Escherichia albertiiの食肉汚染と病原性発現機構に関する研究

艾伯氏大肠埃希菌肉类污染及致病性表达机制研究

基本信息

  • 批准号:
    20K18918
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.66万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

昨年度実施した豚生体サンプル由来DNAを供試した試験では、口腔スワブを含む生体試料や水飲み場のスワブを含む環境試料からEscherichia albertiiが検出された。そのため、R4年度は、さまざまな部位由来の市販豚内臓肉について、E. albertiiの汚染実態調査を実施した。その結果、複数の小売店で販売されていたレバーやホルモンなどからE. albertiiの遺伝子が検出され、その中のホルモンやタンから本菌が分離された。また、E. albertiiの病原因子の解析では、astA(腸管凝集付着性大腸菌耐熱性エンテロトキシン1をコードする遺伝子)について解析した。astAは、特に大腸菌において保有が確認されており、令和2年にはastA保有大腸菌を原因とする患者数2,958名の大規模な事例も報告され、注目された。astAは、細菌の染色体またはプラスミドにコードされており、配列の多様性(バリアント)が報告されている。これまでE. albertiiのastA保有についての詳細な報告がなかったため、過去に収集した集団食中毒事例由来株などのヒト由来株、動物由来株および食品由来株について解析した。その結果、供試した57株中散発下痢症由来の1株がastA特異的コンベンショナルPCR法陽性であった。遺伝子シーケンスによって配列を特定したところ、配列が不完全であり、astAとしては機能していないことが予想された。そのため、今回調査した株に関しては、E. albertiiの病原性にastAは重要ではないことが示唆された。さらに、集団食中毒事例由来株、散発下痢症由来株および食品由来株の一部について全ゲノム配列取得用のライブラリーを調製し、Illumina MiniSeqを用いて配列を取得した。当初はシーケンサーの稼働は外注する予定であったが、共通機器としてMiniSeqが整備されたため、その装置を活用した。
去年,在使用猪生物样本 DNA 进行的测试中,在包括口腔拭子在内的生物样本和包括饮水机拭子在内的环境样本中检测到了阿尔伯氏菌。因此,在R4年,我们对市售猪内脏各部位的艾伯氏菌污染情况进行了调查。结果,在多家零售店出售的肝脏和激素中检测到了阿尔伯氏菌基因,并从激素和舌头中分离出了细菌。此外,在分析艾伯特大肠杆菌的毒力因子时,我们分析了astA(编码肠凝固粘附性大肠杆菌热稳定肠毒素1的基因)。已证实astA在大肠杆菌中尤为普遍,2020年,因携带astA的大肠杆菌报道了一起涉及2,958名患者的大规模病例,引起关注。 astA 由细菌染色体或质粒编码,并且已报道序列多样性(变体)。由于目前还没有关于艾伯氏菌astA携带情况的详细报道,我们分析了人类来源的菌株,例如来自过去收集的大规模食物中毒病例的菌株、动物来源的菌株和食物来源的菌株。结果,所检测的 57 株菌株中,有 1 株源自散发性腹泻,astA 特异性常规 PCR 呈阳性。当通过基因测序鉴定该序列时,预测该序列是不完整的并且不能发挥astA的功能。因此,对于本次研究的菌株,表明astA对于艾伯特艾伯球菌的致病性并不重要。此外,我们还准备了用于获取部分来自大规模食物中毒病例、散发性腹泻病例和食物来源菌株的全基因组序列的文库,并使用 Illumina MiniSeq 获得了这些序列。最初,测序仪的操作计划外包,但由于 MiniSeq 可作为通用设备使用,因此使用了该设备。

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
食品からのEscherichia albertii検出のための特異的リアルタイムPCR法の検討
食品中艾氏埃希氏菌特异性实时荧光定量PCR检测方法的检验
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    新井沙倉;土井りえ;小西典子;尾畑浩魅;榊田希;甲斐明美;廣瀨昌平;工藤由起子
  • 通讯作者:
    工藤由起子
Escherichia albertii特異的リアルタイムPCR法の開発と鶏の保菌状況調査
艾氏大肠埃希菌特异性实时PCR方法的建立及鸡运输状况的调查
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    新井沙倉;大塚佳代子;小西典子;大岡唯祐;大屋賢司;大西貴弘;工藤由起子
  • 通讯作者:
    工藤由起子
Escherichia albertiiに適する選択増菌培地の開発
适用于艾伯氏埃希菌的选择性增菌培养基的研制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    廣瀬昌平;大屋賢司;新井沙倉;小椋容子;工藤由起子
  • 通讯作者:
    工藤由起子
市販カキのEscherichia albertii汚染実態調査
市售牡蛎中艾氏大肠杆菌污染情况调查
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    新井沙倉;山谷聡子;大塚佳代子;小西典子;尾畑浩魅;大岡唯祐;廣瀬昌平;工藤由起子.
  • 通讯作者:
    工藤由起子.
Development of a novel real-time polymerase chain reaction assay to detect Escherichia albertii in chicken meat.
开发一种新型实时聚合酶链反应测定法来检测鸡肉中的埃希氏菌。
  • DOI:
    10.1089/fpd.2022.0042
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.8
  • 作者:
    Sakura Arai;Tadasuke Ooka;Mizuha Shibata;Yuhki Nagai;Yuki Tokoi;Hiromi Nagaoka;Rika Maeda;Akihiko Tsuchiya;Yuka Kojima;Kenji Ohya;Takahiro Ohnishi;Noriko Konishi;Kayoko Ohtsuka;Yukiko Hara-Kudo.
  • 通讯作者:
    Yukiko Hara-Kudo.
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    2020
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    $ 2.66万
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    20K15613
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 2.66万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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