自殺リスクを予測できる可能性を見出した。本研究では、自殺者/自殺未遂者試料の追加GWASを実施し計1,800例の日本人自殺者/自殺未遂者（及び20,000例の非自殺者）のGWASデータを用いることで、①日本人集団において自殺PRSがどの程度の確度で自殺リスクを予測できるか、②アジア人種において各精神疾患や喫煙・飲酒・身長・体重などの様々なヒト表現型がどの程度自殺と遺伝的リスクを共有しているか、の2点を精細に検討する。R4年度末までに約550例の自殺関連試料の追加収集・大部分のGWASデータ取得を実施し、BBJの非自殺者5,000例のコントロールデータとの統合中であり、最終年度の解析に向けて順調にサンプルサイズのスケールアップ・準備を進めることができた。また予備的解析結果において、白人集団におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度に比して、アジア人種におけるうつ病・統合失調症と自殺との遺伝的リスク共有度が弱い可能性を見出している。

与其他精神病领域相比，由于难以收集自杀样本，与其他精神病领域相比，全世界的遗传知识的获取已被延迟。作为日本唯一的单一机构，申请人拥有世界上最大的自杀性DNA样本和全基因组协会研究（GWAS）数据，并发现从GWAS数据中计算出的个体的多基因风险评分（PRS）可以预测个人自杀的风险。在这项研究中，我们将使用GWAS数据总共进行1,800起日本自杀/悬架尝试，并考虑两点详细的点：1）在日本人口中可以预测自杀PRS的可能性，以及2）各种人类表型的程度，例如精神疾病，吸烟，饮酒，身高，身高，体重，体重，属于遗传性的风险，与自杀的属于自杀的风险。到FY4结束时，收集了大约550个与自杀相关的样本，并获取了大多数GWAS数据，并将数据与来自BBJ的5,000个非自杀病例的对照数据集成在一起，并成功地扩大了样本量并制备了最终年份分析。此外，初步分析的结果发现，亚洲种族中抑郁症，精神分裂症和自杀之间的遗传风险共享可能比白人人口中抑郁症，精神分裂症和自杀之间的遗传风险分担较弱。